More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4193 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_03460  Gamma-glutamyltranspeptidase precursor  71.64 
 
 		 567 aa  680    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170484  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4193  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 552 aa  1097    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04730  putative gamma-glutamyltranspeptidase precursor  66.67 
 
 		 577 aa  682    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0455  putative gamma-glutamyltranspeptidase precursor  66.85 
 
 		 577 aa  684    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0300  gamma-glutamyltransferase  54.03 
 
 		 596 aa  501  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2148  gamma-glutamyltranspeptidase  53.47 
 
 		 576 aa  500  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2654  gamma-glutamyltransferase 1  52.73 
 
 		 553 aa  500  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302654 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0093  gamma-glutamyltransferase  52.49 
 
 		 567 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0769  gamma-glutamyltransferase  52.62 
 
 		 557 aa  450  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.303985  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0610  hypothetical protein  49.26 
 
 		 574 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0591  hypothetical protein  49.44 
 
 		 574 aa  433  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00307  gamma-glutamyltransferase  48.55 
 
 		 597 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.777072  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0271  gamma-glutamyltransferase  48.26 
 
 		 603 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.752949  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0301  gamma-glutamyltransferase  48.07 
 
 		 603 aa  418  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1553  gamma-glutamyltransferase  47.51 
 
 		 576 aa  402  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  40.95 
 
 		 587 aa  352  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4299  gamma-glutamyltransferase  39.73 
 
 		 576 aa  346  6e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4409  gamma-glutamyltransferase  39.73 
 
 		 576 aa  346  6e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  41.68 
 
 		 587 aa  343  4e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  39.2 
 
 		 587 aa  343  5e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3386  gamma-glutamyltransferase  40.68 
 
 		 579 aa  342  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  39.02 
 
 		 587 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1625  gamma-glutamyltransferase  40.99 
 
 		 578 aa  341  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441001  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  40.11 
 
 		 578 aa  340  4e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  41.7 
 
 		 575 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  39.55 
 
 		 575 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  40.23 
 
 		 575 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  39.06 
 
 		 583 aa  334  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  40.53 
 
 		 592 aa  334  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  38.87 
 
 		 583 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1057  gamma-glutamyltransferase  38.26 
 
 		 587 aa  332  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3041  gamma-glutamyltransferase  42.07 
 
 		 574 aa  331  2e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  39.2 
 
 		 597 aa  331  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  38.68 
 
 		 583 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5529  gamma-glutamyltransferase  39.36 
 
 		 583 aa  331  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383086  normal  0.95621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3613  gamma-glutamyltransferase  39.36 
 
 		 583 aa  331  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4754  gamma-glutamyltransferase  39.36 
 
 		 583 aa  331  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.436981 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3091  gamma-glutamyltransferase 1  38.17 
 
 		 593 aa  324  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000120341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  36.98 
 
 		 583 aa  321  3e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  36.31 
 
 		 599 aa  320  5e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  38.4 
 
 		 581 aa  319  7.999999999999999e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  35.74 
 
 		 582 aa  319  9e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0026  gamma-glutamyltransferase  37.11 
 
 		 599 aa  318  1e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.165843  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  38.23 
 
 		 604 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3580  gamma-glutamyltransferase  38.29 
 
 		 578 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.229628 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  36.05 
 
 		 581 aa  317  5e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3281  gamma-glutamyltransferase  37.75 
 
 		 578 aa  316  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  36.92 
 
 		 579 aa  316  7e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  36.92 
 
 		 579 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1134  gamma-glutamyltransferase  39.27 
 
 		 573 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.105018  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  36.92 
 
 		 579 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  36.92 
 
 		 579 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  35.37 
 
 		 579 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  37.06 
 
 		 580 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4414  gamma-glutamyltransferase  38.99 
 
 		 573 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  37.1 
 
 		 617 aa  315  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  36.87 
 
 		 580 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  36.62 
 
 		 579 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0996  gamma-glutamyltranspeptidase  38.56 
 
 		 573 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.030898  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  37.45 
 
 		 590 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0371  gamma-glutamyltranspeptidase  38.56 
 
 		 573 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.220904  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1328  gamma-glutamyltranspeptidase  38.56 
 
 		 573 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600638  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0268  gamma-glutamyltranspeptidase  38.56 
 
 		 573 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0755298  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  39.66 
 
 		 586 aa  313  6.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  36.11 
 
 		 556 aa  313  6.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0297  gamma-glutamyltransferase  38.56 
 
 		 573 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.58924  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1739  gamma-glutamyltransferase  38.56 
 
 		 573 aa  312  9e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1823  gamma-glutamyltransferase  38.56 
 
 		 573 aa  312  9e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.496785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  35.07 
 
 		 577 aa  311  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  36.38 
 
 		 579 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  36.38 
 
 		 579 aa  311  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1850  gamma-glutamyltransferase 1  38.81 
 
 		 573 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.186583 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4199  gamma-glutamyltransferase  38.92 
 
 		 586 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3336  gamma-glutamyltransferase  38.92 
 
 		 573 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4407  gamma-glutamyltransferase  38.61 
 
 		 579 aa  311  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4599  gamma-glutamyltransferase 1  38.3 
 
 		 583 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.88152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4185  gamma-glutamyltransferase  38.92 
 
 		 573 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  36.87 
 
 		 580 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4181  gamma-glutamyltransferase  38.92 
 
 		 573 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  36.87 
 
 		 580 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4506  gamma-glutamyltransferase  37.34 
 
 		 560 aa  311  2.9999999999999997e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  36.2 
 
 		 579 aa  310  4e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  34.83 
 
 		 581 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  35.92 
 
 		 556 aa  309  9e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  36.99 
 
 		 581 aa  309  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2484  gamma-glutamyltransferase  39.12 
 
 		 557 aa  308  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5927  gamma-glutamyltransferase  36.55 
 
 		 566 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.779153  normal  0.531425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  34.48 
 
 		 581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  37.34 
 
 		 645 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3593  gamma-glutamyltransferase  38.38 
 
 		 573 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  37.34 
 
 		 645 aa  307  3e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4068  gamma-glutamyltransferase  37.91 
 
 		 573 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00343231  normal  0.979894 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  36.5 
 
 		 580 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  36.06 
 
 		 580 aa  306  6e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  36.06 
 
 		 580 aa  306  6e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  37.74 
 
 		 606 aa  306  6e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  36.06 
 
 		 580 aa  306  6e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  36.06 
 
 		 580 aa  306  6e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  36.59 
 
 		 583 aa  306  6e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0909  gamma-glutamyltransferase 1  37.8 
 
 		 590 aa  306  9.000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.591211  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>