296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4037 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  877    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  68.78 
 
 		 425 aa  591  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  55.64 
 
 		 430 aa  465  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  57.74 
 
 		 428 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  54.61 
 
 		 437 aa  457  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  53.03 
 
 		 429 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  54.18 
 
 		 429 aa  440  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  52.22 
 
 		 415 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  51.99 
 
 		 415 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  56.39 
 
 		 423 aa  436  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  54.09 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  50 
 
 		 423 aa  430  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  53.69 
 
 		 415 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  55.18 
 
 		 412 aa  426  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  54.81 
 
 		 425 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  52.44 
 
 		 434 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  51.98 
 
 		 434 aa  423  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  52.54 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  53.37 
 
 		 437 aa  421  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  50.12 
 
 		 438 aa  418  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  53.26 
 
 		 423 aa  418  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  53.33 
 
 		 455 aa  416  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  51.91 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  53.61 
 
 		 426 aa  417  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  52.09 
 
 		 434 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2198  hypothetical protein  51.44 
 
 		 430 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.687094 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  52.49 
 
 		 437 aa  414  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  50.97 
 
 		 425 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  50.69 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  53.59 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  50.12 
 
 		 723 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3090  hypothetical protein  52.13 
 
 		 470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2450  protein of unknown function DUF323  53.77 
 
 		 433 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00600286  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1759  hypothetical protein  49.77 
 
 		 459 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1795  protein of unknown function DUF323  50.74 
 
 		 417 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0782  hypothetical protein  51.61 
 
 		 422 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421239  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3705  hypothetical protein  50.97 
 
 		 418 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  49.76 
 
 		 425 aa  394  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  48.37 
 
 		 408 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1598  hypothetical protein  49.39 
 
 		 419 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.785472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1379  hypothetical protein  50.34 
 
 		 426 aa  391  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5394  hypothetical protein  49.75 
 
 		 417 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  46.21 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0023  hypothetical protein  48.83 
 
 		 404 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  50.93 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01891  hypothetical protein  50.49 
 
 		 393 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4446  protein of unknown function DUF323  47.46 
 
 		 388 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13318  hypothetical protein  45.81 
 
 		 386 aa  381  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2546  protein of unknown function DUF323  51.76 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  47.07 
 
 		 383 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1407  hypothetical protein  51.92 
 
 		 433 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  47.78 
 
 		 385 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1640  hypothetical protein  48.04 
 
 		 418 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3413  protein of unknown function DUF323  49.63 
 
 		 420 aa  376  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0015  hypothetical protein  48.48 
 
 		 414 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  50.71 
 
 		 453 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2288  hypothetical protein  49.52 
 
 		 411 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1713  domain of unknown function  49.28 
 
 		 411 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  46.32 
 
 		 427 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0964  hypothetical protein  49.52 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1311  hypothetical protein  46.56 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3207  hypothetical protein  47.79 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  44.16 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3660  protein of unknown function DUF323  51.06 
 
 		 418 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  50.12 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0022  hypothetical protein  48.6 
 
 		 408 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0048  hypothetical protein  48.36 
 
 		 408 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0356  protein of unknown function DUF323  49.26 
 
 		 418 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.199231  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0040  hypothetical protein  48.36 
 
 		 408 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.793849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1050  hypothetical protein  49.29 
 
 		 451 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0030  hypothetical protein  50.7 
 
 		 448 aa  363  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.434852 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2253  hypothetical protein  48.28 
 
 		 419 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201022  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3218  hypothetical protein  48.51 
 
 		 420 aa  359  4e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3542  protein of unknown function DUF323  48.51 
 
 		 420 aa  359  6e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0159  hypothetical protein  47.89 
 
 		 383 aa  356  2.9999999999999997e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0115  hypothetical protein  47.89 
 
 		 386 aa  353  4e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.280848  normal  0.0377747 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  46.27 
 
 		 398 aa  351  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  42.79 
 
 		 412 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  37.1 
 
 		 436 aa  317  2e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  35.62 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  34.03 
 
 		 442 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  34.07 
 
 		 447 aa  192  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  34.89 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  32.95 
 
 		 444 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  32.82 
 
 		 444 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  33.33 
 
 		 468 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  34.14 
 
 		 433 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  33.17 
 
 		 442 aa  177  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  33.18 
 
 		 436 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  33.18 
 
 		 436 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  33.18 
 
 		 436 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  34.83 
 
 		 487 aa  176  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  37.66 
 
 		 506 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  33.03 
 
 		 437 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  31.67 
 
 		 444 aa  169  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  30.79 
 
 		 437 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  31.71 
 
 		 446 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  33.71 
 
 		 425 aa  160  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  31.1 
 
 		 446 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  33.17 
 
 		 374 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>