224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4332 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  100 
 
 		 439 aa  880    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1168  outer membrane porin  70.38 
 
 		 442 aa  579  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.012931  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4306  outer membrane porin  65.02 
 
 		 437 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  61.4 
 
 		 460 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  61 
 
 		 463 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31670  outer membrane porin OprE  62.33 
 
 		 445 aa  531  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  58.07 
 
 		 440 aa  525  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  59.54 
 
 		 457 aa  519  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  58.3 
 
 		 443 aa  514  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  58.91 
 
 		 439 aa  510  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  59.06 
 
 		 439 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  58.43 
 
 		 441 aa  501  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22560  OprE-like outer membrane porin  56.31 
 
 		 443 aa  482  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19070  outer membrane porin, OprE-like protein  54.95 
 
 		 442 aa  477  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5417  outer membrane porin  56.64 
 
 		 447 aa  477  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0532754  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10640  OprE-like outer membrane porin  51.42 
 
 		 456 aa  442  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0112866  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0258  outer membrane porin  53.36 
 
 		 442 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103273  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0234  outer membrane porin  52.6 
 
 		 444 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151017  decreased coverage  0.000172994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0249  outer membrane porin  51.84 
 
 		 446 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00208088  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2927  outer membrane porin OprE  50.23 
 
 		 443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534215  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4878  outer membrane porin  49.46 
 
 		 448 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4978  outer membrane porin  50.11 
 
 		 443 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000630026  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  46.71 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5318  outer membrane porin, OprD family  49.32 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  46.49 
 
 		 421 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  47.34 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  46.31 
 
 		 427 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  45.18 
 
 		 422 aa  357  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  44.39 
 
 		 417 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  44.16 
 
 		 417 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  43.43 
 
 		 418 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  44.26 
 
 		 429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  43.41 
 
 		 429 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  43.53 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  43.79 
 
 		 429 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  44.16 
 
 		 417 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  43.05 
 
 		 421 aa  332  6e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1456  outer membrane porin  43.15 
 
 		 408 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  42.92 
 
 		 421 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  42.08 
 
 		 416 aa  319  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  42.28 
 
 		 418 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  42.52 
 
 		 418 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  39.17 
 
 		 423 aa  312  7.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  42.63 
 
 		 416 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1363  outer membrane porin  41.31 
 
 		 408 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475695  normal  0.0504292 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  40.94 
 
 		 412 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  45 
 
 		 409 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  44.76 
 
 		 409 aa  310  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3341  outer membrane porin  43.99 
 
 		 437 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  39.78 
 
 		 420 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  41.39 
 
 		 416 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  42.86 
 
 		 410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  40.46 
 
 		 417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  43.75 
 
 		 415 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  41.61 
 
 		 416 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  39.41 
 
 		 420 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  39.55 
 
 		 411 aa  302  8.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  41.39 
 
 		 416 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  41.96 
 
 		 417 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  42.19 
 
 		 410 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  41.07 
 
 		 416 aa  299  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  42.19 
 
 		 410 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  37.81 
 
 		 427 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  40.22 
 
 		 418 aa  295  9e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4465  porin, putative  41.28 
 
 		 450 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  39.86 
 
 		 416 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  40.72 
 
 		 416 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  41.23 
 
 		 418 aa  294  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  40.5 
 
 		 419 aa  292  9e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  41 
 
 		 418 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  41.23 
 
 		 418 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  37.19 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  41.23 
 
 		 418 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  38.32 
 
 		 417 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  39.82 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  39.18 
 
 		 416 aa  289  8e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  40.22 
 
 		 427 aa  289  8e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  39.64 
 
 		 417 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  35.83 
 
 		 433 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  37.14 
 
 		 426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15150  outer membrane porin  40.6 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.350785  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  38.94 
 
 		 412 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  38.53 
 
 		 412 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  37.53 
 
 		 433 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  36.05 
 
 		 433 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  36.28 
 
 		 429 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14210  outer membrane porin  40.14 
 
 		 423 aa  283  6.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  38.25 
 
 		 412 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  38.8 
 
 		 417 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  38.6 
 
 		 431 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  38.25 
 
 		 412 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  39.44 
 
 		 395 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  38.22 
 
 		 417 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  37.7 
 
 		 431 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  39.39 
 
 		 422 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  37.61 
 
 		 413 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  38.05 
 
 		 440 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  38.34 
 
 		 415 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  36.71 
 
 		 424 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  38.04 
 
 		 430 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.6739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>