More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0013 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  317  5e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  37.93 
 
 		 151 aa  97.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1429  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 154 aa  80.1  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0669  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263204  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 152 aa  67  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1636  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  27.2 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3737  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  27.2 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0786  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0555365  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 159 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  23.4 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  28.57 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0109  transcriptional regulator, MarR family  22.46 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0509  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.304563  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  26.27 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  30.4 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  26.27 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  21.13 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 169 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  26.27 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  26.89 
 
 		 292 aa  51.6  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  22.4 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  25.76 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0521  MarR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142472  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0017  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  28.74 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3406  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.698175 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1946  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 177 aa  49.7  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00612369  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>