More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0008 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0008  ABC transporter periplasmic-binding protein  100 
 
 
325 aa  652    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000406397  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1807  ABC transporter periplasmic-binding protein  49.84 
 
 
325 aa  288  8e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000832712  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0311  ABC transporter periplasmic-binding protein  46.15 
 
 
325 aa  282  5.000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568515  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00788  thiamine transporter substrate binding subunit  35.95 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001686  thiamin ABC transporter substrate-binding component  34.44 
 
 
330 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3107  thiamine transporter substrate binding subunit  35.56 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4266  thiamine transporter substrate binding subunit  36.57 
 
 
333 aa  208  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2119  thiamine transporter substrate binding subunit  34.66 
 
 
330 aa  206  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0385  thiamine transporter substrate binding subunit  33.13 
 
 
332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3542  thiamine transporter substrate binding subunit  33.85 
 
 
358 aa  198  9e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3619  thiamine transporter substrate binding subunit  33.33 
 
 
338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3808  thiamine transporter substrate binding subunit  33.33 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1142  thiamine transporter substrate binding subunit  35.37 
 
 
334 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.493947  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2943  thiamine transporter substrate binding subunit  33.54 
 
 
348 aa  196  7e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.683707 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0349  thiamine transporter substrate binding subunit  33.98 
 
 
338 aa  196  7e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3259  thiamine transporter substrate binding subunit  36.51 
 
 
332 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288476  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0455  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  33.97 
 
 
360 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.617088  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1695  thiamine transporter substrate binding subunit  34.89 
 
 
334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.724988  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0737  thiamine transporter substrate binding subunit  34.21 
 
 
328 aa  190  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0885  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  35.56 
 
 
361 aa  190  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.420494 
 
 
-
 
NC_004310  BR1757  thiamine transporter substrate binding subunit  34.58 
 
 
334 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106404  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1200  ABC transporter periplasmic-binding protein  36.27 
 
 
334 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00816728  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3472  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  34.47 
 
 
337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0623  thiamine transporter substrate binding subunit  32.9 
 
 
327 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0584  thiamine transporter substrate binding subunit  33.22 
 
 
327 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0330  thiamine transporter substrate binding subunit  34.47 
 
 
335 aa  179  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0119  thiamine transporter substrate binding subunit  33.55 
 
 
327 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0289441 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0615  thiamine transporter substrate binding subunit  33.33 
 
 
327 aa  178  9e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0282494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0115  thiamine transporter substrate binding subunit  33.55 
 
 
327 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0114  thiamine transporter substrate binding subunit  33.55 
 
 
327 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51564  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0112  thiamine transporter substrate binding subunit  33.55 
 
 
327 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0119  thiamine transporter substrate binding subunit  33.55 
 
 
327 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00070  thiamin transporter subunit  33.22 
 
 
327 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3531  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  33.22 
 
 
327 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0073  thiamine transporter substrate binding subunit  33.22 
 
 
327 aa  176  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00069  hypothetical protein  33.22 
 
 
327 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3589  thiamine transporter substrate binding subunit  33.22 
 
 
327 aa  176  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000386995 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0072  thiamine transporter substrate binding subunit  33.22 
 
 
327 aa  176  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0070  thiamine transporter substrate binding subunit  33.22 
 
 
327 aa  176  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0143  thiamine ABC transporter, thiamine-binding protein  35.14 
 
 
336 aa  176  6e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0060  thiamine transporter substrate binding subunit  32.89 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0072  thiamine transporter substrate binding subunit  32.89 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.338985 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2818  thiamine transporter substrate binding subunit  34.05 
 
 
326 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458711  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0058  thiamine transporter substrate binding subunit  36.36 
 
 
327 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1391  thiamine transporter substrate binding subunit  36.36 
 
 
342 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.994265  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0261  ABC transporter periplasmic-binding protein  31.58 
 
 
386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2798  thiamine transporter substrate binding subunit  33.54 
 
 
327 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0314  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.67 
 
 
363 aa  155  7e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000495948  hitchhiker  0.00896596 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31210  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  31.35 
 
 
357 aa  154  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0746  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.03 
 
 
344 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3246  ABC transporter periplasmic-binding protein  32.81 
 
 
340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.791239  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04160  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.94 
 
 
367 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207921  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3809  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.1 
 
 
366 aa  150  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3336  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  30 
 
 
351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04580  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.6 
 
 
392 aa  145  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3056  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.21 
 
 
353 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.450675  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1933  ABC transporter periplasmic-binding protein  31.88 
 
 
343 aa  142  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.567061  normal  0.262856 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2516  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.94 
 
 
370 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0178  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.06 
 
 
386 aa  140  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0218  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.38 
 
 
367 aa  139  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195863  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19460  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.48 
 
 
355 aa  133  5e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283469  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0433  ABC transporter periplasmic-binding protein  27.48 
 
 
359 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127437  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1013  thiamine ABC transporter, periplasmic-binding protein  28.99 
 
 
338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0137605  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2697  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.77 
 
 
431 aa  126  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0460  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  33.08 
 
 
387 aa  125  8.000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0388  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.69 
 
 
388 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1933  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.77 
 
 
388 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1940  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  31.05 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6494  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  29.11 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000128013  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.59 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.59 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.75 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3159  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  28.69 
 
 
351 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.451295  normal  0.0280644 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.32 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0970  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000273849  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3135  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  28.83 
 
 
351 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4877  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.38801 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  25 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  24.92 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0214  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.3 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2140  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.26 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1366  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2485  extracellular solute-binding protein family 1  27.34 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.390798  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5874  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  26.32 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4473  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  28.21 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144148 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4607  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  28.21 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.980284  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  24.43 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1772  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 
344 aa  72.4  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.320595  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1463  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  23.7 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0643  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  26.03 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121089  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  26.18 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1958  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.7 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0213047  hitchhiker  1.86869e-16 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5525  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.655164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>