256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4421 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4421  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 		 123 aa  239  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.465417 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001181  flagellar motor switch protein FliN  51.22 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04968  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein  61.11 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0707  flagellar motor switch protein FliN  48.7 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00348203  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0627  flagellar motor switch protein FliN  46.49 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0238  flagellar switch protein  48.7 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.137291  normal  0.0537834 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0088  flagellar motor switch protein FliN  47 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0082  flagellar motor switch protein FliN  46.81 
 
 		 118 aa  96.7  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0246  lateral flagellar export/assembly protein LfiN  51.85 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3386  surface presentation of antigens (SPOA) protein  51.85 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3480  flagellar motor switch protein FliN  44.68 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0168  flagellar motor switch protein FliN  47.37 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3983  surface presentation of antigens (SPOA) protein  41.18 
 
 		 118 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  46.24 
 
 		 154 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  45.74 
 
 		 175 aa  85.1  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  46.24 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  46.24 
 
 		 161 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  46.24 
 
 		 154 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3663  surface presentation of antigens (SPOA) protein  48.86 
 
 		 122 aa  83.6  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  47.73 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  38.84 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  38.84 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0217  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein  52.5 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  48.75 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  42.55 
 
 		 166 aa  80.1  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  49.37 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  42.11 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  47.5 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.05 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3592  surface presentation of antigens (SPOA) protein  45.98 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  44.05 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  53.03 
 
 		 370 aa  78.6  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  35.83 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  50.68 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  44.19 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1459  flagellar motor switch protein FliN  48 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.717183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.9 
 
 		 357 aa  77.8  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  48.65 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  43.62 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  43.37 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  42.68 
 
 		 422 aa  77  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  49.32 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  42.7 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  48.48 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.95 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  45.78 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  45.78 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  42.68 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  44.59 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  43.9 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  42.5 
 
 		 401 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  43.9 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  40.66 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  43.9 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  37.62 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  44.3 
 
 		 417 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  37.62 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  42.7 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  43.9 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  43.9 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  43.9 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  43.9 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  43.9 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  44.59 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  46.58 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  42.68 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.04 
 
 		 375 aa  75.1  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  40.45 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  42.68 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  39.8 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  39.8 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  41.57 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  42.68 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  41.57 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  39.22 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  42.68 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  39.8 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  40.45 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  39.33 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  40.21 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  41.57 
 
 		 155 aa  73.6  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>