More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0007 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
512 aa  983    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000649932  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.5 
 
 
510 aa  166  8e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.1 
 
 
606 aa  139  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.77 
 
 
565 aa  117  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.97 
 
 
634 aa  114  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.88 
 
 
597 aa  113  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.15 
 
 
540 aa  113  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.95 
 
 
572 aa  109  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.14 
 
 
663 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  30 
 
 
516 aa  101  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  32.59 
 
 
509 aa  99.8  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  31.05 
 
 
516 aa  97.1  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.46 
 
 
565 aa  96.3  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.65 
 
 
547 aa  95.9  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0386  thiamine transporter membrane protein  28.22 
 
 
534 aa  92.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  32.75 
 
 
536 aa  90.1  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  32.75 
 
 
536 aa  90.1  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.17 
 
 
544 aa  90.1  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  32.75 
 
 
536 aa  90.1  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0111  thiamine transporter membrane protein  31.35 
 
 
536 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  32.6 
 
 
536 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0113  thiamine transporter membrane protein  31.35 
 
 
536 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.195449 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0114  thiamine transporter membrane protein  31.35 
 
 
536 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.576888 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0072  thiamine transporter membrane protein  33.19 
 
 
536 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  32.6 
 
 
536 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0118  thiamine transporter membrane protein  31.35 
 
 
536 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0118  thiamine transporter membrane protein  31.35 
 
 
536 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0333218 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  32.31 
 
 
536 aa  89  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.26 
 
 
528 aa  88.6  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.402791 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0350  thiamine transporter membrane protein  30.36 
 
 
540 aa  89.4  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0069  thiamine transporter membrane protein  32.6 
 
 
536 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0059  thiamine transporter membrane protein  33.04 
 
 
536 aa  89  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04170  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  32.32 
 
 
592 aa  88.2  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0420701  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.51 
 
 
509 aa  87  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553789  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.27 
 
 
564 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3108  thiamine transporter membrane protein  26.91 
 
 
531 aa  86.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  24.36 
 
 
560 aa  85.9  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  28.22 
 
 
547 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0736  thiamine transporter membrane protein  32.02 
 
 
535 aa  84  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  32.02 
 
 
543 aa  82  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0614  thiamine transporter membrane protein  29.18 
 
 
536 aa  82  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.012901 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  30.99 
 
 
535 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  30.99 
 
 
535 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  30.99 
 
 
535 aa  81.3  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4267  thiamine transporter membrane protein  32.35 
 
 
542 aa  81.3  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2817  thiamine transporter membrane protein  28 
 
 
523 aa  81.3  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229213  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1199  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  30.35 
 
 
555 aa  80.9  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60189  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0059  thiamine transporter membrane protein  29.44 
 
 
504 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.19 
 
 
532 aa  80.5  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1392  thiamine transporter membrane protein  29.44 
 
 
504 aa  80.5  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  28.87 
 
 
530 aa  80.1  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.38 
 
 
550 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1012  thiamine transporter membrane protein  31.88 
 
 
514 aa  79.3  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  24.84 
 
 
564 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  29.44 
 
 
535 aa  78.2  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  30.17 
 
 
535 aa  77.4  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3260  thiamine transporter membrane protein  31.36 
 
 
545 aa  77.4  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19470  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  31.44 
 
 
576 aa  76.6  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1141  thiamine transporter membrane protein  30.88 
 
 
541 aa  76.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.65 
 
 
557 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2141  putative thiamine transport system permease protein  26.28 
 
 
479 aa  75.9  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
569 aa  74.3  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1038  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  26.81 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702638  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04590  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  31.07 
 
 
551 aa  73.9  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2799  thiamine transporter membrane protein  29.8 
 
 
504 aa  73.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0329  thiamine transporter membrane protein  28.89 
 
 
521 aa  72.8  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356206 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.13 
 
 
559 aa  72.8  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02288  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  26.51 
 
 
286 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.35 
 
 
601 aa  72  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0744847  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2532  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  27.92 
 
 
282 aa  72  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000130184  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.33 
 
 
569 aa  71.2  0.00000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.89 
 
 
569 aa  70.5  0.00000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003482  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotB  26.51 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000668861  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.07 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317498  normal  0.323079 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6718  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
307 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170467  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0215  putative thiamine transport system permease protein  28.37 
 
 
474 aa  69.7  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.253861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  24.06 
 
 
271 aa  69.3  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0359  molybdate ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 
221 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4468  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.59 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.289688  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  22.86 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.2 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1581  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  24.57 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.22 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1827  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.42 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4117  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  25.21 
 
 
282 aa  66.6  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.191331  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4967  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
319 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.128667  normal  0.152984 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1638  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  25.96 
 
 
285 aa  66.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3530  molybdenum ABC transporter, permease protein  29.78 
 
 
225 aa  66.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  24.51 
 
 
293 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5392  sulfate ABC transporter permease protein CysT  27.64 
 
 
285 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  25.99 
 
 
282 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1106  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  26.02 
 
 
271 aa  65.1  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0622  thiamine transporter membrane protein  30.88 
 
 
536 aa  65.1  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4787  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  27.09 
 
 
226 aa  65.1  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00784926  hitchhiker  0.000000216421 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.41 
 
 
225 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1683  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  29.92 
 
 
323 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2480  ABC transporter, permease protein, putative  27.27 
 
 
568 aa  64.7  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0468  2-aminoethylphosphonate ABC transporter permease  28.87 
 
 
289 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.22 
 
 
317 aa  64.3  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000449996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>