More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0001 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 
454 aa  929    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000297027  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0001  chromosomal replication initiation protein  40.32 
 
 
440 aa  376  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0001  chromosomal replication initiation protein  40.77 
 
 
440 aa  363  3e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.14 
 
 
437 aa  354  2e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000928481  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.71 
 
 
444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000143167  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.86 
 
 
444 aa  295  8e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.39 
 
 
443 aa  295  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.03 
 
 
447 aa  293  5e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  36.45 
 
 
453 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  36.45 
 
 
453 aa  292  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  36.3 
 
 
443 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
481 aa  289  9e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  35.45 
 
 
453 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.87 
 
 
458 aa  286  7e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.35 
 
 
449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  37.95 
 
 
449 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  34.94 
 
 
460 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  36.3 
 
 
460 aa  280  5e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.97 
 
 
453 aa  278  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  34.74 
 
 
450 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  35.68 
 
 
440 aa  278  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  34.49 
 
 
458 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  34.27 
 
 
460 aa  277  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.22 
 
 
453 aa  276  4e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  32.74 
 
 
480 aa  276  5e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  34.48 
 
 
482 aa  276  5e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  34.74 
 
 
450 aa  276  6e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  32.26 
 
 
472 aa  276  6e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.88 
 
 
439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  34.54 
 
 
441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.47 
 
 
463 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  35.93 
 
 
456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  34.68 
 
 
446 aa  274  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  34.08 
 
 
446 aa  273  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  34.98 
 
 
446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.66 
 
 
456 aa  272  7e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  35.35 
 
 
446 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  36.14 
 
 
443 aa  271  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  34.69 
 
 
445 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  33.81 
 
 
442 aa  271  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  35.79 
 
 
450 aa  270  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  34.45 
 
 
446 aa  270  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  34.45 
 
 
446 aa  270  5e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  34.45 
 
 
446 aa  270  5e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  34.45 
 
 
446 aa  270  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  34.45 
 
 
446 aa  270  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  34.83 
 
 
446 aa  269  8e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  34.83 
 
 
446 aa  269  8e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  31.04 
 
 
478 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  33.85 
 
 
457 aa  267  4e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.1 
 
 
439 aa  266  5.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  34.07 
 
 
457 aa  266  7e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  36.5 
 
 
459 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  33.71 
 
 
445 aa  264  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  33.26 
 
 
470 aa  263  4e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.73 
 
 
454 aa  261  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  35.7 
 
 
450 aa  257  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000322878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.71 
 
 
446 aa  257  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  34.34 
 
 
452 aa  257  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.46 
 
 
509 aa  256  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  32.67 
 
 
454 aa  257  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  32.87 
 
 
436 aa  256  6e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.33 
 
 
461 aa  254  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.81 
 
 
450 aa  254  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05911  chromosomal replication initiation protein  34.56 
 
 
464 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  31.94 
 
 
451 aa  252  1e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  33.12 
 
 
453 aa  249  6e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  33.12 
 
 
453 aa  249  6e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0565  chromosomal replication initiation protein  33.91 
 
 
464 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0886  chromosomal replication initiation protein  32.68 
 
 
462 aa  247  4e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.82 
 
 
503 aa  247  4e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.46 
 
 
480 aa  247  4e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  33.18 
 
 
452 aa  246  4.9999999999999997e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  33.18 
 
 
452 aa  246  4.9999999999999997e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06291  chromosomal replication initiation protein  33.62 
 
 
463 aa  246  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.23 
 
 
447 aa  245  9e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08301  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
463 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0973  chromosomal replication initiation protein  32.47 
 
 
450 aa  243  3.9999999999999997e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0001  chromosomal replication initiation protein  31.89 
 
 
466 aa  243  7e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.01 
 
 
454 aa  242  7.999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.96 
 
 
469 aa  242  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06201  chromosomal replication initiation protein  32.32 
 
 
464 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06211  chromosomal replication initiation protein  33.48 
 
 
464 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.62128  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.79 
 
 
467 aa  241  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.44 
 
 
460 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.38 
 
 
652 aa  239  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.00000505913  hitchhiker  0.00770539 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.31 
 
 
721 aa  239  9e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000423182  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  30.82 
 
 
455 aa  239  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.29 
 
 
527 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.8 
 
 
528 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.81 
 
 
469 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280164  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.94 
 
 
476 aa  238  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000240109  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  31.63 
 
 
461 aa  238  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  34.21 
 
 
495 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  34.21 
 
 
495 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  31.24 
 
 
460 aa  237  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  34.21 
 
 
495 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  33.1 
 
 
461 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  0.000000603983 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  31.24 
 
 
460 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  36.5 
 
 
494 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>