More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4311 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1291 aa  2626  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.81 
 
 
640 aa  345  4e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.63 
 
 
1363 aa  326  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.31 
 
 
953 aa  311  6e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 
1207 aa  311  7e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  65.56 
 
 
965 aa  304  7e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.9 
 
 
1768 aa  295  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
1765 aa  295  6e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 
1771 aa  291  5e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.11 
 
 
1767 aa  289  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45 
 
 
799 aa  289  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.11 
 
 
1767 aa  290  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  30.18 
 
 
1765 aa  288  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  30.43 
 
 
1763 aa  285  3e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.74 
 
 
1767 aa  286  3e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.19 
 
 
839 aa  282  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4104  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.01 
 
 
557 aa  276  1e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 
1792 aa  276  2e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 
1782 aa  275  5e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 
1786 aa  273  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.18 
 
 
1784 aa  273  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  33.9 
 
 
1255 aa  272  3e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.82 
 
 
929 aa  261  7e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  32.84 
 
 
823 aa  254  5e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 
933 aa  253  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  3.59369e-05 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  32.71 
 
 
1629 aa  254  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.78 
 
 
1075 aa  250  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.18 
 
 
1088 aa  249  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 
904 aa  245  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4049  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 
553 aa  241  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.92854 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.36 
 
 
906 aa  229  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.16 
 
 
638 aa  229  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.230801  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.16 
 
 
955 aa  225  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 
1255 aa  226  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2140  fused multi-sensor protein  35.03 
 
 
882 aa  225  5e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.236911  normal  0.359885 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.71 
 
 
874 aa  224  7e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.16 
 
 
1245 aa  224  8e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5316  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.42 
 
 
1069 aa  223  1e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72275  normal  0.481403 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 
1060 aa  222  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 
1002 aa  220  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 
1109 aa  220  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.52 
 
 
1596 aa  219  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2969  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
634 aa  217  1e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.163827 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.82 
 
 
1369 aa  217  1e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 
1043 aa  216  2e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3690  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
833 aa  215  5e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.782884 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1160  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 
829 aa  215  5e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.380489 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2855  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
712 aa  213  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 
1043 aa  213  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
697 aa  212  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.9 
 
 
1029 aa  212  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.48 
 
 
1560 aa  211  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.52 
 
 
1501 aa  209  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.58 
 
 
681 aa  208  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 
866 aa  207  8e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
896 aa  207  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 
979 aa  207  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 
1069 aa  207  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
637 aa  206  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3675  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 
966 aa  205  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.66 
 
 
634 aa  205  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
484 aa  205  5e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
526 aa  205  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.81 
 
 
1297 aa  204  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2116  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
524 aa  204  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 
1548 aa  204  9e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2025  two component sensor histidine kinase  29.08 
 
 
613 aa  203  2e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
373 aa  202  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0857  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 
698 aa  201  6e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0897898 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
510 aa  200  2e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1434  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.64 
 
 
1186 aa  198  4e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 
973 aa  198  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3463  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 
1333 aa  198  7e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.245922 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
630 aa  197  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0888009 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
631 aa  197  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.172451  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  34.58 
 
 
762 aa  196  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2578  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 
527 aa  196  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376758  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
515 aa  195  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.99 
 
 
1120 aa  195  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 
881 aa  195  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 
969 aa  195  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.15 
 
 
926 aa  194  7e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.18 
 
 
1643 aa  194  9e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2345  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 
509 aa  194  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.1 
 
 
1068 aa  193  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
1026 aa  192  3e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 
801 aa  192  3e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2015  putative PAS/PAC sensor protein  32.46 
 
 
1119 aa  192  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  6.73901e-05 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 
503 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2409  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.5 
 
 
729 aa  190  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.798311  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  24.89 
 
 
1328 aa  190  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282055  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 
568 aa  189  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 
1101 aa  189  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.114215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1704  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.49 
 
 
1168 aa  190  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
1433 aa  190  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2459  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
514 aa  189  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2450  PAS sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 
499 aa  189  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.42 
 
 
1535 aa  189  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 
916 aa  189  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
1178 aa  188  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>