111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0082 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  100 
 
 
156 aa  307  4e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  54.47 
 
 
129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  43.05 
 
 
150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  40.88 
 
 
161 aa  98.2  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  40.15 
 
 
161 aa  94.7  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  37.41 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  32.7 
 
 
271 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  32.21 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  30 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  32.41 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  30.67 
 
 
170 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  30.67 
 
 
269 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  34.69 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  32.37 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  29.79 
 
 
210 aa  64.7  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  28.78 
 
 
214 aa  64.3  0.0000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  34.04 
 
 
212 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  33.67 
 
 
183 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  33.33 
 
 
212 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  33.67 
 
 
183 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  30.28 
 
 
270 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  30.14 
 
 
228 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  29.58 
 
 
270 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  29.17 
 
 
214 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  29.58 
 
 
270 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  29.58 
 
 
270 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  29.58 
 
 
270 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  30.5 
 
 
225 aa  61.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  30.87 
 
 
206 aa  60.8  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  29.58 
 
 
270 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  29.58 
 
 
270 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  31.47 
 
 
207 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  28.57 
 
 
214 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  29.58 
 
 
270 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  28.17 
 
 
270 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  28.17 
 
 
270 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  29.37 
 
 
221 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  29.8 
 
 
176 aa  58.5  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  27.86 
 
 
161 aa  57.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  33.09 
 
 
198 aa  58.2  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  27.52 
 
 
253 aa  57.4  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0412  recombination regulator RecX  24.65 
 
 
258 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  30 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  26.81 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  28.57 
 
 
198 aa  55.1  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  31.76 
 
 
151 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  29.86 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  26.76 
 
 
270 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  31.96 
 
 
178 aa  53.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  31.21 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  32.56 
 
 
191 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  28.57 
 
 
257 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  26.38 
 
 
192 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  27.34 
 
 
271 aa  52  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  28.76 
 
 
202 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  32 
 
 
264 aa  52.4  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  29.86 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1927  recombination regulator RecX  28.57 
 
 
272 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1961  recombination regulator RecX  28.57 
 
 
272 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  29.2 
 
 
216 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  29.25 
 
 
163 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  29.79 
 
 
179 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  30.68 
 
 
184 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  28.87 
 
 
217 aa  50.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  25.36 
 
 
220 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  28.99 
 
 
201 aa  48.9  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  28.57 
 
 
267 aa  48.1  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  29.85 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  25.87 
 
 
162 aa  48.1  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  28.37 
 
 
153 aa  48.1  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1474  regulatory protein RecX  27.22 
 
 
217 aa  48.1  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000363384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  30.77 
 
 
152 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2407  putative regulatory protein RecX  27.14 
 
 
171 aa  47.4  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.457695  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  27.81 
 
 
163 aa  47.4  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  24.18 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  28.08 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  29.36 
 
 
338 aa  47  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1119  regulatory protein RecX  31.58 
 
 
188 aa  46.6  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  26.6 
 
 
254 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1491  regulatory protein RecX  29.57 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512381  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  28.89 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1022  regulatory protein RecX  28.15 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1304  recombination regulator RecX  30.08 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  25.68 
 
 
199 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  25.18 
 
 
163 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  25.89 
 
 
217 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  33.33 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0285  hypothetical protein  28.1 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.315039  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  26.36 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  28.57 
 
 
174 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  26.72 
 
 
226 aa  44.3  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  24.34 
 
 
186 aa  44.3  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  29.7 
 
 
202 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  26.28 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  23.4 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  25.95 
 
 
220 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  34.52 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  26.12 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  25.93 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  29.9 
 
 
195 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>