More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0034 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0034  transcription termination factor Rho  100 
 
 
441 aa  890    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0281  transcription termination factor Rho  65.39 
 
 
422 aa  561  1.0000000000000001e-159  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.697975  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1393  transcription termination factor Rho  65.47 
 
 
423 aa  560  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.107129  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1322  transcription termination factor Rho  62.44 
 
 
427 aa  533  1e-150  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239055  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1364  transcription termination factor Rho  62.44 
 
 
427 aa  533  1e-150  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000237844  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  56.83 
 
 
436 aa  478  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3439  transcription termination factor Rho  57.52 
 
 
424 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18010  transcription termination factor Rho  55.8 
 
 
418 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155456  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3329  transcription termination factor Rho  56.56 
 
 
424 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000488877  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  55.12 
 
 
415 aa  467  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  56.69 
 
 
450 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  55.69 
 
 
415 aa  462  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0584  transcription termination factor Rho  55.37 
 
 
419 aa  463  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.290432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  55.69 
 
 
415 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2782  transcription termination factor Rho  55.45 
 
 
434 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000423025  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  55.07 
 
 
437 aa  464  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  55.69 
 
 
415 aa  463  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1562  transcription termination factor Rho  54.69 
 
 
449 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.135636  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2699  transcription termination factor Rho  54.18 
 
 
419 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000370225  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2469  transcription termination factor Rho  53.72 
 
 
419 aa  458  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5456  transcription termination factor Rho  55.47 
 
 
419 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  54.18 
 
 
419 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  55.21 
 
 
415 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  54.59 
 
 
416 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4223  transcription termination factor Rho  54.39 
 
 
433 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0343455  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  54.18 
 
 
419 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2875  transcription termination factor Rho  53.73 
 
 
414 aa  460  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000596182  hitchhiker  0.0000000051711 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03661  transcription termination factor Rho  54.44 
 
 
419 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000324277  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4194  transcription termination factor Rho  54.44 
 
 
419 aa  456  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000794569  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4139  transcription termination factor Rho  54.44 
 
 
419 aa  456  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  54.96 
 
 
415 aa  455  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  54.74 
 
 
419 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5497  transcription termination factor Rho  54.57 
 
 
423 aa  455  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000613532  unclonable  1.32525e-25 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0358  transcription termination factor Rho  54.2 
 
 
419 aa  455  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.956758  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0157  transcription termination factor Rho  54.44 
 
 
419 aa  457  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002098  transcription termination factor Rho  54.18 
 
 
419 aa  457  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000734863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5460  transcription termination factor Rho  55.05 
 
 
423 aa  457  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000364812  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0176  transcription termination factor Rho  54.65 
 
 
419 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  55.21 
 
 
415 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0470  transcription termination factor Rho  54.72 
 
 
414 aa  456  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000467448  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  54.74 
 
 
419 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5181  transcription termination factor Rho  54.81 
 
 
423 aa  455  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5016  transcription termination factor Rho  55.05 
 
 
423 aa  457  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.88034e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5032  transcription termination factor Rho  55.05 
 
 
423 aa  457  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00629962  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  54.46 
 
 
415 aa  455  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  54.74 
 
 
419 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5455  transcription termination factor Rho  54.57 
 
 
423 aa  455  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000522794  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0204  transcription termination factor Rho  54.2 
 
 
419 aa  455  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3999  transcription termination factor Rho  54.44 
 
 
419 aa  456  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4220  transcription termination factor Rho  54.44 
 
 
419 aa  456  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00203599  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  55.45 
 
 
415 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00570  transcription termination factor Rho  53.68 
 
 
421 aa  458  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.576624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5575  transcription termination factor Rho  54.81 
 
 
423 aa  455  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000155129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5424  transcription termination factor Rho  55.05 
 
 
423 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.80667e-59 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5130  transcription termination factor Rho  54.81 
 
 
423 aa  456  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000119523  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  54.74 
 
 
419 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3853  transcription termination factor Rho  55.53 
 
 
423 aa  457  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000371532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0180  transcription termination factor Rho  54.11 
 
 
419 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  54.74 
 
 
419 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4011  transcription termination factor Rho  54.44 
 
 
450 aa  457  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4034  transcription termination factor Rho  54.11 
 
 
419 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.462931  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03610  hypothetical protein  54.44 
 
 
419 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000108874  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  54.74 
 
 
419 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5510  transcription termination factor Rho  55.05 
 
 
423 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000155234  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00336  transcription termination factor Rho  53.94 
 
 
419 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5215  transcription termination factor Rho  54.44 
 
 
419 aa  456  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4197  transcription termination factor Rho  54.44 
 
 
419 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4246  transcription termination factor Rho  54.44 
 
 
419 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4293  transcription termination factor Rho  54.44 
 
 
419 aa  456  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4128  transcription termination factor Rho  54.44 
 
 
419 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4143  transcription termination factor Rho  54.44 
 
 
419 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4203  transcription termination factor Rho  54.44 
 
 
450 aa  456  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4146  transcription termination factor Rho  54.44 
 
 
419 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0511  transcription termination factor Rho  54.11 
 
 
419 aa  456  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0322242 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0148  transcription termination factor Rho  54.18 
 
 
419 aa  456  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00136527  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4305  transcription termination factor Rho  54.44 
 
 
419 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1503  transcription termination factor Rho  55.31 
 
 
548 aa  453  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000037905  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1031  transcription termination factor Rho  52.88 
 
 
420 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0464905  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  53 
 
 
642 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3991  transcription termination factor Rho  53.46 
 
 
421 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800219  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1853  transcription termination factor Rho  52.66 
 
 
420 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.110087 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2375  transcription termination factor Rho  52.66 
 
 
420 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5130  transcription termination factor Rho  52.66 
 
 
420 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0923516  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0160  transcription termination factor Rho  54.2 
 
 
419 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2217  transcription termination factor Rho  52.66 
 
 
420 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0809447  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1444  transcription termination factor Rho  52.9 
 
 
420 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.440911  normal  0.105069 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2210  transcription termination factor Rho  52.66 
 
 
420 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171913  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4003  transcription termination factor Rho  54.2 
 
 
419 aa  454  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.499603  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1740  transcription termination factor Rho  52.66 
 
 
420 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.318458  normal  0.139414 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0188  transcription termination factor Rho  54.2 
 
 
419 aa  451  1.0000000000000001e-126  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2248  transcription termination factor Rho  52.66 
 
 
420 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.336797  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6250  transcription termination factor Rho  52.66 
 
 
420 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156064  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  52.93 
 
 
416 aa  453  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2408  transcription termination factor Rho  55.34 
 
 
425 aa  453  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000414081  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1767  transcription termination factor Rho  52.66 
 
 
420 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1829  transcription termination factor Rho  52.66 
 
 
420 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156095  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1123  transcription termination factor Rho  52.88 
 
 
420 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117933  normal  0.145069 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  54.96 
 
 
415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2363  transcription termination factor Rho  52.16 
 
 
422 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016195  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1855  transcription termination factor Rho  52.42 
 
 
420 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>