More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3800 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  100 
 
 
122 aa  246  7e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  74.36 
 
 
118 aa  190  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  74.36 
 
 
118 aa  190  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  74.36 
 
 
117 aa  183  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  59.02 
 
 
128 aa  160  4e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  56.35 
 
 
140 aa  154  5e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  58.12 
 
 
139 aa  151  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  58.12 
 
 
139 aa  151  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  58.12 
 
 
158 aa  151  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  56.2 
 
 
164 aa  147  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  57.26 
 
 
123 aa  147  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  58.88 
 
 
116 aa  134  3e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  5.27491e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  49.14 
 
 
130 aa  124  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  54.81 
 
 
123 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  53.1 
 
 
119 aa  121  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  50.48 
 
 
115 aa  120  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2440  Iojap-related protein  51.3 
 
 
117 aa  119  1e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  54.95 
 
 
121 aa  119  1e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  47.86 
 
 
123 aa  118  2e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  48.65 
 
 
114 aa  116  1e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.74363e-11  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1332  hypothetical protein  50 
 
 
112 aa  115  2e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3821  iojap-like protein  53.15 
 
 
115 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  50 
 
 
112 aa  114  4e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  47.62 
 
 
108 aa  113  8e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  6.97602e-10  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  50.46 
 
 
158 aa  112  2e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  45.19 
 
 
109 aa  112  2e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  1.12346e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  49.04 
 
 
109 aa  112  2e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  8.6194e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2274  iojap-like protein  56.73 
 
 
125 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.547969  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  47.62 
 
 
148 aa  111  4e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  47.12 
 
 
109 aa  110  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0666  iojap family protein  42.98 
 
 
116 aa  109  1e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  2.49784e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1511  iojap protein family  42.98 
 
 
116 aa  109  1e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  2.52813e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  44.95 
 
 
114 aa  109  2e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.84153e-09  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  46.67 
 
 
148 aa  108  2e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  44.95 
 
 
114 aa  109  2e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.29081e-07  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  44.95 
 
 
114 aa  109  2e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  9.71305e-10  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  45.19 
 
 
109 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.12761e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  45.19 
 
 
109 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.43508e-10  hitchhiker  4.78913e-10 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1137  iojap-like protein  48.57 
 
 
108 aa  107  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000812131  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  43.12 
 
 
114 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  3.16802e-08  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2908  iojap-like protein  43.2 
 
 
137 aa  107  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  43.12 
 
 
114 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.32969e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1717  iojap-related protein  46.15 
 
 
106 aa  107  7e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2949  iojap-related protein  51.35 
 
 
118 aa  107  8e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2562  iojap-like protein  51.35 
 
 
118 aa  107  8e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.989694 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  43.12 
 
 
120 aa  107  8e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0980  iojap-like protein  49.04 
 
 
149 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276771  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1686  Iojap-related protein  48.08 
 
 
147 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2298  iojap-like protein  48.08 
 
 
147 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2321  iojap-like protein  48.08 
 
 
147 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.891424 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  44.76 
 
 
115 aa  104  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  4.5875e-09  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1011  iojap domain-containing protein  47.12 
 
 
154 aa  104  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  45.19 
 
 
109 aa  104  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  8.80611e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1227  iojap domain-containing protein  47.12 
 
 
154 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1071  iojap domain-containing protein  47.12 
 
 
154 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18972  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0796  iojap domain-containing protein  47.12 
 
 
154 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  40.35 
 
 
150 aa  103  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  6.75973e-07  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1381  iojap superfamily protein  47.12 
 
 
154 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.601287  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1058  iojap-like protein  42.2 
 
 
159 aa  104  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0354  iojap domain-containing protein  47.12 
 
 
154 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.623814  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1888  iojap domain-containing protein  47.12 
 
 
154 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.791339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1236  iojap domain-containing protein  47.12 
 
 
154 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.757129  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0987  hypothetical protein  41.35 
 
 
105 aa  103  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0701  iojap-like protein  44.23 
 
 
109 aa  103  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.19797e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2506  Iojap-related protein  43.52 
 
 
119 aa  103  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004220  hypothetical protein  44.23 
 
 
105 aa  103  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00071389  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1739  iojap-like protein  51.04 
 
 
173 aa  103  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  45.1 
 
 
164 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5625  Iojap-related protein  47.12 
 
 
148 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  45.19 
 
 
113 aa  102  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2215  iojap-like protein  47.12 
 
 
146 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2336  iojap-like protein  47.12 
 
 
146 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  45.19 
 
 
105 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  5.04193e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  47.22 
 
 
118 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  2.07265e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  42.31 
 
 
142 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13821  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  44.55 
 
 
122 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.116188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  100  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  43.27 
 
 
109 aa  100  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.76434e-08  unclonable  3.77675e-11 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  41.75 
 
 
143 aa  100  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  37.61 
 
 
135 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  42.31 
 
 
105 aa  100  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  42.16 
 
 
141 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  39.45 
 
 
156 aa  100  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1297  iojap-like protein  44.23 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605705  normal  0.0750793 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2194  hypothetical protein  48.08 
 
 
203 aa  99.4  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1094  hypothetical protein  40.38 
 
 
105 aa  99.8  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3263  Iojap-related protein  45.19 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.874451 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2962  hypothetical protein  41.35 
 
 
105 aa  99.8  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0475  hypothetical protein  40.38 
 
 
105 aa  98.6  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0369848  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  40.38 
 
 
105 aa  99  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  42.31 
 
 
109 aa  98.6  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  7.43073e-09  decreased coverage  2.04323e-07 
 
 
-
 
NC_004310  BR1841  iojap-related protein  42.11 
 
 
117 aa  98.6  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1562  iojap-like protein  45.19 
 
 
105 aa  99.4  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.985002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0689  hypothetical protein  40.38 
 
 
105 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.12038e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0663  hypothetical protein  40.38 
 
 
105 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  9.19857e-14  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00606  hypothetical protein  40.38 
 
 
105 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  6.79952e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00595  hypothetical protein  40.38 
 
 
105 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  4.76829e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0726  hypothetical protein  40.38 
 
 
105 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  5.27237e-08  normal  0.102561 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0614  hypothetical protein  40.38 
 
 
105 aa  98.2  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.11441e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0087  Iojap-related protein  48.51 
 
 
129 aa  98.2  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>