242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4586 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3507  cobaltochelatase subunit CobN  73.22 
 
 		 1253 aa  1824    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  40.54 
 
 		 1198 aa  813    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  40.37 
 
 		 1207 aa  777    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  34.25 
 
 		 1302 aa  681    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_004310  BR1306  cobaltochelatase subunit CobN  50.44 
 
 		 1263 aa  1203    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  72.17 
 
 		 1254 aa  1850    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1170  cobaltochelatase  52.43 
 
 		 1220 aa  1242    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.345597  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  72.17 
 
 		 1254 aa  1862    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  39.89 
 
 		 1209 aa  804    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  35.66 
 
 		 1262 aa  815    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  39.91 
 
 		 1435 aa  877    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0158  cobaltochelatase  50.77 
 
 		 1235 aa  1189    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.75394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  40.18 
 
 		 1206 aa  812    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  100 
 
 		 1248 aa  2517    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  35.09 
 
 		 1298 aa  663    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  39.81 
 
 		 1193 aa  811    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  46.53 
 
 		 1288 aa  1117    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  41.67 
 
 		 1222 aa  837    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  34.23 
 
 		 1259 aa  664    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  55.34 
 
 		 1281 aa  1350    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  72.11 
 
 		 1257 aa  1840    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  38.84 
 
 		 1213 aa  805    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  50.52 
 
 		 1263 aa  1205    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  55.13 
 
 		 1269 aa  1342    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  51.9 
 
 		 1293 aa  1288    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0816  cobaltochelatase, CobN subunit  39.12 
 
 		 1175 aa  719    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1631  cobaltochelatase subunit CobN  54.71 
 
 		 1269 aa  1340    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498133  normal  0.0450481 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  56.03 
 
 		 1267 aa  1362    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1121  cobaltochelatase, CobN subunit  40.06 
 
 		 1256 aa  822    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229116  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  41.42 
 
 		 1426 aa  903    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  40.6 
 
 		 1238 aa  850    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1357  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  40.63 
 
 		 1242 aa  831    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.250832 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  35.41 
 
 		 1258 aa  685    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0921  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.19 
 
 		 1245 aa  809    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.308916  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  39.91 
 
 		 1406 aa  838    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  46.74 
 
 		 1263 aa  1090    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  33.08 
 
 		 1220 aa  719    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2219  cobaltochelatase subunit CobN  75.72 
 
 		 1248 aa  1878    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3366  cobaltochelatase subunit CobN  51.7 
 
 		 1240 aa  1163    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  55.19 
 
 		 1278 aa  1332    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1518  cobaltochelatase subunit CobN  40.25 
 
 		 1364 aa  736    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0461692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0738  cobaltochelatase subunit CobN  46.06 
 
 		 1286 aa  1015    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  55.42 
 
 		 1281 aa  1352    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3461  CobN/magnesium chelatase  34.75 
 
 		 1304 aa  657    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  42.24 
 
 		 1222 aa  850    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  34.39 
 
 		 1255 aa  734    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  39.23 
 
 		 1212 aa  772    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2647  cobaltochelatase CobN subunit  50.28 
 
 		 1260 aa  1162    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.844431  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2269  cobaltochelatase subunit CobN  73.14 
 
 		 1253 aa  1822    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0787  cobaltochelatase subunit CobN  46.51 
 
 		 1249 aa  1018    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1582  cobaltochelatase subunit CobN  54.79 
 
 		 1269 aa  1325    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0866134 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09801  cobalamin biosynthetic protein CobN  34.11 
 
 		 1245 aa  820    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  55.73 
 
 		 1267 aa  1359    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0883  cobaltochelatase subunit CobN  52.43 
 
 		 1220 aa  1242    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221354  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  40.4 
 
 		 1266 aa  836    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0636  cobaltochelatase subunit CobN  46.41 
 
 		 1247 aa  1013    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  38.96 
 
 		 1194 aa  797    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2352  cobaltochelatase, CobN subunit  41.54 
 
 		 1444 aa  869    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  54.85 
 
 		 1269 aa  1342    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  40.28 
 
 		 1198 aa  813    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  42.72 
 
 		 1237 aa  915    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0132  cobaltochelatase subunit CobN  42.56 
 
 		 1363 aa  1033    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305949  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  45.94 
 
 		 1290 aa  1112    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  44.14 
 
 		 1247 aa  1043    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  55.25 
 
 		 1270 aa  1356    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25970  cobaltochelatase subunit CobN  75.8 
 
 		 1248 aa  1872    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.359324  normal  0.429696 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  41.61 
 
 		 1409 aa  863    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  54.85 
 
 		 1269 aa  1342    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  37.83 
 
 		 1244 aa  838    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  40.36 
 
 		 1203 aa  775    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  55.58 
 
 		 1270 aa  1363    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  55.88 
 
 		 1269 aa  1350    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  40.91 
 
 		 1191 aa  827    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  40.08 
 
 		 1453 aa  860    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  34.85 
 
 		 1256 aa  709    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1291  cobaltochelatase, CobN subunit  40.99 
 
 		 1264 aa  833    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.526885  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  72.58 
 
 		 1253 aa  1814    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2495  cobaltochelatase, CobN subunit  39.2 
 
 		 1196 aa  766    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2131  cobaltochelatase subunit CobN  53.22 
 
 		 1330 aa  1063    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0808058  normal  0.0966772 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  72.74 
 
 		 1253 aa  1825    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  40.26 
 
 		 1190 aa  782    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  44.18 
 
 		 1253 aa  1078    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  40.28 
 
 		 1198 aa  813    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  39.09 
 
 		 1205 aa  813    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1615  cobaltochelatase subunit CobN  52.35 
 
 		 1220 aa  1240    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144906  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  49 
 
 		 1273 aa  1155    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09821  cobalamin biosynthetic protein CobN  34.11 
 
 		 1245 aa  812    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  44.33 
 
 		 1261 aa  1069    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  39.9 
 
 		 1207 aa  817    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09611  cobalamin biosynthetic protein CobN  36.33 
 
 		 1245 aa  812    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10041  cobalamin biosynthetic protein CobN  35.97 
 
 		 1262 aa  811    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.460676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  53.99 
 
 		 1273 aa  1259    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  44.07 
 
 		 1247 aa  1035    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14911  cobalamin biosynthetic protein CobN  39.2 
 
 		 1259 aa  811    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.629118 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0277  cobaltochelatase subunit CobN  52.43 
 
 		 1220 aa  1242    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408292  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08851  cobalamin biosynthetic protein CobN  36.56 
 
 		 1253 aa  831    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327208 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1877  cobaltochelatase subunit CobN  50.52 
 
 		 1263 aa  1207    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  40.52 
 
 		 1199 aa  774    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  55.34 
 
 		 1281 aa  1350    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  32.89 
 
 		 1293 aa  599  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>