More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0158 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0158  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 159 aa  308  2e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  59.86 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  58.45 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  54.97 
 
 		 156 aa  154  6e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  57.93 
 
 		 156 aa  150  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 159 aa  122  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  47.97 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  42.04 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  48.23 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  44.22 
 
 		 175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  44.9 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  41.96 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  43.54 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  45.27 
 
 		 156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  43.54 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  43.54 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  43.54 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  43.54 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  43.54 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  41.06 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  43.54 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  43.54 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  43.54 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  45.95 
 
 		 161 aa  111  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  43.84 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  42.48 
 
 		 157 aa  111  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  42.95 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  45.64 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  42.48 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  44.52 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  47.02 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  43.92 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  41.14 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  45.21 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  41.67 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  43.36 
 
 		 162 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  39.19 
 
 		 158 aa  107  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3557  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000103558  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  38.85 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  40.97 
 
 		 159 aa  105  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  40.4 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  40.4 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  42.47 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  42.57 
 
 		 158 aa  103  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  42.47 
 
 		 163 aa  103  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  35.67 
 
 		 162 aa  103  7e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  36.11 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  38.3 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  40.54 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1188  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00439545  normal  0.0602948 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  38.36 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0255  transcription elongation factor GreA  40.79 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000533555  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0951  GreA/GreB family elongation factor  39.86 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000196364  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  35.66 
 
 		 158 aa  101  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2089  transcription elongation factor GreA  38.41 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176469  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  35.66 
 
 		 158 aa  101  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3619  transcription elongation factor GreA  37.06 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  38.3 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  43.8 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  38.19 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  42.55 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1191  transcription elongation factor GreA  39.72 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1013  transcription elongation factor GreA  39.72 
 
 		 158 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.267207  normal  0.0365336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1078  transcription elongation factor GreA  39.72 
 
 		 158 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.949733  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1017  transcription elongation factor GreA  39.72 
 
 		 158 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.250708  hitchhiker  0.00044331 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  35.95 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  38.62 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2847  transcription elongation factor GreA  39.16 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000241028  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  39.1 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  42.48 
 
 		 158 aa  97.4  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  37.84 
 
 		 158 aa  97.1  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3252  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 158 aa  97.1  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0358868  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1115  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 158 aa  97.1  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.179374  hitchhiker  0.000000000961411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3294  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 158 aa  97.1  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00887513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3430  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 158 aa  97.1  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.910726  hitchhiker  0.000543609 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  44.03 
 
 		 158 aa  97.1  9e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  39.07 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  37.76 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002600  transcription elongation factor GreA  37.09 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000901215  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3073  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>