More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0077 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  40.72 
 
 		 892 aa  642    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  44.42 
 
 		 890 aa  741    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  100 
 
 		 896 aa  1806    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  47.97 
 
 		 893 aa  822    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  39.41 
 
 		 892 aa  635    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  48.25 
 
 		 893 aa  816    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  45.95 
 
 		 898 aa  754    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  39.96 
 
 		 892 aa  636    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  38.82 
 
 		 891 aa  634  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  39.19 
 
 		 892 aa  634  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  39.26 
 
 		 891 aa  634  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  39.69 
 
 		 936 aa  634  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  40.02 
 
 		 903 aa  630  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2534  DNA polymerase I  40 
 
 		 926 aa  627  1e-178  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  39.98 
 
 		 903 aa  617  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  39.23 
 
 		 892 aa  618  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  39.57 
 
 		 928 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  39.57 
 
 		 928 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  39.57 
 
 		 928 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  38.64 
 
 		 888 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  38 
 
 		 924 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  38.41 
 
 		 936 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  39.57 
 
 		 928 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  37.51 
 
 		 939 aa  615  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  39.57 
 
 		 928 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  39.57 
 
 		 928 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  39.57 
 
 		 928 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  39.57 
 
 		 928 aa  613  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  38.33 
 
 		 926 aa  611  1e-173  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  38.69 
 
 		 928 aa  609  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  40.55 
 
 		 896 aa  609  1e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  37.24 
 
 		 979 aa  610  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  37.87 
 
 		 899 aa  611  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  39.46 
 
 		 928 aa  610  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  37.87 
 
 		 899 aa  611  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  38.3 
 
 		 936 aa  606  9.999999999999999e-173  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  39.2 
 
 		 926 aa  607  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  38.56 
 
 		 929 aa  607  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  38.89 
 
 		 945 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  37.72 
 
 		 915 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  39.03 
 
 		 928 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  40.02 
 
 		 870 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  37.87 
 
 		 933 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  36.76 
 
 		 946 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  38.06 
 
 		 924 aa  601  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  39.03 
 
 		 928 aa  602  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  39.03 
 
 		 928 aa  602  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  40.4 
 
 		 896 aa  602  1e-170  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  38.05 
 
 		 939 aa  599  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  39.01 
 
 		 908 aa  600  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  38.64 
 
 		 928 aa  601  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  38.57 
 
 		 934 aa  600  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  39.03 
 
 		 928 aa  602  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  38.47 
 
 		 951 aa  602  1e-170  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  38.62 
 
 		 912 aa  599  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  39.03 
 
 		 928 aa  602  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  38.3 
 
 		 893 aa  601  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  38.12 
 
 		 926 aa  598  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  38.57 
 
 		 950 aa  598  1e-169  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  38.12 
 
 		 926 aa  598  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  38.85 
 
 		 916 aa  597  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  38.12 
 
 		 926 aa  598  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  37.63 
 
 		 941 aa  598  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  39.35 
 
 		 930 aa  598  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  38.13 
 
 		 923 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  38.24 
 
 		 923 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  39.07 
 
 		 939 aa  598  1e-169  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  38.12 
 
 		 926 aa  598  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  38.77 
 
 		 902 aa  596  1e-169  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  38.23 
 
 		 929 aa  597  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  38.22 
 
 		 895 aa  597  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  38.32 
 
 		 946 aa  598  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  37.51 
 
 		 940 aa  598  1e-169  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  38.22 
 
 		 906 aa  595  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  39.01 
 
 		 944 aa  595  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  38.77 
 
 		 902 aa  595  1e-168  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  38.13 
 
 		 923 aa  595  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  38.13 
 
 		 932 aa  594  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  37.76 
 
 		 911 aa  594  1e-168  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  39.58 
 
 		 878 aa  594  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  37.71 
 
 		 934 aa  595  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  35.22 
 
 		 935 aa  593  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  38.13 
 
 		 932 aa  593  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  38.64 
 
 		 943 aa  595  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  38.75 
 
 		 902 aa  595  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  37.34 
 
 		 943 aa  592  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  38.13 
 
 		 932 aa  594  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  36.85 
 
 		 946 aa  592  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  39.06 
 
 		 934 aa  591  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  38.92 
 
 		 930 aa  589  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  36.56 
 
 		 937 aa  589  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  37.91 
 
 		 904 aa  590  1e-167  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  38.03 
 
 		 939 aa  589  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  36.56 
 
 		 937 aa  592  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  37.45 
 
 		 942 aa  589  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  36.38 
 
 		 924 aa  586  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  37.77 
 
 		 926 aa  586  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  37.67 
 
 		 931 aa  587  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  35.27 
 
 		 949 aa  586  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  35.19 
 
 		 937 aa  588  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>