More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0015 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 145 aa  286  5.0000000000000004e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  42.42 
 
 		 141 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  31.34 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  27.72 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  27.72 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 204 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 		 177 aa  57  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  24.09 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  26.96 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2562  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  31.58 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0686  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  27.87 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  27.84 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  28.7 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  24.79 
 
 		 170 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2690  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 188 aa  53.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  30.12 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  25.37 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  32.5 
 
 		 146 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 162 aa  52  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  26.79 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  37.68 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  31.71 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0549  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  27.71 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 197 aa  52  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 173 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  31.71 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  28.69 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  24.81 
 
 		 191 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  28.69 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 178 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  24.41 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2559  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 179 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  24.41 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 		 160 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  30.49 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  34.72 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 		 160 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>