More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4594 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  84.9 
 
 
385 aa  684  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
384 aa  782  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  76.58 
 
 
386 aa  610  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  74.54 
 
 
386 aa  607  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4043  iron-containing alcohol dehydrogenase  73.23 
 
 
386 aa  608  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  73.82 
 
 
386 aa  593  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02267  alcohol dehydrogenase, iron-containing  69.03 
 
 
386 aa  553  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2525  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.92 
 
 
390 aa  496  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.38 
 
 
387 aa  483  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0174  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.79 
 
 
387 aa  473  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249342  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0308  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.64 
 
 
388 aa  472  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.783951  normal  0.165329 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3750  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.85 
 
 
388 aa  464  1e-130  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2795  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.25 
 
 
385 aa  448  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281179  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.32 
 
 
387 aa  433  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.57 
 
 
385 aa  421  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6437  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.91 
 
 
393 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  3.70848e-05 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.58 
 
 
395 aa  348  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.03 
 
 
390 aa  338  8e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.74 
 
 
390 aa  332  5e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.57 
 
 
398 aa  319  6e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.21 
 
 
399 aa  314  1e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  48.88 
 
 
387 aa  312  5e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.26 
 
 
384 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.04 
 
 
400 aa  306  5e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.04 
 
 
400 aa  306  5e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.04 
 
 
400 aa  306  6e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  41.32 
 
 
392 aa  305  1e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.6 
 
 
400 aa  302  7e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.22 
 
 
395 aa  301  9e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.52 
 
 
400 aa  301  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40.52 
 
 
400 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.37 
 
 
400 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.11 
 
 
400 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.81233e-05 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40 
 
 
400 aa  294  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  41.6 
 
 
383 aa  275  1e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 
383 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 
383 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 
383 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 
383 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  39.63 
 
 
383 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 
383 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 
383 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 
383 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 
383 aa  267  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 
383 aa  268  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.16 
 
 
382 aa  262  8e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 
393 aa  260  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.76 
 
 
393 aa  259  5e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.27 
 
 
382 aa  259  6e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  36.39 
 
 
381 aa  259  6e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.47 
 
 
384 aa  258  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.74 
 
 
382 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.74 
 
 
382 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 
382 aa  257  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.59 
 
 
402 aa  256  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.84 
 
 
382 aa  256  5e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.43 
 
 
382 aa  256  6e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.51 
 
 
382 aa  256  7e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
387 aa  255  9e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.22 
 
 
382 aa  255  1e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  37.89 
 
 
382 aa  254  1e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  37.02 
 
 
872 aa  254  2e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02110  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  37.53 
 
 
887 aa  253  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.59 
 
 
383 aa  253  5e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3181  L-1,2-propanediol oxidoreductase  36.36 
 
 
382 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292144  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3133  L-1,2-propanediol oxidoreductase  37.14 
 
 
382 aa  252  8e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.708471  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3116  L-1,2-propanediol oxidoreductase  37.14 
 
 
382 aa  252  8e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.303713  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.7 
 
 
382 aa  252  9e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.7 
 
 
382 aa  252  9e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  37.7 
 
 
382 aa  252  9e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  38.62 
 
 
388 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.43 
 
 
382 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 
382 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.01 
 
 
382 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3196  L-1,2-propanediol oxidoreductase  36.88 
 
 
382 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.43 
 
 
382 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3296  L-1,2-propanediol oxidoreductase  36.88 
 
 
382 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.14 
 
 
383 aa  249  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.73 
 
 
383 aa  249  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  36.32 
 
 
382 aa  249  7e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.68 
 
 
388 aa  249  8e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4063  L-1,2-propanediol oxidoreductase  36.1 
 
 
383 aa  248  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 
382 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0913  L-1,2-propanediol oxidoreductase  36.1 
 
 
383 aa  248  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0889  lactaldehyde reductase  36.1 
 
 
382 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3104  L-1,2-propanediol oxidoreductase  36.1 
 
 
382 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.189679  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2939  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.84 
 
 
383 aa  247  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2943  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.84 
 
 
382 aa  247  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02606  hypothetical protein  35.84 
 
 
383 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.65 
 
 
382 aa  247  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0709057 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02644  L-1,2-propanediol oxidoreductase  35.84 
 
 
383 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.94 
 
 
382 aa  246  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  36.91 
 
 
382 aa  246  5e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
393 aa  245  8e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.33 
 
 
399 aa  245  8e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.99 
 
 
383 aa  244  1e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  38.56 
 
 
382 aa  244  2e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.3 
 
 
387 aa  244  2e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  36.84 
 
 
382 aa  244  2e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 
389 aa  243  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>