226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0085 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 		 374 aa  753    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  37.57 
 
 		 383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  35.37 
 
 		 381 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  40.57 
 
 		 388 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1735  nuclease SbcCD, D subunit  37.98 
 
 		 385 aa  280  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.053148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  37.63 
 
 		 385 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  34.57 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  36.6 
 
 		 385 aa  276  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  37.47 
 
 		 385 aa  276  5e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  36.36 
 
 		 385 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  36.1 
 
 		 385 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  36.1 
 
 		 385 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  36.1 
 
 		 385 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  36.1 
 
 		 385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  35.84 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  37.04 
 
 		 377 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  35.79 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  34.54 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  36.07 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  35.88 
 
 		 379 aa  259  5.0000000000000005e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  34.72 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  34.93 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  34.72 
 
 		 400 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  35.6 
 
 		 399 aa  257  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  35.2 
 
 		 381 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  35.2 
 
 		 381 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  34.67 
 
 		 381 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  34.67 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  35.37 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  37.04 
 
 		 375 aa  251  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  35.37 
 
 		 379 aa  247  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  34.92 
 
 		 380 aa  239  5e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  33.33 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3945  ATP-dependent dsDNA exonuclease protein  33.87 
 
 		 379 aa  228  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  31.58 
 
 		 381 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  36.51 
 
 		 373 aa  223  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  36.51 
 
 		 373 aa  223  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0520  nuclease SbcCD, D subunit  34.32 
 
 		 371 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  37.4 
 
 		 374 aa  220  3e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  32.52 
 
 		 386 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  30.71 
 
 		 385 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  29.24 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  29.07 
 
 		 375 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  30.91 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  27.72 
 
 		 382 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  33.13 
 
 		 379 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.85 
 
 		 418 aa  189  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.61 
 
 		 390 aa  186  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  29.49 
 
 		 390 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2390  exonuclease SbcD, putative  31.25 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.303161  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.75 
 
 		 386 aa  180  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  27.49 
 
 		 407 aa  178  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  31.83 
 
 		 392 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4361  nuclease SbcCD, D subunit  27.89 
 
 		 383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.820345  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  28.25 
 
 		 407 aa  171  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  31.52 
 
 		 372 aa  171  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0170  nuclease SbcCD, D subunit, putative  35.08 
 
 		 383 aa  169  6e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  26.79 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  27.83 
 
 		 409 aa  162  7e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  27.74 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  30.11 
 
 		 392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0123  nuclease SbcCD, D subunit  30.45 
 
 		 389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  30.94 
 
 		 393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01260  Exodeoxyribonuclease I subunit D  28.7 
 
 		 394 aa  145  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  30.69 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  26.42 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  25.77 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  30.13 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  26.57 
 
 		 409 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  29.41 
 
 		 407 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  29.41 
 
 		 407 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.55 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  26.93 
 
 		 410 aa  126  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  27.54 
 
 		 380 aa  124  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2025  nuclease SbcCD, D subunit  31.03 
 
 		 412 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  27.27 
 
 		 410 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3717  nuclease SbcCD, D subunit  31.03 
 
 		 412 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1557  nuclease SbcCD, D subunit  30.93 
 
 		 412 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436101  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  27.69 
 
 		 387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  27.46 
 
 		 409 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  25 
 
 		 382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  25.6 
 
 		 409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1585  nuclease SbcCD, D subunit  28.53 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583238  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  23.63 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  27.54 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  27.16 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  24.44 
 
 		 382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  27.41 
 
 		 408 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  28.25 
 
 		 408 aa  115  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3765  exonuclease SbcD  33.07 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0831731  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  26.26 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  30.42 
 
 		 409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  26.42 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  29.45 
 
 		 409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1715  exonuclease SbcD  33.07 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3776  nuclease SbcCD, D subunit  25.6 
 
 		 387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0285977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  29.88 
 
 		 406 aa  113  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  27.03 
 
 		 425 aa  113  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  23.72 
 
 		 390 aa  113  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  30.74 
 
 		 423 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>