223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0024 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0024  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 206 aa  419  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118488  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  30.32 
 
 		 202 aa  91.7  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  30.98 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  30.32 
 
 		 202 aa  91.7  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  27.98 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  27.98 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  26.24 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.84 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  28.8 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  27.03 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  24.47 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  30.43 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  29.28 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  25.12 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  27.07 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.92 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  27.42 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12410  predicted amidophosphoribosyltransferase  25.33 
 
 		 254 aa  71.2  0.000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  23.86 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  25 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0828  putative competence protein F  29.06 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.173403  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  28.65 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  26.63 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  25.81 
 
 		 246 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  27.18 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  24.76 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  26.92 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  26.74 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  23.41 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  26.15 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  30.98 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  26 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  25.41 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  28.33 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  25.39 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  27.87 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  28.8 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  24.86 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  26.86 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  24.86 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  26.86 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  26.92 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  27.46 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  23.37 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  27.51 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  25.41 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  24.88 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  22.77 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  24.78 
 
 		 243 aa  62  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  23.91 
 
 		 242 aa  62  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  26.67 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  22.61 
 
 		 246 aa  62  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  29.21 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.6 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  28.65 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  28.12 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2548  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.24 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.332374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  22.39 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  25.55 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  26.34 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4231  amidophosphoribosyltransferases-like  28.29 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  27.6 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  25.27 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  27.6 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  25.85 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  25.12 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.88 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  26.02 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  28.23 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  26.83 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.34 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0985  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.27 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  23.46 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3712  gluconate periplasmic binding protein  25.5 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  26.42 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  27.36 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3529  competence protein ComF  25.46 
 
 		 293 aa  57  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  27.94 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  24.46 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0541  phosphoribosyltransferase  28.36 
 
 		 269 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0453  phosphoribosyltransferase  24.18 
 
 		 257 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3784  gluconate periplasmic binding protein  25.5 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3880  gluconate periplasmic binding protein  25 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0152  amidophosphoribosyltransferase-like protein  23.33 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0150126  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  27.04 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3818  gluconate periplasmic binding protein  25.5 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  25.65 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  23.71 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0157  competence protein ComF  26.88 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  24.21 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  28.11 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3800  competence protein ComF  25.82 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00615  amidophosphoribosyltransferase  25.15 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0177  competence protein ComF  25.27 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  26.79 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  25.44 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  22.47 
 
 		 271 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  26.15 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  24.06 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>