288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4453 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_4453  OsmC family protein  100 
 
 
141 aa  290  6e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00710  osmotically inducible protein OsmC  70 
 
 
151 aa  209  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0059  osmotically inducible protein OsmC  70 
 
 
141 aa  208  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0089  OsmC family protein  70.5 
 
 
141 aa  201  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0104  OsmC family protein  70.5 
 
 
141 aa  201  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0104  OsmC family protein  69.78 
 
 
141 aa  200  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  5.09604e-07 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0107  OsmC family protein  68.35 
 
 
141 aa  196  1e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00369432 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01800  OsmC-like protein  62.14 
 
 
141 aa  192  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0270065  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1145  putative OsmC-like protein  66.67 
 
 
141 aa  191  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.764464  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3199  OsmC family protein  65.47 
 
 
140 aa  191  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.783352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5465  OsmC family protein  65.96 
 
 
141 aa  190  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5086  OsmC family protein  63.5 
 
 
143 aa  189  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.252827  normal  0.822138 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0040  OsmC-like protein  65.47 
 
 
143 aa  187  3e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1421  OsmC-like protein  65.67 
 
 
142 aa  187  6e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3986  OsmC-like protein  65.67 
 
 
143 aa  186  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.347334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0152  osmotically inducible protein  64.75 
 
 
143 aa  185  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0097  OsmC-like protein  65.47 
 
 
143 aa  183  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1401  OsmC-like protein  63.97 
 
 
142 aa  183  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.655956 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0488  OsmC family protein  65.19 
 
 
140 aa  183  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.358629  normal  0.188349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4674  OsmC family protein  62.32 
 
 
142 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0585  osmotically inducible protein OsmC  61.87 
 
 
140 aa  180  5e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2238  OsmC family protein  61.87 
 
 
140 aa  180  5e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.8088  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0303  OsmC-like protein  60.43 
 
 
140 aa  177  5e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.263241 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1538  OsmC-like protein  59.71 
 
 
142 aa  176  7e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316211  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1158  OsmC-like protein  56.43 
 
 
143 aa  175  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3472  OsmC family protein  60.71 
 
 
143 aa  174  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.359204  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3760  Peroxiredoxin  60.87 
 
 
143 aa  174  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5463  osmotically inducible protein OsmC  59.29 
 
 
143 aa  174  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2041  OsmC family protein  57.86 
 
 
142 aa  171  3e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.811079  normal  0.341975 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2091  Peroxiredoxin  57.14 
 
 
142 aa  169  8e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.481334  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1994  OsmC family protein  56.93 
 
 
143 aa  169  9e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.0352029 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1567  peroxiredoxin OsmC  56.74 
 
 
143 aa  169  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2175  OsmC family protein  56.74 
 
 
143 aa  169  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2165  OsmC family protein  56.74 
 
 
143 aa  169  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.294382  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01440  osmotically inducible, stress-inducible membrane protein  56.74 
 
 
143 aa  169  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21953  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1664  peroxiredoxin OsmC  56.74 
 
 
143 aa  169  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01452  hypothetical protein  56.74 
 
 
143 aa  169  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.219956  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2067  OsmC-like protein  56.03 
 
 
141 aa  169  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1745  peroxiredoxin OsmC  56.74 
 
 
143 aa  168  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234599  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2094  peroxiredoxin OsmC  56.03 
 
 
143 aa  166  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1679  peroxiredoxin OsmC  54.61 
 
 
143 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1602  peroxiredoxin OsmC  54.61 
 
 
143 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.746338  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1780  peroxiredoxin OsmC  54.61 
 
 
143 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.778339  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1740  peroxiredoxin OsmC  54.61 
 
 
143 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1677  peroxiredoxin OsmC  54.61 
 
 
143 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5223  OsmC family protein  62.41 
 
 
141 aa  163  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0610628  normal  0.18726 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2450  OsmC family protein  54.68 
 
 
143 aa  161  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2579  OsmC family protein  54.74 
 
 
143 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2261  OsmC family protein  54.74 
 
 
143 aa  158  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.427996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2304  OsmC family protein  54.74 
 
