170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4014 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4014  ApaG  100 
 
 		 126 aa  259  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0550  apaG protein  80.95 
 
 		 126 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589067  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0400  ApaG  78.57 
 
 		 126 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0434  ApaG  78.57 
 
 		 126 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0431  ApaG  78.57 
 
 		 126 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.425394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4628  ApaG  76.19 
 
 		 133 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4802  ApaG  75.4 
 
 		 126 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5136  ApaG  75.4 
 
 		 126 aa  208  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46840  ApaG  76.98 
 
 		 126 aa  205  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07710  ApaG  73.81 
 
 		 126 aa  194  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0202441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0735  ApaG  73.02 
 
 		 126 aa  191  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2231  ApaG  59.84 
 
 		 127 aa  156  7e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.340232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2335  ApaG  56.35 
 
 		 126 aa  152  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0904  ApaG  57.98 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.764534  normal  0.43881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3116  ApaG  57.98 
 
 		 126 aa  151  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3484  ApaG  55.12 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526547  normal  0.166283 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2820  ApaG  57.14 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2722  ApaG domain protein  57.02 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3210  ApaG  56.3 
 
 		 126 aa  148  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0976  ApaG  55.56 
 
 		 126 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13666  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1045  ApaG  55.56 
 
 		 126 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.102627  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3314  ApaG  55.56 
 
 		 126 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0988  ApaG  53.97 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233116  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1050  ApaG  56.56 
 
 		 124 aa  147  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  0.737772 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1078  ApaG  54.76 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.804618  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3640  ApaG  53.97 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1346  ApaG  52.76 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.637296  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2636  ApaG  54.4 
 
 		 127 aa  145  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04646  ApaG  52 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854079  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2878  ApaG  54.1 
 
 		 124 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.289279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2372  ApaG  55.74 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0420  ApaG domain protein  58.26 
 
 		 211 aa  144  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.416529 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3413  ApaG  52.07 
 
 		 127 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3120  ApaG  53.66 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802006  normal  0.119699 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2755  ApaG  53.66 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.263263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0222  ApaG  54.69 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2857  ApaG  54.92 
 
 		 124 aa  140  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.93069  normal  0.818828 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0464  ApaG  52.46 
 
 		 124 aa  140  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3493  ApaG  52.46 
 
 		 124 aa  140  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00288381  decreased coverage  0.0000301407 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1289  ApaG  48.8 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0536  ApaG  53.28 
 
 		 124 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.680201  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0466  ApaG  53.28 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.357414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1353  ApaG  48.8 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.214186  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2695  ApaG  51.64 
 
 		 124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.911706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3080  ApaG  54.76 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0442  ApaG  53.28 
 
 		 124 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0641  ApaG  53.28 
 
 		 124 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1982  ApaG domain protein  52.31 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0937  ApaG  53.28 
 
 		 124 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3552  ApaG  53.28 
 
 		 124 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144794  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3579  ApaG  53.28 
 
 		 124 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1907  ApaG  53.28 
 
 		 124 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0861  ApaG  51.26 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3624  ApaG  53.28 
 
 		 124 aa  138  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2906  ApaG  53.28 
 
 		 185 aa  138  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.809331  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2568  ApaG  53.28 
 
 		 124 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0537  ApaG  53.28 
 
 		 124 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3571  ApaG  53.28 
 
 		 185 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0667  ApaG  52.07 
 
 		 135 aa  137  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0509  ApaG  53.28 
 
 		 124 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0963  ApaG  50.79 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0736  ApaG  49.58 
 
 		 123 aa  134  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2359  ApaG domain protein  50.39 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.000000000770969 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2738  apaG protein  50.39 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0878  ApaG  52.1 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0304  ApaG  54.78 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0380419  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3175  ApaG  50.82 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1013  ApaG  46.03 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156243  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3468  ApaG  52.46 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001666  ApaG protein  52.1 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3020  ApaG  50.82 
 
 		 137 aa  130  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.737478  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00054  hypothetical protein  49.21 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3549  ApaG domain protein  49.21 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0098  ApaG  50 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3605  ApaG  49.21 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118033 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0093  ApaG  50 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.574173 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0100  ApaG  50 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.819852  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0054  ApaG  49.21 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.496379 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0095  ApaG  50 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0056  ApaG  49.21 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0915002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0044  ApaG  49.21 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.271562  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00053  hypothetical protein  49.21 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.456951  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0056  ApaG  49.21 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0054  ApaG  49.21 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00391573  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0094  ApaG  50 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.237472  normal  0.301698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3661  ApaG  51.3 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0562  ApaG  46.83 
 
 		 125 aa  128  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0599  ApaG  48.41 
 
 		 125 aa  127  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4031  ApaG  50.42 
 
 		 125 aa  126  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00953692  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0317  ApaG  53.04 
 
 		 141 aa  127  8.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6540  ApaG  51.3 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.560513 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00807  ApaG  49.58 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0437  ApaG  50 
 
 		 136 aa  125  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2860  ApaG  49.58 
 
 		 126 aa  124  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00242464  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3833  ApaG  45.24 
 
 		 125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0493  ApaG  50.86 
 
 		 131 aa  124  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0601  ApaG  46.03 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4173  ApaG  50.42 
 
 		 125 aa  123  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2889  ApaG  48.8 
 
 		 126 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.203189  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7451  ApaG  51.3 
 
 		 130 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>