More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0117 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  100 
 
 
573 aa  1169    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  48.6 
 
 
577 aa  568  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  48.33 
 
 
571 aa  551  1e-156  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  47.82 
 
 
573 aa  548  1e-155  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  48.69 
 
 
577 aa  549  1e-155  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  41.02 
 
 
582 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  40.8 
 
 
589 aa  437  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0442  ABC transporter related  38.57 
 
 
618 aa  429  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000293437  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.62 
 
 
593 aa  421  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  37.13 
 
 
598 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  36.35 
 
 
583 aa  399  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.44 
 
 
583 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.66 
 
 
583 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  34.49 
 
 
583 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  34.49 
 
 
583 aa  395  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  34.62 
 
 
583 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.44 
 
 
583 aa  395  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.49 
 
 
583 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.49 
 
 
583 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  34.66 
 
 
583 aa  391  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.66 
 
 
583 aa  392  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  35.94 
 
 
611 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  35.18 
 
 
589 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  39 
 
 
541 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  35.2 
 
 
579 aa  376  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  35.04 
 
 
569 aa  375  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.81 
 
 
610 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.15 
 
 
586 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.04 
 
 
586 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  35.04 
 
 
586 aa  375  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  35.04 
 
 
586 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.04 
 
 
586 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  34.74 
 
 
584 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  35.88 
 
 
579 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.65 
 
 
581 aa  369  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  34.86 
 
 
586 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.86 
 
 
586 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  35.86 
 
 
585 aa  370  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.68 
 
 
586 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  35.18 
 
 
607 aa  369  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  37.14 
 
 
596 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2849  ABC transporter related  35.97 
 
 
595 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104844  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  35.65 
 
 
592 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  35.79 
 
 
598 aa  365  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  34.31 
 
 
591 aa  362  8e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  33.86 
 
 
586 aa  362  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  34.42 
 
 
586 aa  361  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  34.21 
 
 
583 aa  358  9.999999999999999e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0796  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.15 
 
 
588 aa  357  1.9999999999999998e-97  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000122761  hitchhiker  1.16631e-21 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0833  ABC transporter related  34.55 
 
 
612 aa  355  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0369945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  35.4 
 
 
569 aa  354  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3976  cyclic nucleotide-binding protein  35.75 
 
 
574 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4018  cyclic nucleotide-binding protein  35.75 
 
 
574 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.27 
 
 
548 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3059  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.98 
 
 
588 aa  352  7e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  37.9 
 
 
588 aa  350  3e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3161  ABC transporter related protein  32.11 
 
 
590 aa  349  9e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1150  ATPase  32.99 
 
 
600 aa  348  1e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.144978  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0484  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  31.93 
 
 
590 aa  349  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0491  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.11 
 
 
590 aa  348  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.961143  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0525  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  31.93 
 
 
590 aa  347  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0536  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  31.93 
 
 
590 aa  347  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.772204 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3167  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  31.93 
 
 
590 aa  347  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.564857  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  35.41 
 
 
650 aa  347  3e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00400  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  31.75 
 
 
590 aa  346  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00404  hypothetical protein  31.75 
 
 
590 aa  346  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4484  ABC transporter related  35.56 
 
 
581 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.85 
 
 
555 aa  345  1e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  35.13 
 
 
590 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  35.21 
 
 
594 aa  344  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4402  ABC transporter related  32.87 
 
 
584 aa  345  2e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0640  ATPase  33.79 
 
 
588 aa  341  2e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25348  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  34.78 
 
 
600 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  33.84 
 
 
593 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3080  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.63 
 
 
588 aa  339  7e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3041  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.63 
 
 
588 aa  339  9e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0563  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  30.7 
 
 
590 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0845  multidrug ABC transporter  34.62 
 
 
581 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0519  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  30.7 
 
 
590 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  31.23 
 
 
588 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.61208  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0503  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  30.7 
 
 
590 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0509  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  30.7 
 
 
590 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.726436 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  34.53 
 
 
580 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  33.39 
 
 
583 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3222  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.46 
 
 
588 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0500  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  30.7 
 
 
590 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.863518  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  32.82 
 
 
606 aa  337  5e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003564  ATP-binding component of a transport system  32.64 
 
 
579 aa  336  7e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09251  multidrug ABC transporter  34.42 
 
 
583 aa  336  7e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.532954  normal  0.0147253 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1309  ATPase  32.7 
 
 
598 aa  334  2e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.469057  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1107  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  32.01 
 
 
591 aa  334  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349072  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0916  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  31.23 
 
 
590 aa  334  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3253  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  30.88 
 
 
589 aa  332  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052561  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  35.1 
 
 
593 aa  332  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02524  hypothetical protein  32.29 
 
 
579 aa  330  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1251  cyclic nucleotide-binding protein  33.5 
 
 
607 aa  330  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10371  multidrug ABC transporter  34.62 
 
 
581 aa  330  4e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  33.16 
 
 
581 aa  329  8e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0256  multidrug ABC transporter  34.08 
 
 
583 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.607826  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3873  ABC transporter related  32.81 
 
 
623 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>