142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0083 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0083  phosphodiesterase  100 
 
 
517 aa  1023    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.479038  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1160  phosphodiesterase  56.43 
 
 
510 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1293  phosphodiesterase  57.36 
 
 
517 aa  554  1e-156  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000703284  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0940  phosphodiesterase  58.16 
 
 
507 aa  533  1e-150  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000513456  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0962  phosphodiesterase  57.97 
 
 
507 aa  532  1e-150  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0148724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1475  metal dependent phosphohydrolase  52.8 
 
 
487 aa  503  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000182866  normal  0.981892 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1926  phosphodiesterase  53.96 
 
 
511 aa  498  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1644  phosphodiesterase  53.75 
 
 
511 aa  496  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1262  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  53.03 
 
 
509 aa  496  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0988  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  50.67 
 
 
521 aa  495  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.549745  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1625  phosphodiesterase  52.45 
 
 
508 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00284901  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3101  phosphodiesterase  50.29 
 
 
511 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0679097  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1919  phosphodiesterase  48.54 
 
 
512 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0169953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1091  metal dependent phosphohydrolase  52.46 
 
 
524 aa  487  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000612767  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1617  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  46.08 
 
 
510 aa  483  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000205751  hitchhiker  0.00000000000531756 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10740  metal dependent phosphohydrolase  45.17 
 
 
513 aa  478  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.462426  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1254  HDIG/KH domain-containing protein  49.42 
 
 
515 aa  478  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0168178  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1337  phosphodiesterase  46.96 
 
 
540 aa  475  1e-133  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127735  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0605  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  48.37 
 
 
522 aa  477  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11870  metal dependent phosphohydrolase  50.96 
 
 
514 aa  478  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000537836  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2430  phosphodiesterase  49.43 
 
 
520 aa  472  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3813  phosphodiesterase  49.06 
 
 
520 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0688282  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1191  phosphodiesterase  51.36 
 
 
518 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000197151  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0777  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  45.7 
 
 
517 aa  469  1.0000000000000001e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000796077  normal  0.068248 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1475  metal dependent phosphohydrolase  48.57 
 
 
515 aa  468  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0039808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3877  phosphodiesterase  49.06 
 
 
520 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1422  phosphodiesterase  49.43 
 
 
521 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.008621  normal  0.971465 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3104  phosphodiesterase  50.69 
 
 
516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000128005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3627  phosphodiesterase  49.06 
 
 
520 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3519  phosphodiesterase  49.06 
 
 
520 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3537  phosphodiesterase  49.06 
 
 
520 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3914  phosphodiesterase  49.06 
 
 
520 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00777631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3549  phosphodiesterase  49.05 
 
 
521 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000213332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3825  phosphodiesterase  49.05 
 
 
521 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3790  phosphodiesterase  49.06 
 
 
520 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195923 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3371  phosphodiesterase  48.16 
 
 
519 aa  464  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1081  metal dependent phosphohydrolase  50.39 
 
 
504 aa  462  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.075195  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1475  metal dependent phosphohydrolase  54.44 
 
 
512 aa  464  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.331031  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2086  phosphodiesterase  50.29 
 
 
518 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1061  phosphodiesterase  48.92 
 
 
513 aa  458  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000060823  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0798  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  53.47 
 
 
487 aa  459  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.164487  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07460  metal dependent phosphohydrolase  46.73 
 
 
525 aa  457  1e-127  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00487641  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0442  hypothetical protein  47.64 
 
 
532 aa  458  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0330  phosphodiesterase  45.02 
 
 
535 aa  457  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000340911  decreased coverage  0.00581399 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0856  phosphodiesterase  45.21 
 
 
535 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000301712  normal  0.0173757 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0953  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  45.19 
 
 
518 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2207  phosphodiesterase  46.46 
 
 
518 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2350  phosphodiesterase  44.64 
 
