20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4454 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4454  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  279  8.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0106  hypothetical protein  53.97 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0106  lipoprotein  53.97 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000139404 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0091  putative lipoprotein  53.17 
 
 		 137 aa  133  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428998 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0150  lipoprotein, putative  53.39 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0109  lipoprotein  51.97 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.655067  hitchhiker  0.00731713 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0042  putative lipoprotein  50.39 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0095  putative lipoprotein  47.15 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01170  hypothetical protein  49.24 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.791841  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0107  lipoprotein  43.7 
 
 		 137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0107  hypothetical protein  43.7 
 
 		 137 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0092  putative lipoprotein  42.96 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0110  lipoprotein  42.22 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.604629  normal  0.0221205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2584  lipoprotein  41.3 
 
 		 140 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.968594 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0094  putative lipoprotein  43.48 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0061  putative lipoprotein  45.24 
 
 		 145 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.704152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00730  hypothetical protein  45.24 
 
 		 145 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0062  putative lipoprotein  41.8 
 
 		 138 aa  94  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00740  putative lipoprotein  41.8 
 
 		 138 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01160  hypothetical protein  40.48 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>