262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4286 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4286  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 303 aa  607  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.131233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3008  glycosyl transferase  78.88 
 
 		 303 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3560  glycosyl transferase family protein  49 
 
 		 306 aa  278  9e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480294  normal  0.632112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4927  glycosyl transferase family 2  43.19 
 
 		 309 aa  271  9e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640418  normal  0.791087 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2210  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  45.57 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149934  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2354  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.84 
 
 		 308 aa  268  8e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218636  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2313  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  45.25 
 
 		 314 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0276977 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2424  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  45.25 
 
 		 314 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.126367  hitchhiker  0.000645643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2311  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  45.25 
 
 		 314 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0283502  normal  0.0363291 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2138  glycosyl transferase family protein  48.18 
 
 		 308 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.177505  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1578  glycosyl transferase family 2  41.06 
 
 		 305 aa  264  2e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0085  glycosyl transferase family 2  46.69 
 
 		 308 aa  262  6e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0285695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0082  O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase, putative  46.69 
 
 		 308 aa  262  6e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19572  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0841  glycosyl transferase family protein  39.93 
 
 		 306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.913833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2861  glycosyl transferase family 2  43.32 
 
 		 305 aa  229  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2189  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.8 
 
 		 303 aa  227  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016555  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4142  glycosyl transferase family 2  35.1 
 
 		 313 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3103  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.532387  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0596  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.69 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.300556  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  28.19 
 
 		 1162 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5865  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  28.1 
 
 		 1161 aa  82.4  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4770  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0047  glycosyl transferase family 2  24.55 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 		 1061 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0045  glycosyl transferase family 2  24.55 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.288326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3109  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2839  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0441317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 235 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0478  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  24.2 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3090  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.933883  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.84 
 
 		 610 aa  58.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.54 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.28 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3219  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3933  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3641  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.91 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2846  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3554  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 		 227 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.413559  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 		 1486 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2444  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 		 340 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  23.2 
 
 		 308 aa  53.9  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0372  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 		 381 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0194499  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2528  glycosyl transferase family 2  23.55 
 
 		 307 aa  53.9  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.591132  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1662  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.363785  hitchhiker  0.00433752 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  27.1 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  24.34 
 
 		 328 aa  53.1  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 336 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 		 360 aa  53.1  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  21.53 
 
 		 345 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 		 597 aa  52.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  29.2 
 
 		 267 aa  52.8  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  23.87 
 
 		 335 aa  52.8  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 1032 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 		 311 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  25.46 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  25.56 
 
 		 337 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 		 748 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 		 756 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3955  glycosyl transferase family protein  23.96 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  23.85 
 
 		 333 aa  50.8  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1198  glycosyl transferase family protein  21.76 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3563  glycosyl transferase family 2  25.81 
 
 		 242 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365642  normal  0.553979 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 		 365 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1777  glycosyl transferase family 2  49.15 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0109155 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0140  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3138  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 236 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  24.8 
 
 		 1152 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 332 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  24.8 
 
 		 1152 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0628  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 		 280 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  23.01 
 
 		 501 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3231  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 		 316 aa  49.7  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000094491  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 		 470 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1519  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  22.97 
 
 		 339 aa  49.7  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  36.04 
 
 		 225 aa  49.7  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 		 325 aa  49.7  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  23.74 
 
 		 377 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2577  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 		 325 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 		 290 aa  49.3  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  23.77 
 
 		 322 aa  49.3  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3137  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.16 
 
 		 325 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  22.97 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4024  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 		 331 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0043  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  23.08 
 
 		 282 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 		 365 aa  48.5  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0584  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 		 481 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>