40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3879 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3879  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 		 422 aa  860    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28380  Zinc carboxypeptidase  28.11 
 
 		 425 aa  111  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1583  hypothetical protein  24.21 
 
 		 452 aa  90.9  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0370379 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.19 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  37.38 
 
 		 599 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  46.58 
 
 		 615 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.29 
 
 		 497 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.96 
 
 		 585 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.61 
 
 		 606 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.61 
 
 		 606 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.61 
 
 		 618 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  35.16 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  43.28 
 
 		 506 aa  57  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  37.5 
 
 		 351 aa  55.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  32.26 
 
 		 490 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.51 
 
 		 557 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.97 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1725  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.39 
 
 		 355 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.22 
 
 		 559 aa  50.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.46 
 
 		 609 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  38.57 
 
 		 631 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10433  hypothetical protein  33.98 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.968158  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.2 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  31.5 
 
 		 885 aa  47.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0161  carboxypeptidase  29.63 
 
 		 610 aa  47.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02290  hypothetical protein  25.45 
 
 		 261 aa  47.4  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1376  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.09 
 
 		 384 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3179  zinc carboxypeptidase  33.33 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129073  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.81 
 
 		 619 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.61 
 
 		 439 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.53 
 
 		 634 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.25 
 
 		 262 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.03 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24600  putative carboxypeptidase  26.12 
 
 		 634 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.95 
 
 		 684 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3658  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.32 
 
 		 483 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4289  hypothetical protein  32.73 
 
 		 340 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.27 
 
 		 683 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2692  zinc carboxypeptidase family protein  30.86 
 
 		 429 aa  43.1  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0016795  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  25 
 
 		 658 aa  43.1  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.666966 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>