25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0016 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0016  hypothetical protein  100 
 
 
553 aa  1095    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.697123  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  25.77 
 
 
456 aa  66.6  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0086  PEGA domain-containing protein  25.38 
 
 
456 aa  66.2  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061684  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1516  PEGA domain-containing protein  23.36 
 
 
432 aa  60.8  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1528  serine/threonine protein kinase  28.22 
 
 
601 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0271  hypothetical protein  25.4 
 
 
465 aa  58.9  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0214  hypothetical protein  28.57 
 
 
435 aa  57  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1237  PEGA domain protein  24.91 
 
 
613 aa  56.2  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2153  hypothetical protein  22.29 
 
 
581 aa  55.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0263882  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1891  PEGA domain protein  28.28 
 
 
460 aa  53.9  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  29.88 
 
 
684 aa  53.5  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2758  hypothetical protein  30.14 
 
 
546 aa  51.2  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3001  PEGA  23.78 
 
 
600 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221901  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0105  PEGA domain-containing protein  22.97 
 
 
426 aa  50.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0195  PEGA domain protein  25.9 
 
 
412 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2495  PEGA  22.67 
 
 
436 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.441491  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3597  PEGA domain protein  20 
 
 
727 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.956327  normal  0.0137452 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5102  serine/threonine protein kinase  24.71 
 
 
629 aa  47.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.916534 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1562  PEGA domain protein  24.6 
 
 
533 aa  47  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00305043  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0951  PEGA domain-containing protein  21.57 
 
 
409 aa  47  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.919574  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0483  PEGA  40 
 
 
118 aa  47  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1431  PEGA domain-containing protein  26.23 
 
 
326 aa  44.7  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.075762  decreased coverage  0.0000710587 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2302  hypothetical protein  23.86 
 
 
271 aa  44.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0111  PEGA domain protein  22.02 
 
 
416 aa  44.3  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2676  serine/threonine protein kinase  24.41 
 
 
769 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.396186  normal  0.282843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>