92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3755 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3755  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 304 aa  619  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3249  crispr-associated protein Cas1  78.41 
 
 		 306 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3132  CRISPR-associated protein Cas1  77.74 
 
 		 306 aa  497  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3066  CRISPR-associated protein Cas1  78.07 
 
 		 306 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3057  CRISPR-associated Cas1 family protein  75.75 
 
 		 306 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2883  CRISPR-associated Cas1 family protein  76.08 
 
 		 307 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4008  CRISPR-associated protein Cas1  75.42 
 
 		 307 aa  489  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1392  CRISPR-associated Cas1 family protein  76.16 
 
 		 306 aa  484  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0403  CRISPR-associated protein Cas1  75.99 
 
 		 305 aa  485  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0402524  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0933  CRISPR-associated protein Cas1  76.41 
 
 		 305 aa  481  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0957  CRISPR-associated Cas1 family protein  76.41 
 
 		 305 aa  482  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2894  CRISPR-associated Cas1 family protein  76.41 
 
 		 305 aa  480  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3148  CRISPR-associated protein Cas1  75 
 
 		 305 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0964  CRISPR-associated Cas1 family protein  73.93 
 
 		 306 aa  475  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3092  crispr-associated protein Cas1  75 
 
 		 305 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00872  CRISPR-associated protein Cas1  72.43 
 
 		 306 aa  466  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1592  CRISPR-associated Cas1 family protein  72.33 
 
 		 305 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.328898 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3541  CRISPR-associated Cas1 family protein  70.86 
 
 		 307 aa  463  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.608984  normal  0.0531608 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2989  CRISPR-associated Cas1 family protein  72.76 
 
 		 309 aa  457  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.786147  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2830  CRISPR-associated Cas1 family protein  72.19 
 
 		 306 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2337  CRISPR-associated Cas1 family protein  73.2 
 
 		 307 aa  456  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00747033  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0599  CRISPR-associated Cas1 family protein  66.67 
 
 		 303 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000773136  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0835  CRISPR-associated Cas1 family protein  72.16 
 
 		 307 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3585  CRISPR-associated protein Cas1  75.42 
 
 		 307 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1602  CRISPR-associated protein Cas1  68.98 
 
 		 303 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.19087  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2474  CRISPR-associated protein Cas1  73.2 
 
 		 307 aa  448  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0232  CRISPR-associated Cas1 family protein  73.18 
 
 		 306 aa  443  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0928  CRISPR-associated protein Cas1  69.15 
 
 		 303 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0169  CRISPR-associated Cas1 family protein  65.36 
 
 		 313 aa  418  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1375  CRISPR-associated Cas1 family protein  66.89 
 
 		 299 aa  403  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00127759  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5409  CRISPR-associated protein Cas1  65.32 
 
 		 314 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.031752  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3320  CRISPR-associated Cas1 family protein  64.69 
 
 		 320 aa  388  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1808  CRISPR-associated Cas1 family protein  64.69 
 
 		 320 aa  388  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0422  CRISPR-associated protein Cas1  65.46 
 
 		 319 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0368078  normal  0.0376622 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0858  CRISPR-associated Cas1 family protein  70.2 
 
 		 255 aa  375  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1901  CRISPR-associated protein Cas1  43.49 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3013  CRISPR-associated protein Cas1  41.58 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00425226  decreased coverage  0.00852288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1236  CRISPR-associated protein Cas1  41.38 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00257289  normal  0.15537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4088  CRISPR-associated protein Cas1  39.5 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0463414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0645  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.65 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.354682  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2636  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.14 
 
 		 316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2444  CRISPR-associated protein Cas1  39.15 
 
 		 303 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68429 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0765  CRISPR-associated endonuclease Cas1, ECOLI subtype  40.38 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1977  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.75 
 
 		 320 aa  209  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3049  CRISPR-associated protein Cas1  40.44 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000891408  hitchhiker  0.000905677 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4348  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.02 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17300  CRISPR-associated protein, Cas1 family  39.71 
 
 		 342 aa  198  9e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0023  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.05 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0983  CRISPR-associated protein Cas1  35.74 
 
 		 314 aa  196  3e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2685  CRISPR-associated protein Cas1  35.02 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000995939  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2578  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.44 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0729404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1530  CRISPR-associated protein Cas1  36.62 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00231307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0930  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.19 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.264886  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0946  CRISPR-associated protein Cas1  38.46 
 
 		 324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.291315  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2164  CRISPR-associated protein Cas1  35.36 
 
 		 291 aa  180  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0192086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1413  CRISPR-associated protein Cas1  35.74 
 
 		 291 aa  180  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0233391  normal  0.0713718 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17190  CRISPR-associated protein, Cas1 family  36 
 
 		 328 aa  179  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.866435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3904  CRISPR-associated protein Cas1  32.25 
 
 		 323 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0906  CRISPR-associated protein Cas1  34.22 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16838  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2676  CRISPR-associated protein Cas1  33.71 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1286  CRISPR-associated protein Cas1  32.68 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3220  cas1: CRISPR-associated protein Cas1  37.69 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.615148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0486  CRISPR-associated protein Cas1  35.02 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0583925  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0949  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.82 
 
 		 298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0628062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1587  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.22 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0375026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0784  CRISPR-associated protein Cas1  38.13 
 
 		 294 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00721188  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2234  CRISPR-associated protein Cas1  36.27 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0784  CRISPR-associated protein Cas1  37.14 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0347  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.86 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2719  hypothetical protein  77.11 
 
 		 130 aa  136  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1942  hypothetical cytosolic protein  22.9 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2751  hypothetical protein  25 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00117385  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0489  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.89 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.121384 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0696  CRISPR-associated protein Cas1  23.1 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1819  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.36 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1209  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.28 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3377  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.82 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538903 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3659  CRISPR-associated protein Cas1  23.12 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208917  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3241  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.82 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0734  CRISPR-associated protein Cas1  22.47 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0052  hypothetical protein  22.33 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.553204  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2837  hypothetical protein  22.33 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1644  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.96 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0746674  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1535  CRISPR-associated protein Cas1  22.96 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1728  hypothetical protein  22.96 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00792911  hitchhiker  0.000413169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33350  hypothetical protein  21.78 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.142175 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1401  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.89 
 
 		 325 aa  53.9  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612871  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  25.75 
 
 		 325 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1460  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.66 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2447  CRISPR-associated protein Cas1  21.74 
 
 		 325 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.43322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  25.98 
 
 		 325 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1097  hypothetical cytosolic protein  27.08 
 
 		 279 aa  42.7  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>