171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3934 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  289  9e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  78.87 
 
 		 142 aa  231  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  73.94 
 
 		 141 aa  221  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  73.94 
 
 		 141 aa  220  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  73.94 
 
 		 141 aa  219  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  73.24 
 
 		 141 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  75.35 
 
 		 142 aa  214  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  74.65 
 
 		 142 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  78.01 
 
 		 140 aa  206  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  76.06 
 
 		 142 aa  206  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  77.3 
 
 		 140 aa  206  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  65.47 
 
 		 140 aa  196  7e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  59.86 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  60.43 
 
 		 139 aa  167  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  61.59 
 
 		 144 aa  166  9e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  60.87 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  57.97 
 
 		 168 aa  164  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  63.12 
 
 		 140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  56.2 
 
 		 141 aa  161  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2188  hypothetical protein  60.87 
 
 		 144 aa  153  9e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.110489  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  61.87 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  61.15 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2569  hypothetical protein  55.71 
 
 		 140 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.83321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2979  hypothetical protein  55.71 
 
 		 140 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  56.1 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0398  hypothetical protein  59.84 
 
 		 172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.904592 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2740  hypothetical protein  54.29 
 
 		 140 aa  144  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  57.14 
 
 		 140 aa  143  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  59.71 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0112  hypothetical membrane spanning protein  56.93 
 
 		 139 aa  141  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2084  hypothetical protein  56.2 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  48.23 
 
 		 143 aa  137  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  48.59 
 
 		 146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  47.55 
 
 		 141 aa  134  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  49.65 
 
 		 148 aa  133  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3722  hypothetical protein  56.2 
 
 		 136 aa  133  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2969  hypothetical protein  57.14 
 
 		 140 aa  133  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2830  hypothetical protein  58.57 
 
 		 140 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179032  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3744  hypothetical protein  49.3 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2584  hypothetical protein  50 
 
 		 140 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  hitchhiker  0.00000000000477128 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  46.81 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0625  hypothetical protein  48.95 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0175  hypothetical protein  48.25 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0658  hypothetical protein  48.25 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431582  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2728  hypothetical protein  49.65 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3376  hypothetical protein  51.08 
 
 		 138 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0317356  hitchhiker  0.000000000730541 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0579  hypothetical protein  48.95 
 
 		 140 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0553  hypothetical protein  47.55 
 
 		 140 aa  129  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  47.55 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0580  hypothetical protein  50.36 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  43.66 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  46.48 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  44.37 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  47.89 
 
 		 178 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  44.37 
 
 		 143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  47.55 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  45.45 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  45.45 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3301  hypothetical protein  50 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0835749  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  48.25 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  42.25 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1215  hypothetical protein  50.35 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0246  hypothetical protein  47.89 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0366  hypothetical protein  50.7 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1225  hypothetical protein  50.7 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2449  hypothetical protein  50.7 
 
 		 140 aa  120  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.906177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3446  hypothetical protein  50.7 
 
 		 140 aa  120  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2425  transmembrane protein  51.43 
 
 		 137 aa  120  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3411  hypothetical protein  51.08 
 
 		 138 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3446  hypothetical protein  51.08 
 
 		 138 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.600198  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2636  hypothetical protein  51.08 
 
 		 138 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  44.29 
 
 		 141 aa  120  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  44.37 
 
 		 177 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  46.1 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0328  hypothetical protein  52.82 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038975 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3452  UPF0093 membrane protein  43.06 
 
 		 145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4233  hypothetical protein  49.32 
 
 		 146 aa  116  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225935 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3804  hypothetical protein  50.7 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000216317  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1468  hypothetical protein  42.47 
 
 		 187 aa  116  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200067  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  49.3 
 
 		 178 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  44.68 
 
 		 178 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  43.84 
 
 		 194 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  45.71 
 
 		 149 aa  113  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  46.48 
 
 		 142 aa  113  7.999999999999999e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0381  hypothetical protein  45.39 
 
 		 142 aa  113  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905108  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  43.88 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0281  hypothetical protein  48.92 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.440714  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  42.55 
 
 		 178 aa  111  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0307  putative transmembrane protein  46.81 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  39.01 
 
 		 139 aa  110  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  42.55 
 
 		 178 aa  110  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0258  hypothetical protein  42.36 
 
 		 141 aa  110  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0849  hypothetical protein  43.51 
 
 		 203 aa  110  8.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0214356 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0236  hypothetical protein  42.45 
 
 		 141 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1565  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0093 domain protein)  42.55 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4925  hypothetical protein  52.11 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000715814  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0193  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2669  hypothetical protein  44.68 
 
 		 165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00312015  normal  0.333956 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4270  hypothetical protein  43.61 
 
 		 197 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>