More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0018 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0018  patatin  100 
 
 		 266 aa  537  9.999999999999999e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0216  patatin  37.84 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0218  patatin  37.84 
 
 		 252 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1401  patatin  36.6 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0324222  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0273  patatin  33.94 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  40.1 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  36.12 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  41.27 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  36.68 
 
 		 303 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  35.29 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  35.04 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  35.04 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  34.42 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  37.95 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  35.04 
 
 		 263 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  35.04 
 
 		 263 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  35.04 
 
 		 263 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  35.04 
 
 		 263 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  35.04 
 
 		 263 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  34.9 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  34.9 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2309  hypothetical protein  35.42 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1574  hypothetical protein  37.5 
 
 		 301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1887  hypothetical protein  37.5 
 
 		 301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261271  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1391  hypothetical protein  37.5 
 
 		 301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.4061  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1881  hypothetical protein  37.5 
 
 		 301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.256375  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1944  hypothetical protein  37.5 
 
 		 301 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  36.98 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  36.46 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1383  hypothetical protein  31.86 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.117761  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1342  hypothetical protein  31.86 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00416031  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1399  hypothetical protein  31.86 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01210  hypothetical protein  31.86 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.287845  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2415  Patatin  31.86 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01220  hypothetical protein  31.86 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.237609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  39.39 
 
 		 327 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1907  hypothetical protein  31.86 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163252  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2393  hypothetical protein  31.86 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000191972 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1719  hypothetical protein  31.86 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00963629  normal  0.824632 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2711  hypothetical protein  34.9 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  hitchhiker  0.000234517 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  36.92 
 
 		 335 aa  115  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  33.96 
 
 		 273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  37.17 
 
 		 316 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  34.48 
 
 		 323 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  32.81 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0830  Patatin  37.5 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00263851  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0681  patatin-like phospholipase family protein  37.5 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  35.57 
 
 		 292 aa  112  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  34.38 
 
 		 310 aa  112  8.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  37.04 
 
 		 252 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  37.31 
 
 		 335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  31.58 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  35.29 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  35.64 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  35.05 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  35.11 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2538  Patatin  34.9 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.54485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2263  patatin  34.9 
 
 		 352 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.622551  normal  0.202768 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  33.16 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  31.71 
 
 		 358 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  35.98 
 
 		 323 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  33.84 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  29.87 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  34 
 
 		 260 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2220  Patatin  33.67 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0960823 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  30.89 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  36.13 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  30.89 
 
 		 474 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  30.89 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  30.89 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  30.89 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  35.64 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  35.35 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  35.08 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  32.92 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  30.96 
 
 		 272 aa  105  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  33.85 
 
 		 316 aa  105  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  31.67 
 
 		 323 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  32.79 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  33.85 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  32.79 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  32.79 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  33.5 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  33.16 
 
 		 358 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  32.99 
 
 		 318 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  35.79 
 
 		 319 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  32.99 
 
 		 318 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  35.08 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0621  patatin  33.95 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  30.53 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  34.21 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  34.03 
 
 		 287 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  34.2 
 
 		 321 aa  102  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  32.51 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  32.12 
 
 		 347 aa  102  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  36.27 
 
 		 250 aa  102  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  35.6 
 
 		 257 aa  102  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 341 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  33.16 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  36 
 
 		 330 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>