265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4326 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_4326  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
151 aa  306  5e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0904  GCN5-related N-acetyltransferase  52.45 
 
 
148 aa  152  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2430  GCN5-related N-acetyltransferase  50.35 
 
 
148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0974186  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2550  GCN5-related N-acetyltransferase  50.35 
 
 
148 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0491515 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1927  GCN5-related N-acetyltransferase  49.67 
 
 
158 aa  149  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2437  GCN5-related N-acetyltransferase  50.35 
 
 
148 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3260  GCN5-related N-acetyltransferase  48.94 
 
 
232 aa  147  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0686  GCN5-related N-acetyltransferase  47.53 
 
 
183 aa  130  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1632  acetyltransferase, GNAT family  45.58 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2857  YvbK  41.61 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.640818  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0460  putative acetyltransferase  46.94 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1743  acetyltransferase, GNAT family  42.86 
 
 
152 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000234537  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1928  GCN5-related N-acetyltransferase  42.65 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1453  acetyltransferase  40.67 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1496  GCN5-related N-acetyltransferase  44.93 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1703  acetyltransferase  41.5 
 
 
155 aa  118  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.579377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3713  acetyltransferase, GNAT family  44.93 
 
 
153 aa  118  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1480  acetyltransferase  44.14 
 
 
155 aa  117  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1597  acetyltransferase  44.14 
 
 
155 aa  117  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1667  acetyltransferase, GNAT family  42 
 
 
155 aa  117  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1453  acetyltransferase  42.18 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5666  GCN5-related N-acetyltransferase  41.61 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670708 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1308  GCN5-related N-acetyltransferase  45.04 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0432  GCN5-related N-acetyltransferase  36.88 
 
 
171 aa  97.4  6e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1410  GCN5-related N-acetyltransferase  37.78 
 
 
160 aa  93.6  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0615  acetyltransferase  29.1 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1023  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
172 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1238  GCN5-related N-acetyltransferase  30.58 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2618  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
221 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.258256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0578  acetyltransferase-like  36.84 
 
 
167 aa  54.3  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0334685 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  33.96 
 
 
184 aa  54.7  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2122  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.89 
 
 
153 aa  53.9  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4636  GCN5-related N-acetyltransferase  37.08 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  40.54 
 
 
160 aa  52  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  43.94 
 
 
153 aa  51.2  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3562  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
162 aa  50.8  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  28.21 
 
 
164 aa  50.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.207035  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1986  acetyltransferase  27.4 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.457111  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4337  GCN5-related N-acetyltransferase  34.34 
 
 
168 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.473125 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1982  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  32.31 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.615427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1757  GCN5-related N-acetyltransferase  33.04 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  38.75 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2153  FkbH like protein  28.36 
 
 
625 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2927  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 
310 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.56 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4451  acetyltransferase  31.33 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346737  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0740  acetyltransferase  33.33 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000824265  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0098  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1552  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.36 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2401  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.61 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.380338  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0991  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  34.74 
 
 
150 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0274305  hitchhiker  0.00000000584057 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.52 
 
 
161 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00988632 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5084  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.11 
 
 
180 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3716  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.81 
 
 
151 aa  47.4  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0086441  hitchhiker  0.00862742 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0741  acetyltransferase  31.25 
 
 
151 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.296931  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6442  GCN5-related N-acetyltransferase  33.67 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  32.97 
 
 
309 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.52 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.291315  normal  0.765144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2038  GCN5-related N-acetyltransferase  35.82 
 
 
211 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.400224  hitchhiker  0.00548732 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01560  N-acetylglutamate synthase  29.13 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0884  acetyltransferase  30 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0173017  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0868  ribosomal-protein-S18-alanine acetyltransferase  37.88 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0791  acetyltransferase  33.33 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000699744  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2081  GNAT family acetyltransferase  34.57 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1148  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.88 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0831  acetyltransferase  33.33 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000546377  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0995  acetyltransferase  32.14 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  35.11 
 
 
316 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1839  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.804646  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0611  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  32.94 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  35.44 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1443  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  34.38 
 
 
788 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0561507 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0392  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1094  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1547  GCN5-related N-acetyltransferase  38.2 
 
 
164 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.560238 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0921  acetyltransferase  30.95 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0727  acetyltransferase  32 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000686887  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0876  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.24 
 
 
221 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442348  normal  0.095301 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5576  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0930  GCN5-related N-acetyltransferase  33.87 
 
 
164 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5940  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1203  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
172 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.181413 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0828  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  32.94 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141904  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02910  Acetyltransferase  37.14 
 
 
170 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0926  acetyltransferase  32 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.3472299999999997e-49 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2741  GCN5-related N-acetyltransferase  39.06 
 
 
181 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432705  normal  0.0282239 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2571  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.65 
 
 
314 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.808395  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2383  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.82 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675937  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
316 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4320  GCN5-related N-acetyltransferase  37.33 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.433453  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2196  GCN5-related N-acetyltransferase  36.9 
 
 
172 aa  44.3  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3709  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.43 
 
 
213 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000200619  unclonable  0.000000018593 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0461  protein of unknown function DUF699, ATPase putative  32.81 
 
 
788 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.340301  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0697  acetyltransferase  33.33 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0987  GCN5-related N-acetyltransferase  39.58 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0189  GCN5-related N-acetyltransferase  37.74 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0797  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
157 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.64156  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5807  hypothetical protein  36.26 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42420  acetylating ribosomal protein, RimI  38.03 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  31.46 
 
 
160 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>