More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3783 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  74.11 
 
 		 505 aa  702    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  70.95 
 
 		 506 aa  726    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  70.95 
 
 		 506 aa  706    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  70.67 
 
 		 507 aa  727    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  73.72 
 
 		 505 aa  697    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1124  apolipoprotein N-acyltransferase  72.56 
 
 		 511 aa  657    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.693748  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0630  apolipoprotein N-acyltransferase  73.12 
 
 		 505 aa  678    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.112466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12280  apolipoprotein N-acyltransferase  71.77 
 
 		 511 aa  652    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  73.91 
 
 		 505 aa  701    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 		 507 aa  1001    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09030  apolipoprotein N-acyltransferase  73.47 
 
 		 516 aa  580  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36821  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  48.34 
 
 		 489 aa  409  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  45.07 
 
 		 514 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3304  apolipoprotein N-acyltransferase  41.59 
 
 		 521 aa  385  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  45.63 
 
 		 509 aa  362  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  43.23 
 
 		 512 aa  356  6.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  45.67 
 
 		 521 aa  355  1e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  42.74 
 
 		 523 aa  355  1e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111383 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  42.48 
 
 		 512 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  42.15 
 
 		 512 aa  352  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  42.15 
 
 		 512 aa  352  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  39.13 
 
 		 485 aa  351  2e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.285034  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  42.28 
 
 		 512 aa  351  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  42.15 
 
 		 512 aa  351  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  45.44 
 
 		 511 aa  350  3e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  42.08 
 
 		 512 aa  349  7e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  41.37 
 
 		 529 aa  348  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  41.37 
 
 		 529 aa  348  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  41.37 
 
 		 529 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  41.37 
 
 		 529 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  41.37 
 
 		 529 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  41.55 
 
 		 512 aa  347  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0678  apolipoprotein N-acyltransferase  38.72 
 
 		 485 aa  347  3e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  41.2 
 
 		 492 aa  341  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  40.95 
 
 		 506 aa  340  5e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2913  apolipoprotein N-acyltransferase  40.24 
 
 		 505 aa  339  5.9999999999999996e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  42.74 
 
 		 509 aa  338  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  42.72 
 
 		 537 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  41.22 
 
 		 509 aa  336  5.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  40.28 
 
 		 505 aa  334  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  40.95 
 
 		 509 aa  333  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  42.35 
 
 		 512 aa  333  5e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  42.48 
 
 		 508 aa  332  9e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  41.12 
 
 		 524 aa  331  2e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  42.13 
 
 		 516 aa  331  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  42.39 
 
 		 516 aa  330  4e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  40.78 
 
 		 501 aa  329  7e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  39.03 
 
 		 511 aa  329  8e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  40.99 
 
 		 522 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  40.32 
 
 		 524 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  41.67 
 
 		 519 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  40.54 
 
 		 518 aa  323  4e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  42.47 
 
 		 518 aa  322  7e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  40.27 
 
 		 515 aa  322  7e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  40.27 
 
 		 515 aa  322  7e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  40.27 
 
 		 515 aa  322  7e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  38.45 
 
 		 519 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  37.93 
 
 		 515 aa  320  5e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  40.41 
 
 		 520 aa  318  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  42.74 
 
 		 507 aa  316  7e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3576  apolipoprotein N-acyltransferase  38.48 
 
 		 532 aa  313  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0811  apolipoprotein N-acyltransferase  39.02 
 
 		 541 aa  311  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  43.06 
 
 		 479 aa  311  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02234  apolipoprotein N-acyltransferase  39.1 
 
 		 504 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21676  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3265  apolipoprotein N-acyltransferase  39.92 
 
 		 524 aa  309  8e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3443  apolipoprotein N-acyltransferase  39.68 
 
 		 524 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000768498 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2210  apolipoprotein N-acyltransferase  37.29 
 
 		 497 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1102  apolipoprotein N-acyltransferase  39.52 
 
 		 524 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000149878 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3307  apolipoprotein N-acyltransferase  39.52 
 
 		 524 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  37.65 
 
 		 506 aa  303  3.0000000000000004e-81  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  37.68 
 
 		 510 aa  302  1e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  42.46 
 
 		 505 aa  300  4e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  38.72 
 
 		 504 aa  296  4e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  40.08 
 
 		 500 aa  295  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2579  apolipoprotein N-acyltransferase  39.92 
 
 		 511 aa  294  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.170018 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  37.55 
 
 		 497 aa  294  3e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  40.53 
 
 		 520 aa  292  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0477  apolipoprotein N-acyltransferase  36.93 
 
 		 488 aa  291  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0889  apolipoprotein N-acyltransferase  40.65 
 
 		 510 aa  288  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.623273  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0869  apolipoprotein N-acyltransferase  43.18 
 
 		 509 aa  277  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1180  apolipoprotein N-acyltransferase  38.43 
 
 		 509 aa  277  3e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3531  apolipoprotein N-acyltransferase  41.21 
 
 		 487 aa  272  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  38.52 
 
 		 510 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  38.24 
 
 		 523 aa  266  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  36.76 
 
 		 503 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0510  apolipoprotein N-acyltransferase  40.12 
 
 		 524 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511831  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1302  hypothetical protein  31.71 
 
 		 511 aa  263  8e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1303  hypothetical protein  32.7 
 
 		 511 aa  262  1e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  36.34 
 
 		 503 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  34.48 
 
 		 524 aa  257  4e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2751  apolipoprotein N-acyltransferase  36.33 
 
 		 562 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444108  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2616  apolipoprotein N-acyltransferase  36.33 
 
 		 562 aa  246  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6026  apolipoprotein N-acyltransferase  35.93 
 
 		 562 aa  246  9e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  34.7 
 
 		 532 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000838838  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  35.88 
 
 		 500 aa  244  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2726  apolipoprotein N-acyltransferase  35.45 
 
 		 567 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0407  apolipoprotein N-acyltransferase  35.11 
 
 		 564 aa  243  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78277  normal  0.233372 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0625  apolipoprotein N-acyltransferase  36.24 
 
 		 567 aa  243  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1862  apolipoprotein N-acyltransferase  33.26 
 
 		 503 aa  236  9e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.480638  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3334  apolipoprotein N-acyltransferase  34.84 
 
 		 582 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.499479  normal  0.16189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>