 
143 aa  157  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  hitchhiker  0.00777358 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3133  OsmC family protein  58.16 
 
 
143 aa  154  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0138842  normal  0.07408 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0924  OsmC family protein  54.41 
 
 
140 aa  153  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0381  OsmC family protein  53.96 
 
 
136 aa  151  3e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.639142 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03308  osmotically inducible protein  53.24 
 
 
144 aa  150  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271298  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0144  OsmC family protein  49.29 
 
 
141 aa  150  8e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.30653  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2374  OsmC-like protein  53.28 
 
 
142 aa  147  6e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0467379 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1691  peroxiredoxin OsmC  58.62 
 
 
116 aa  142  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0742  OsmC-like protein  50.36 
 
 
143 aa  141  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02004  peroxiredoxin OsmC  47.55 
 
 
144 aa  135  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1008  OsmC family protein  48.94 
 
 
143 aa  135  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3664  Peroxiredoxin  50 
 
 
146 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444391  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0580  OsmC-like protein  49.3 
 
 
144 aa  134  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.207251  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4150  OsmC family protein  49.65 
 
 
145 aa  134  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0007  OsmC family protein  49.65 
 
 
145 aa  134  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0009  OsmC family protein  48.94 
 
 
145 aa  132  1e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2252  osmotically inducible protein  45.14 
 
 
145 aa  132  1e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.599611  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3893  OsmC family protein  50.39 
 
 
165 aa  131  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254046  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7145  OsmC family protein  50.71 
 
 
138 aa  130  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5772  OsmC family protein  46.04 
 
 
140 aa  129  1e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.255484  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0956  OsmC family protein  47.59 
 
 
145 aa  127  4e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3240  OsmC-like protein  50.34 
 
 
146 aa  127  7e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2726  peroxiredoxin, OsmC subfamily  43.88 
 
 
138 aa  126  8e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.102217 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3272  osmotically inducible protein C  44.6 
 
 
161 aa  125  1e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2339  OsmC family protein  46.04 
 
 
136 aa  124  4e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0526  OsmC-like protein protein  42.86 
 
 
145 aa  124  4e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.455269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2586  OsmC family protein  46.04 
 
 
139 aa  123  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.32042  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4026  OsmC family protein  45.65 
 
 
138 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2899  OsmC family protein  43.57 
 
 
141 aa  117  5e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2716  peroxiredoxin, OsmC subfamily  43.88 
 
 
139 aa  117  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.126465  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0142  OsmC-like protein  41.3 
 
 
146 aa  114  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1364  OsmC family protein  43.7 
 
 
140 aa  114  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.680071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3669  OsmC family protein  48.23 
 
 
147 aa  114  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0059  redox protein, regulator of disulfide bond formation  43.97 
 
 
145 aa  112  1e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00217443  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1962  OsmC family protein  46.04 
 
 
141 aa  112  2e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000828142  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0962  OsmC family protein  43.7 
 
 
142 aa  108  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5540  peroxiredoxin, OsmC subfamily  40.56 
 
 
141 aa  107  7e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1350  OsmC family protein  42.55 
 
 
138 aa  107  8e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7122  OsmC family protein  44.62 
 
 
171 aa  106  9e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4793  peroxiredoxin, OsmC subfamily  38.46 
 
 
146 aa  104  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1108  OsmC family protein  41.73 
 
 
139 aa  103  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32410  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  40.85 
 
 
146 aa  102  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4020  OsmC family protein  40.43 
 
 
145 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216062  normal  0.10554 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2252  OsmC family protein  42.14 
 
 
142 aa  101  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.11482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6705  OsmC-like protein  42.19 
 
 
142 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252159  normal  0.84222 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1603  OsmC family protein  41.84 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85336e-11 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2104  OsmC family protein  37.76 
 
 
146 aa  99.8  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0212711  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2232  OsmC family protein  38.85 
 
 
152 aa  99.4  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7351  OsmC family protein  42.66 
 
 
142 aa  98.2  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23037 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0597  peroxiredoxin, OsmC subfamily  39.16 
 
 
146 aa  98.2  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.145779  normal  0.0478559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2843  osmotically inducible protein  42.19 
 
 
139 aa  96.7  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>