159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0076 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0076  coenzyme F390 synthetase  100 
 
 		 442 aa  894    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.743579  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1703  coenzyme F390 synthetase  36.16 
 
 		 472 aa  301  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  27.68 
 
 		 563 aa  147  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1919  hypothetical protein  28.23 
 
 		 493 aa  130  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1908  hypothetical protein  27.93 
 
 		 493 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4216  coenzyme F390 synthetase-like  23.01 
 
 		 456 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2997  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.24 
 
 		 468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.3 
 
 		 461 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0016  coenzyme F390 synthetase-like protein  21.04 
 
 		 480 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2239  coenzyme F390 synthetase-like  22.35 
 
 		 466 aa  100  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4480  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.52 
 
 		 454 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4311  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.52 
 
 		 454 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0828925  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4211  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.52 
 
 		 454 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.494942  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002732  coenzyme F390 synthetase  25.23 
 
 		 419 aa  97.4  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  21.87 
 
 		 464 aa  97.4  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2955  putative adenylate-forming enzyme  26.82 
 
 		 445 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0260622  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  23.28 
 
 		 426 aa  95.5  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3212  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.36 
 
 		 460 aa  90.9  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3014  hypothetical protein  25.56 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3246  hypothetical protein  25.56 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.06 
 
 		 450 aa  89.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3245  hypothetical protein  25.56 
 
 		 445 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2999  coenzyme F390 synthetase  24.94 
 
 		 445 aa  88.2  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2936  hypothetical protein  24.72 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1959  coenzyme F390 synthetase-like  25.2 
 
 		 239 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4394  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.62 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.03 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3110  adenylate-forming enzyme  24.59 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00628752  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1598  hypothetical protein  24.58 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  20.27 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.3 
 
 		 454 aa  73.2  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4139  adenylate-forming enzyme  20.34 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0374  putative adenylate-forming enzyme  23.12 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4420  adenylate-forming enzyme  19.51 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1829  phenylacetate-CoA ligase  22.78 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.914606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2486  phenylacetate-CoA ligase  20.74 
 
 		 450 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2189  phenylacetate-CoA ligase  19.51 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0357047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  23.73 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26570  phenylacetate-CoA ligase  20.9 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.123505 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20330  phenylacetate-CoA ligase  20.63 
 
 		 449 aa  66.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  22.78 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  25.09 
 
 		 458 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1923  phenylacetate-CoA ligase  22.78 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0702505  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0472  putative capK protein  23.47 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000021402  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  21.05 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2752  phenylacetate-CoA ligase  22.32 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0185722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1236  phenylacetate-CoA ligase  21.79 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1908  phenylacetate-CoA ligase  19.34 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3634  phenylacetate-CoA ligase  20.93 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0986  phenylacetate-CoA ligase  23.67 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0477  phenylacetate-CoA ligase  22.01 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  19.62 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  20.55 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2034  phenylacetate-CoA ligase  22.25 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  20.28 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  20.94 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6182  phenylacetate-CoA ligase  22.94 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  21.98 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3117  phenylacetate-CoA ligase  22.66 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0603128  normal  0.0548798 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2875  phenylacetyl-CoA-ligase protein  21.75 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0228707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2897  Phenylacetate--CoA ligase  21.59 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2007  CapK related-protein  21.02 
 
 		 487 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1512  coenzyme F390 synthetase-like  21.69 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  22.28 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  21.38 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  21.87 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6630  hypothetical protein  21.62 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  20.9 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  24.02 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  21.21 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  19.82 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2503  hypothetical protein  21.43 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239215 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2104  hypothetical protein  21.43 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  21.81 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  23.63 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2214  adenylate-forming enzyme  21.43 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.362513  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  22.6 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0508  coenzyme F390 synthetase  21 
 
 		 455 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1509  phenylacetate-CoA ligase  21.27 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.047551  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  22.99 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  22.78 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  22.66 
 
 		 453 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2403  phenylacetate-CoA ligase  21 
 
 		 436 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.670369 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3568  phenylacetate-CoA ligase  22.41 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172482  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1925  hypothetical protein  21.46 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.132933  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  22.14 
 
 		 434 aa  55.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  21.33 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3048  phenylacetate-CoA ligase  22.25 
 
 		 456 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  20.73 
 
 		 446 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  22.73 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3247  phenylacetate-CoA ligase  22.89 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  20.47 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1029  Phenylacetate--CoA ligase  21.62 
 
 		 429 aa  54.3  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0602  coenzyme F390 synthetase  20.14 
 
 		 451 aa  54.3  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0488194  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0672  putative adenylate-forming enzyme  19.84 
 
 		 426 aa  54.3  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.393226  normal  0.19612 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1449  phenylacetate-CoA ligase  20.43 
 
 		 429 aa  54.7  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  21.14 
 
 		 434 aa  53.9  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0539  phenylacetate-coenzyme A ligase  22.13 
 
 		 432 aa  53.9  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0321632  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  21.19 
 
 		 434 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  20.34 
 
 		 444 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>