More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4329 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4329  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.413281  normal  0.920294 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19520  ABC transporter ATP-binding protein  71.89 
 
 		 249 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1680  ABC transporter ATP-binding protein  71.89 
 
 		 249 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2786  ABC transporter, ATP-binding protein  62.23 
 
 		 232 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0961461  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2514  ABC transporter  60.74 
 
 		 237 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  54.69 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  52.3 
 
 		 270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  52.3 
 
 		 270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7505  ABC transporter, ATPase subunit  52.72 
 
 		 273 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000247297  normal  0.575396 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6344  ABC transporter related  51.04 
 
 		 270 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  52.17 
 
 		 276 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  49.8 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0779  ABC transporter related  50.21 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  44.26 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  47.72 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.28 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  45.23 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  47.3 
 
 		 252 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.88 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  42.62 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  44.94 
 
 		 269 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.81 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0528  ABC transporter related  43.15 
 
 		 247 aa  192  4e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2893  ABC transporter related  46.4 
 
 		 259 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  44.49 
 
 		 247 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  41.91 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  45.31 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  43.67 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  45.31 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  47.06 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  48.44 
 
 		 281 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  47.86 
 
 		 281 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5824  ABC transporter related  46.35 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.971522  normal  0.461602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  46.61 
 
 		 259 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  43.39 
 
 		 269 aa  188  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  43.67 
 
 		 262 aa  188  8e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  48.26 
 
 		 281 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  48.26 
 
 		 281 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.16 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  47.73 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  43.27 
 
 		 261 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  40.82 
 
 		 271 aa  185  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  42.55 
 
 		 265 aa  185  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4965  ABC transporter related  50 
 
 		 253 aa  184  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  42.04 
 
 		 265 aa  184  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  42.8 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  41.04 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  43.32 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  45.37 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  40.77 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  40.77 
 
 		 287 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  40 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.77 
 
 		 251 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  40.77 
 
 		 251 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  44.25 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  40.34 
 
 		 251 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  44.69 
 
 		 285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  44.74 
 
 		 269 aa  181  7e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19370  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  43.82 
 
 		 326 aa  181  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  45.7 
 
 		 260 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  42.98 
 
 		 260 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  45.7 
 
 		 259 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  41.74 
 
 		 258 aa  180  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  44.08 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  41.98 
 
 		 287 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  45.18 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  43.72 
 
 		 255 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  41.87 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  46.02 
 
 		 298 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1866  ABC transporter related  44.39 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7222  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.04 
 
 		 245 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  42.32 
 
 		 262 aa  178  9e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.35 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  38.93 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  41.87 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0238  ABC sulfate ester transporter, ATPase subunit  46.22 
 
 		 286 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  40 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21610  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP binding component  48.62 
 
 		 266 aa  176  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1384  ABC transporter related protein  48.02 
 
 		 277 aa  176  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0283767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2407  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.64 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  39.6 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  43.61 
 
 		 286 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.78 
 
 		 281 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3745  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.91 
 
 		 264 aa  175  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.105964 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  40 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4520  ABC transporter related  45.06 
 
 		 249 aa  175  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.719426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  45.16 
 
 		 259 aa  175  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4494  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.68 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  46.15 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2628  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.68 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.197945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1758  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43.02 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.228695  normal  0.0130766 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4957  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.68 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0893912  normal  0.168509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0465  ABC transporter related protein  46.98 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  41.49 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5010  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.07 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.453812  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  41.74 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2907  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.86 
 
 		 262 aa  172  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.98485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1539  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.34 
 
 		 264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  45.78 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>