184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4423 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4423  export protein FliQ  100 
 
 		 90 aa  177  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.844817 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0215  flagellar biosynthetic protein FliQ  57.78 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0625  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.22 
 
 		 90 aa  95.9  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001179  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.93 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824092  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04966  flagellar biosynthesis pathway, component FliQ  53.93 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0240  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.22 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.331629  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0705  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.22 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00473714  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1550  flagellar biosynthesis protein FliQ  50.56 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00974617  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2171  flagellar hook-associated protein  52.81 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0090  flagellar biosynthetic protein FliQ  58.23 
 
 		 89 aa  90.5  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3985  export protein FliQ  49.4 
 
 		 89 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2297  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.16 
 
 		 89 aa  88.6  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3482  flagellar biosynthetic protein FliQ  50.62 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1512  flagellar biosynthesis protein FliQ  50.56 
 
 		 89 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294208  normal  0.120584 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4354  flagellar biosynthesis protein FliQ  50.56 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1973  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.44 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00808662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3443  flagellar biosynthesis protein FliQ  49.44 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3916  flagellar biosynthesis protein FliQ  50.56 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.413536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0166  flagellar biosynthetic protein FliQ, putative  56.67 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2286  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.31 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274745  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1704  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.25 
 
 		 89 aa  87.4  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3680  flagellar biosynthesis protein FliQ  49.44 
 
 		 89 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0305386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45760  flagellar biosynthesis protein FliQ  58.67 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3665  export protein FliQ  46.84 
 
 		 89 aa  83.6  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2565  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.19 
 
 		 89 aa  84  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1193  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.94 
 
 		 89 aa  83.6  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0084  export protein FliQ  53.16 
 
 		 89 aa  83.6  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1448  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.07 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3594  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.07 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002826  flagellar biosynthesis protein FliQ  50.65 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1293  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.07 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1360  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.07 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1353  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.07 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  0.273475 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2915  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.94 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.114624  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3057  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.94 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.554664  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2925  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.94 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832083  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03150  flagellar biosynthesis protein FliQ  47.19 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3217  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.94 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2811  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.31 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.0394695 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1337  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.7 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3880  flagellar biosynthesis protein FliQ  60 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3433  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.07 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1983  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.33 
 
 		 89 aa  76.6  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02876  flagellar biosynthesis  40.45 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3055  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.7 
 
 		 89 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341394  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1513  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.45 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1629  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4647  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.78 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189721  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3036  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.45 
 
 		 89 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.82 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.82 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  44 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  44 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.67 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.76 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.2 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0244  lateral flagellar export/assembly protein LfiQ  58.43 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.21 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3388  export protein FliQ  58.43 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.08 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2958  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.2 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1356  flagellar biosynthesis protein FliQ  50.67 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4179  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2685  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.15 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0244  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.15 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3267  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.15 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1860  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.15 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.681176  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0033  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.15 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0033  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.15 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.810295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2692  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.15 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1967  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.45 
 
 		 89 aa  60.1  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0103073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.45 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.71 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0031  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.1 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2403  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.2 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2303  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.2 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.08 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.46 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.33 
 
 		 89 aa  57  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1377  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.7 
 
 		 89 aa  57  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.986753  normal  0.259013 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1880  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.08 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4198  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.63 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0028  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.68 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0037  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.68 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0039  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.68 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0034  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.68 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.83 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0036  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.68 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0055  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.68 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2138  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.71 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1139  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.71 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00184506  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2586  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.08 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1551  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.96 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2196  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.71 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15457  normal  0.786149 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1262  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.71 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.1618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0216  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.15 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.55 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.55 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.83 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1395  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.94 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>