More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4248 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  77.55 
 
 		 438 aa  667    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  75.78 
 
 		 445 aa  670    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  76.91 
 
 		 445 aa  657    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  76.59 
 
 		 439 aa  648    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  81.75 
 
 		 436 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 438 aa  880    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  78.18 
 
 		 438 aa  669    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  83.29 
 
 		 439 aa  674    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  77.55 
 
 		 438 aa  667    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  82 
 
 		 436 aa  654    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  79.04 
 
 		 437 aa  664    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  58.47 
 
 		 439 aa  491  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  62.44 
 
 		 468 aa  478  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  57.01 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  57.71 
 
 		 439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  55.1 
 
 		 441 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  55.93 
 
 		 462 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  58.81 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  53.97 
 
 		 476 aa  450  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  54.23 
 
 		 446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  54.25 
 
 		 468 aa  442  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  58.33 
 
 		 428 aa  443  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  56.82 
 
 		 426 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  51.26 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  51.26 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  57.1 
 
 		 481 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  49.37 
 
 		 480 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  49.53 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  51.76 
 
 		 443 aa  411  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  48.26 
 
 		 443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  52.44 
 
 		 450 aa  405  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  54.29 
 
 		 482 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  54.29 
 
 		 482 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  50.75 
 
 		 455 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  53.65 
 
 		 483 aa  400  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  48.09 
 
 		 452 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  51.38 
 
 		 444 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  51.35 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  52.81 
 
 		 457 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  52.54 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  49.76 
 
 		 442 aa  388  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  48.05 
 
 		 438 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  51.35 
 
 		 424 aa  387  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  51.13 
 
 		 444 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  48.48 
 
 		 461 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  51.15 
 
 		 451 aa  373  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  52.17 
 
 		 423 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  52.15 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  45.91 
 
 		 444 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  48.48 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  49.63 
 
 		 447 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  51.91 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  50.97 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  47.18 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  48.8 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  51.03 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  47.94 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  50.38 
 
 		 458 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  47.07 
 
 		 444 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  50.25 
 
 		 456 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  47.56 
 
 		 440 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  48.3 
 
 		 445 aa  365  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  47.45 
 
 		 440 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  47.36 
 
 		 433 aa  365  1e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  47 
 
 		 422 aa  363  3e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  50.64 
 
 		 452 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  44.92 
 
 		 515 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  46.77 
 
 		 478 aa  363  5.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  48.22 
 
 		 498 aa  361  1e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  46.73 
 
 		 480 aa  361  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  49.63 
 
 		 448 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  46.8 
 
 		 479 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  46.3 
 
 		 479 aa  361  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  44.8 
 
 		 478 aa  360  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  43.96 
 
 		 477 aa  361  2e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  49.63 
 
 		 448 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  49.62 
 
 		 457 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  46.42 
 
 		 478 aa  359  4e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  45.36 
 
 		 530 aa  359  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  46.42 
 
 		 478 aa  359  6e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  44.35 
 
 		 515 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  44.35 
 
 		 515 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  44.35 
 
 		 515 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  45.31 
 
 		 515 aa  358  9e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  43.64 
 
 		 456 aa  358  9.999999999999999e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  42.92 
 
 		 477 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  45.96 
 
 		 479 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  50.5 
 
 		 445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  45.68 
 
 		 524 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  45.68 
 
 		 524 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  45.68 
 
 		 524 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  45.68 
 
 		 530 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  45.68 
 
 		 524 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  45.68 
 
 		 530 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  45.68 
 
 		 524 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  49.1 
 
 		 440 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  49.1 
 
 		 440 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  46.4 
 
 		 481 aa  356  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  43.42 
 
 		 456 aa  356  3.9999999999999996e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  45.37 
 
 		 521 aa  356  5e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>