More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4471 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  100 
 
 		 367 aa  743    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  81.35 
 
 		 370 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  80.54 
 
 		 370 aa  596  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  79.73 
 
 		 370 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  76.02 
 
 		 372 aa  584  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  76.57 
 
 		 368 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  73.76 
 
 		 369 aa  543  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  60.16 
 
 		 378 aa  415  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  60.11 
 
 		 376 aa  415  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  56.86 
 
 		 357 aa  411  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  59.56 
 
 		 380 aa  412  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  59.17 
 
 		 375 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  57.94 
 
 		 365 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.27 
 
 		 365 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  57.78 
 
 		 369 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  57.38 
 
 		 332 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  57.22 
 
 		 369 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  57.1 
 
 		 395 aa  403  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.53 
 
 		 371 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  57.5 
 
 		 369 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  57.1 
 
 		 332 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.52 
 
 		 370 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  56.52 
 
 		 370 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  55.07 
 
 		 367 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  56.67 
 
 		 368 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  56.39 
 
 		 369 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  56.67 
 
 		 368 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  54.82 
 
 		 379 aa  396  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  56.39 
 
 		 369 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.52 
 
 		 370 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.52 
 
 		 370 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  56.67 
 
 		 368 aa  395  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.52 
 
 		 370 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.52 
 
 		 388 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.52 
 
 		 370 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  56.82 
 
 		 332 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  52.78 
 
 		 368 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  52.78 
 
 		 368 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  56.55 
 
 		 332 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  54.52 
 
 		 359 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  56.56 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.04 
 
 		 370 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  56.27 
 
 		 332 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  54.24 
 
 		 358 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  53.2 
 
 		 369 aa  391  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  52.78 
 
 		 366 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  54.42 
 
 		 369 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  55.03 
 
 		 380 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  53.85 
 
 		 369 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  54.08 
 
 		 358 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  54.49 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  54.1 
 
 		 369 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  56.55 
 
 		 333 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  54.87 
 
 		 359 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.57 
 
 		 369 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  53.54 
 
 		 368 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  52.92 
 
 		 359 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  51.8 
 
 		 361 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  53.26 
 
 		 353 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  55.03 
 
 		 332 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5485  ABC transporter related  53.64 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011502 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  51.25 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0714  ABC transporter related  54.21 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4930  ABC transporter related  53.64 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  52.92 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4987  ABC transporter related  53.53 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3198  ABC transporter related  54.72 
 
 		 382 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5203  ABC transporter related  53.74 
 
 		 385 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300266  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5656  ABC transporter related  53.74 
 
 		 385 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115239  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1322  ABC transporter related protein  54.17 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0063  ABC transporter related  51.38 
 
 		 364 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  53.2 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4579  ABC transporter related  53.48 
 
 		 385 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381614 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  53.89 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  49.86 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  52.92 
 
 		 338 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  53.07 
 
 		 363 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  52.25 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  54.6 
 
 		 335 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  53.76 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  51.53 
 
 		 333 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  54.32 
 
 		 332 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  53.95 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  53.3 
 
 		 381 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5708  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  52.1 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  54.04 
 
 		 336 aa  371  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  53.89 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  54.17 
 
 		 333 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  54.9 
 
 		 334 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  52.35 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  52.73 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  52.79 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  54.32 
 
 		 332 aa  368  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  52.41 
 
 		 368 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  51.12 
 
 		 360 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  54.97 
 
 		 372 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  54.77 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.02 
 
 		 333 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  53.48 
 
 		 332 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  53.78 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.103941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>