More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0159 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  60.13 
 
 
502 aa  635    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  60.13 
 
 
502 aa  635    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  61.1 
 
 
502 aa  635    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 
502 aa  1022    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  61.16 
 
 
509 aa  634  1e-180  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 
491 aa  526  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 
499 aa  521  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 
497 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 
489 aa  516  1.0000000000000001e-145  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
489 aa  509  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 
499 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 
505 aa  503  1e-141  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 
489 aa  504  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
493 aa  499  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 
496 aa  496  1e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
494 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
515 aa  494  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
515 aa  494  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
494 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
495 aa  492  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 
501 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 
501 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 
495 aa  489  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 
510 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  53.51 
 
 
499 aa  485  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
490 aa  488  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
488 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 
561 aa  482  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 
496 aa  483  1e-135  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 
508 aa  481  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
499 aa  479  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
499 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
499 aa  479  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
499 aa  479  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
499 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 
504 aa  479  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
499 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 
499 aa  479  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 
499 aa  480  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
499 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 
499 aa  477  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
513 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 
494 aa  478  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 
499 aa  476  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 
503 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 
512 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
513 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 
497 aa  473  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0280  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 
504 aa  474  1e-132  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0337786  hitchhiker  0.000160762 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 
631 aa  473  1e-132  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 
573 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 
509 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 
494 aa  470  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2331  lysyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
573 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 
502 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
573 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 
496 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
508 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
503 aa  464  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 
502 aa  462  1e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 
512 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 
647 aa  460  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2116  lysyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
511 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 
488 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 
512 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0406  lysyl-tRNA synthetase  50.32 
 
 
495 aa  460  9.999999999999999e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 
508 aa  457  1e-127  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 
489 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 
499 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_517  lysyl-tRNA synthetase (class II)  47.1 
 
 
498 aa  455  1e-127  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0551  lysyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 
498 aa  457  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0578  lysyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 
498 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.873191  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2848  lysyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 
501 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 
494 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 
501 aa  455  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 
489 aa  451  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  48.33 
 
 
491 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
523 aa  449  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 
507 aa  449  1e-125  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  46.19 
 
 
499 aa  449  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 
492 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
509 aa  449  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  46.77 
 
 
505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 
505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 
491 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 
505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1957  lysyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
513 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 
505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 
504 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 
505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
505 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0576  lysyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 
506 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0138803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  46.77 
 
 
505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 
505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  46.41 
 
 
771 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
1118 aa  446  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0480  lysyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
496 aa  444  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32202  predicted protein  46.68 
 
 
485 aa  444  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.334711  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
501 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>