 
520 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201473  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0978  phosphodiesterase  45.35 
 
 
527 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0108049  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3293  phosphodiesterase  45.42 
 
 
533 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0524  metal dependent phosphohydrolase  46.99 
 
 
513 aa  447  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00240284  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0608  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  45.8 
 
 
520 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000412066  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0968  phosphodiesterase  45.42 
 
 
533 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00053282  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3711  phosphodiesterase  48.17 
 
 
510 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000469244  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1137  phosphodiesterase  45.14 
 
 
520 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0306  hypothetical protein  46.44 
 
 
535 aa  443  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.72936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1180  phosphodiesterase  46.23 
 
 
520 aa  443  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00430196  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0715  metal dependent phosphohydrolase  49.69 
 
 
516 aa  444  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.352371  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1372  phosphodiesterase  50.52 
 
 
519 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800868  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0585  phosphodiesterase  47.07 
 
 
519 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1346  phosphodiesterase  50.52 
 
 
519 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.66517  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2598  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  45.81 
 
 
516 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000056493  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1490  metal dependent phophohydrolase  45.42 
 
 
527 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1184  phosphodiesterase  47.84 
 
 
519 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.105071 
 
 
-
 
NC_002936  DET1608  phosphodiesterase  45.03 
 
 
527 aa  435  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.92092  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2159  phosphodiesterase  48.49 
 
 
531 aa  436  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2578  metal dependent phosphohydrolase  48.55 
 
 
520 aa  437  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.102064  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3312  phosphodiesterase  43.96 
 
 
521 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.924608  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1354  phosphodiesterase  45.42 
 
 
527 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3291  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  44.89 
 
 
523 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0260994  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1120  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  48.35 
 
 
537 aa  433  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520277  normal  0.168608 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0567  metal dependent phosphohydrolase  47.13 
 
 
509 aa  433  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3500  phosphodiesterase  46.86 
 
 
521 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000584399  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2694  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  44.72 
 
 
527 aa  434  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1693  phosphodiesterase  43.98 
 
 
519 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00893236  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1425  metal dependent phosphohydrolase  48.07 
 
 
514 aa  431  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.340697  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1724  phosphodiesterase  46.1 
 
 
518 aa  430  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1490  metal dependent phosphohydrolase  50.58 
 
 
491 aa  430  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.355219  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1100  phosphodiesterase  44.21 
 
 
521 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000238727  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0936  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  45.21 
 
 
530 aa  431  1e-119  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1558  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  47.22 
 
 
509 aa  429  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2218  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  46.15 
 
 
502 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0853  phosphodiesterase  50.32 
 
 
519 aa  424  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.726014  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0859  metal dependent phosphohydrolase  47.58 
 
 
587 aa  420  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0744  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  46.35 
 
 
591 aa  421  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2017  YmdA/YtgF protein  46.78 
 
 
546 aa  416  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.855551  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4793  phosphodiesterase  47.9 
 
 
509 aa  417  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0108516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3248  metal dependent phosphohydrolase  48.31 
 
 
480 aa  418  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0237  hypothetical protein  46.3 
 
 
509 aa  414  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0805  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  46.14 
 
 
501 aa  413  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0828  phosphodiesterase  43.58 
 
 
517 aa  412  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.894152  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0615  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  47.14 
 
 
558 aa  409  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22485  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0007  phosphodiesterase  43.24 
 
 
523 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0813303  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0162  hypothetical protein  42.86 
 
 
562 aa  410  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.183423  normal  0.57312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1583  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.47 
 
 
560 aa  411  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1427  metal dependent phophohydrolase  46.92 
 
 
588 aa  411  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7243  phosphodiesterase  43.73 
 
 
521 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3523  metal dependent phosphohydrolase  46.51 
 
 
646 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.555023  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1391  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  52.45 
 
 
588 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0559611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0114  metal dependent phosphohydrolase  43.82 
 
 
520 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>