More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0072 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0072  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
324 aa  647    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
283 aa  196  5.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1810  putative sugar ABC transporter, permease protein  35.38 
 
 
280 aa  196  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.817708  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01289  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.31 
 
 
280 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.31 
 
 
280 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.240108  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01300  hypothetical protein  36.31 
 
 
280 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534807  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.31 
 
 
280 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1427  putative sugar ABC transporter, permease protein  36.31 
 
 
280 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1522  putative sugar ABC transporter, permease protein  36.31 
 
 
280 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1957  putative sugar ABC transporter, permease protein  36 
 
 
280 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.605299  normal  0.820662 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.250115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
289 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
404 aa  152  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.1795  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.81 
 
 
280 aa  152  8.999999999999999e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303025  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.53 
 
 
310 aa  149  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
404 aa  150  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.463288 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.56 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.78 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.05 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
253 aa  145  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
296 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
296 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
285 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  29.91 
 
 
278 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
293 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
292 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.87 
 
 
287 aa  138  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5854  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
281 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133464  normal  0.182587 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.2 
 
 
295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.398115  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0920  maltose transporter permease  27.52 
 
 
296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.32 
 
 
280 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.450208  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
293 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 
277 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  33.47 
 
 
291 aa  135  9e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
307 aa  135  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  33.47 
 
 
291 aa  135  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  32.14 
 
 
269 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.28 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001330  maltose/maltodextrin ABC transporter permease protein MalG  27.52 
 
 
296 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3130  maltose transporter permease  29.13 
 
 
296 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0528646  decreased coverage  0.00285167 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.34 
 
 
283 aa  134  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
297 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05216  maltose transporter permease  27.13 
 
 
296 aa  132  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 
277 aa  132  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.062682  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.93 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.9066  normal  0.435889 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
277 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736814  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.35 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
306 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0296  maltose transporter permease  27.13 
 
 
296 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.422686  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
288 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.19 
 
 
275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.69 
 
 
281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.667982  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03904  maltose transporter subunit  29.36 
 
 
296 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.36 
 
 
296 aa  129  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3997  maltose transporter permease  29.36 
 
 
296 aa  129  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0710551  normal  0.724914 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4583  maltose transporter permease  29.36 
 
 
296 aa  129  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4272  maltose transporter permease  29.36 
 
 
296 aa  129  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4494  maltose transporter permease  29.36 
 
 
296 aa  129  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.348431  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.32 
 
 
281 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610418 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5513  maltose transporter permease  29.36 
 
 
296 aa  129  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03864  hypothetical protein  29.36 
 
 
296 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  29.87 
 
 
275 aa  129  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
280 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.41482 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.77 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4484  maltose transporter permease  34.38 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4419  maltose transporter permease  34.38 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246635 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4569  maltose transporter permease  34.38 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.979918 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0236  maltose transporter permease  34.82 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.653107 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4569  maltose transporter permease  34.38 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.019276 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
308 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.809225  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
870 aa  127  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.326107  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.08 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.44 
 
 
280 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142208  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.69 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.83 
 
 
307 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.642563  decreased coverage  0.0000998416 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4621  maltose transporter permease  33.93 
 
 
296 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.916562  normal  0.2555 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
283 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
275 aa  125  9e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.299262  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4652  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 
292 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0409709  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04120  ABC-type maltose transport systems, permease component  28.89 
 
 
305 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.32 
 
 
278 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
306 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516891  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
255 aa  124  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.32 
 
 
278 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
277 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000457855  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.75 
 
 
282 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.03 
 
 
283 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657095  normal  0.345018 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.63 
 
 
279 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.990919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.63 
 
 
279 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2960  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.69 
 
 
282 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0179548  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.08 
 
 
282 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0499558  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
299 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.494114 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 
746 aa  124  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3327  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.79 
 
 
278 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 
277 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>