214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0084 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  100 
 
 		 1039 aa  2029    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  32.26 
 
 		 1049 aa  437  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  30.19 
 
 		 1029 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  30.15 
 
 		 1018 aa  398  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  27.49 
 
 		 1020 aa  396  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  29.64 
 
 		 1018 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  30.73 
 
 		 1018 aa  391  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  29.7 
 
 		 1018 aa  393  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  29.32 
 
 		 1018 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  29.16 
 
 		 1029 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  29.04 
 
 		 1029 aa  389  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  28.79 
 
 		 1020 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  30.13 
 
 		 1029 aa  389  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  29.66 
 
 		 1018 aa  385  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  28.45 
 
 		 1029 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  28.36 
 
 		 1029 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  28.36 
 
 		 1029 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  30.2 
 
 		 1029 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  28.88 
 
 		 1029 aa  386  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  30.29 
 
 		 1018 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  28.36 
 
 		 1029 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  28.36 
 
 		 1029 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  29.98 
 
 		 1018 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  28.58 
 
 		 1018 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  28.42 
 
 		 1018 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  28.42 
 
 		 1018 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  28.69 
 
 		 1013 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  28.42 
 
 		 1018 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  27.06 
 
 		 1081 aa  365  3e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  31.07 
 
 		 1038 aa  359  9.999999999999999e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  27.63 
 
 		 1033 aa  328  4.0000000000000003e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  29.2 
 
 		 1009 aa  323  9.999999999999999e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  29.75 
 
 		 1030 aa  313  1e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  25.14 
 
 		 1024 aa  306  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  27.83 
 
 		 1059 aa  286  1.0000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  28.13 
 
 		 1011 aa  244  5e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  25.63 
 
 		 1091 aa  221  3.9999999999999997e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  27.29 
 
 		 1108 aa  214  7.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  29 
 
 		 1020 aa  211  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  23.97 
 
 		 1088 aa  209  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  40.53 
 
 		 1009 aa  192  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  40.53 
 
 		 1009 aa  192  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  42.38 
 
 		 1018 aa  188  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  41.64 
 
 		 1018 aa  188  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  48.96 
 
 		 953 aa  187  7e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  39.1 
 
 		 1017 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  25.44 
 
 		 995 aa  182  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  44.25 
 
 		 1018 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  49.7 
 
 		 1025 aa  172  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  39.34 
 
 		 881 aa  167  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  28.45 
 
 		 1047 aa  165  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  21.91 
 
 		 1046 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  39.46 
 
 		 1006 aa  164  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  21.73 
 
 		 1046 aa  164  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  21.64 
 
 		 1046 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  21.64 
 
 		 1046 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  21.64 
 
 		 1046 aa  162  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  29.76 
 
 		 1046 aa  157  7e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  25.88 
 
 		 995 aa  157  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  36.79 
 
 		 1291 aa  157  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  46.47 
 
 		 1046 aa  156  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  26.84 
 
 		 1091 aa  155  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  23.57 
 
 		 1032 aa  155  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  44.79 
 
 		 986 aa  154  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  39.41 
 
 		 986 aa  154  8.999999999999999e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  49.14 
 
 		 1058 aa  151  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  48.45 
 
 		 1191 aa  148  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  49.4 
 
 		 1023 aa  148  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  29.7 
 
 		 989 aa  148  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  38.1 
 
 		 962 aa  146  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  37.76 
 
 		 1022 aa  144  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  47.27 
 
 		 1249 aa  141  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  44.75 
 
 		 1009 aa  138  6.0000000000000005e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  24.18 
 
 		 1114 aa  132  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  21.69 
 
 		 1031 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  29.97 
 
 		 1223 aa  130  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  30.03 
 
 		 1230 aa  128  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  35.98 
 
 		 1165 aa  123  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  22.52 
 
 		 1019 aa  119  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  28.74 
 
 		 1219 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  24.06 
 
 		 906 aa  115  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  23.59 
 
 		 1265 aa  115  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  37.04 
 
 		 1172 aa  116  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1540  SMC domain protein  23 
 
 		 1182 aa  115  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  26.03 
 
 		 852 aa  116  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  36.51 
 
 		 1172 aa  115  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  45.27 
 
 		 1101 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  44 
 
 		 1224 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  35.62 
 
 		 1226 aa  114  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  42 
 
 		 1223 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  42 
 
 		 1226 aa  113  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  27.87 
 
 		 961 aa  112  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  26.3 
 
 		 852 aa  112  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  35.83 
 
 		 1214 aa  111  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  37.02 
 
 		 1214 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  24.21 
 
 		 1227 aa  110  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  41.94 
 
 		 1346 aa  110  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  36.46 
 
 		 1214 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  35.29 
 
 		 1214 aa  110  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  42.97 
 
 		 1234 aa  110  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>