22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3924 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_3924  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
225 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0818  hypothetical protein  56.65 
 
 
234 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349242  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08640  hypothetical protein  57.51 
 
 
234 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000854998  hitchhiker  0.000197864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06070  hypothetical protein  54.74 
 
 
144 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0917  hypothetical protein  37.43 
 
 
223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000260853  hitchhiker  0.00000167824 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0612  hypothetical protein  50 
 
 
142 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.653535  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4562  hypothetical protein  48.31 
 
 
142 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00149977  normal  0.65254 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2401  sporulation domain-containing protein  30.39 
 
 
221 aa  92.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5094  hypothetical protein  45.31 
 
 
146 aa  92  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000148168  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0469  hypothetical protein  52.63 
 
 
141 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.101572  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0472  hypothetical protein  43.33 
 
 
141 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000830985  normal  0.0146685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0439  hypothetical protein  51.58 
 
 
154 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000459183  unclonable  0.000000225098 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4764  hypothetical protein  43.33 
 
 
141 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000255391  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2079  hypothetical protein  30.34 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.664672  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2631  hypothetical protein  31.68 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0075  hypothetical protein  28.15 
 
 
264 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0704  hypothetical protein  31.03 
 
 
214 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000345617  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1779  hypothetical protein  22.17 
 
 
237 aa  50.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0715873  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4290  sporulation domain-containing protein  24.21 
 
 
234 aa  49.7  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000142012  hitchhiker  0.00000290664 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0310  putative signal peptide protein  25.56 
 
 
272 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0235  Sporulation domain protein  28.7 
 
 
282 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3710  hypothetical protein  25.98 
 
 
242 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297977 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>