More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4601 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 98 aa  196  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0875  transposase IS3/IS911 family protein  70.41 
 
 		 101 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0473  ISxac3 transposase  85.37 
 
 		 293 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0546  transposase IS3/IS911  54.95 
 
 		 95 aa  103  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.266021  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1296  transposase IS3/IS911  54.95 
 
 		 95 aa  103  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1431  transposase IS3/IS911  54.95 
 
 		 95 aa  103  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0966831  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  48.39 
 
 		 97 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  45.26 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  47.92 
 
 		 98 aa  84.3  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  47.92 
 
 		 98 aa  84.3  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  41.94 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  41.94 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  41.94 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  41.94 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  41.94 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  45.74 
 
 		 101 aa  80.1  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  44.68 
 
 		 96 aa  80.1  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  44.09 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  44.09 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  40.86 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1290  ISCps2, transposase orfA  42.22 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2906  transposase IS3/IS911 family protein  42.35 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 		 94 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 		 94 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1819  transposase-like  39.13 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000187587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  45.83 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  41.76 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  45.83 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  45.83 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  45.83 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  45.83 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  45.83 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  45.83 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  45.83 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  45.83 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  45.83 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2410  ISCps2, transposase orfA  41.11 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0595959  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  45.83 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  45.83 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  41.67 
 
 		 92 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2278  transposase IS3/IS911  41.38 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6035  transposase IS3/  41.76 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5574  transposase IS3/IS911 family protein  44.21 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5315  transposase IS3/IS911 family protein  44.21 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.323663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1916  transposase IS3/IS911 family protein  40.59 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  38.38 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  38.38 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  43.48 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  43.48 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  43.48 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  43.48 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  43.48 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  43.48 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  43.48 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  44.68 
 
 		 106 aa  67  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0005  ISMca2 transposase OrfA  44.68 
 
 		 106 aa  67  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472147 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  44.68 
 
 		 106 aa  67  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0186  ISMca2 transposase OrfA  44.68 
 
 		 106 aa  67  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  44.68 
 
 		 106 aa  67  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  44.68 
 
 		 106 aa  67  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  44.68 
 
 		 106 aa  67  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  38.54 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  36.56 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  36.56 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1704  transposase IS3/IS911 family protein  37.89 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0731  transposase IS3/IS911 family protein  36.96 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0479858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0140  transposase IS3/IS911 family protein  37.89 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1583  transposase IS3/IS911 family protein  37.89 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  36.56 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2162  transposase IS3/IS911 family protein  37.89 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102712  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1877  transposase, putative  40 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.350595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1182  transposase IS3/IS911 family protein  40.96 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  38.78 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  38.78 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1627  transposase IS3/IS911  41.82 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.683262  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3190  transposase IS3/IS911  41.82 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39399  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0577  transposase IS3/IS911 family protein  41.82 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1653  transposase IS3/IS911 family protein  41.82 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3252  transposase IS3/IS911 family protein  41.82 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0478749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  41.49 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1669  transposase IS3/IS911 family protein  41.82 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0827907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1999  transposase IS3/IS911 family protein  41.82 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2229  transposase IS3/IS911 family protein  41.82 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2247  transposase IS3/IS911 family protein  41.82 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2584  transposase IS3/IS911 family protein  41.82 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2854  transposase IS3/IS911 family protein  41.82 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1073  IS3 family transposase orfA  36.17 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.604189  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  36.17 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  36.17 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  36.17 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>