55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3811 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0551  MORN domain-containing protein  60.51 
 
 		 642 aa  646    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0603  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  60.81 
 
 		 577 aa  697    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0596  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  59.75 
 
 		 577 aa  645    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0772523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1093  hypothetical protein  59.33 
 
 		 579 aa  658    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0590  MORN repeat-containing protein  60.51 
 
 		 603 aa  645    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3811  MORN repeat-containing protein  100 
 
 		 577 aa  1162    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11900  hypothetical protein  59.86 
 
 		 579 aa  660    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.55763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4983  hypothetical protein  61.66 
 
 		 575 aa  697    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291511  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0733  MORN repeat family protein  59.16 
 
 		 575 aa  633  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0236191  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0634  MORN motif-containing protein  58.97 
 
 		 575 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2722  Peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  42.55 
 
 		 500 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1518  Peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  43.83 
 
 		 500 aa  178  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00370729 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0600  MORN repeat-containing protein  34.07 
 
 		 468 aa  159  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3087  MORN repeat-containing protein  35.45 
 
 		 350 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1718  hypothetical protein  40.43 
 
 		 466 aa  157  7e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3034  MORN repeat-containing protein  35.69 
 
 		 350 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1997  hypothetical protein  39.83 
 
 		 493 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2279  hypothetical protein  35.74 
 
 		 500 aa  154  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.416244 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0516  hypothetical protein  40 
 
 		 454 aa  153  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0943  hypothetical protein  40.77 
 
 		 519 aa  150  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2332  hypothetical protein  36.8 
 
 		 501 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1007  MORN repeat-containing protein  36.8 
 
 		 501 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00845  hypothetical protein  37.95 
 
 		 361 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210026  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06082  hypothetical protein  37.95 
 
 		 361 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625789  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1594  MORN repeat-containing protein  36.06 
 
 		 500 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3345  MORN motif-containing protein  32.04 
 
 		 507 aa  145  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2389  MORN repeat-containing protein  31.79 
 
 		 352 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1887  PEGA domain-containing protein  37.45 
 
 		 461 aa  139  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0854  MORN repeat-containing protein  35.69 
 
 		 488 aa  137  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7222  hypothetical protein  35.61 
 
 		 514 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0191551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0849  MORN repeat-containing protein  33.33 
 
 		 538 aa  120  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.10958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3530  MORN repeat-containing protein  39.67 
 
 		 202 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  0.364919 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34720  predicted protein  28.57 
 
 		 576 aa  110  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19094  predicted protein  35.27 
 
 		 226 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.762529  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7823  Peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  36.76 
 
 		 271 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10974  predicted protein  32.94 
 
 		 312 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_850  predicted protein  28.05 
 
 		 662 aa  99  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.433034 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10093  predicted protein  32.64 
 
 		 315 aa  94.7  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0975626  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3361  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  36.16 
 
 		 265 aa  91.7  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1013  MORN motif-containing protein  32.24 
 
 		 245 aa  83.2  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0633058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0654  phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase  32.24 
 
 		 167 aa  82.8  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.21704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2559  MORN repeat-containing protein  31.69 
 
 		 216 aa  82  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10781  predicted protein  30.29 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11352  predicted protein  29 
 
 		 211 aa  75.1  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0412501  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2278  hypothetical protein  33 
 
 		 212 aa  71.6  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30154  predicted protein  31.03 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.82692  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0297  MORN repeat-containing protein  29.06 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.424224  normal  0.101065 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0051  MORN motif-containing protein  36.36 
 
 		 126 aa  57.4  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000239093  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6615  MORN repeat-containing protein  35.92 
 
 		 356 aa  57  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1911  hypothetical protein  34.48 
 
 		 136 aa  56.2  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_944  predicted protein  30.84 
 
 		 107 aa  53.9  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0602  hypothetical protein  29.51 
 
 		 385 aa  51.2  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08074  MATH and UCH domain protein, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_5G01750)  30.59 
 
 		 1319 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.499613 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_95034  predicted protein  30.53 
 
 		 505 aa  48.5  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.234943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0751  hypothetical protein  28.79 
 
 		 407 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.914209  normal  0.0303897 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>