More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3644 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3644  acetate kinase  100 
 
 		 394 aa  797    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53470  acetate kinase  78.43 
 
 		 394 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00330068  hitchhiker  0.00786734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4684  acetate kinase  78.43 
 
 		 394 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34560  acetate kinase  73.86 
 
 		 395 aa  607  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.576649  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41120  acetate kinase  70.63 
 
 		 399 aa  543  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0461537  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  57.81 
 
 		 395 aa  413  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  51.89 
 
 		 413 aa  410  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3099  acetate kinase  53.33 
 
 		 398 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.492017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0217  acetate kinase  54.5 
 
 		 410 aa  402  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  49.25 
 
 		 399 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  49.25 
 
 		 399 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0197  acetate kinase  53.73 
 
 		 410 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246535 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  49.25 
 
 		 399 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  49.25 
 
 		 399 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  50.75 
 
 		 398 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  49.63 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  49.25 
 
 		 399 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2897  acetate kinase  50.65 
 
 		 415 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  49.87 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  49 
 
 		 399 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  49 
 
 		 399 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  48.87 
 
 		 399 aa  391  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  49.25 
 
 		 399 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  50 
 
 		 399 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  49.37 
 
 		 398 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1669  acetate kinase  49.62 
 
 		 398 aa  388  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0184295  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3088  acetate kinase  50.39 
 
 		 425 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273293  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2983  acetate kinase  50.39 
 
 		 425 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.37833  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  48.11 
 
 		 400 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3176  acetate kinase  50.38 
 
 		 412 aa  381  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0994  acetate kinase  47.99 
 
 		 397 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  9.48202e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3910  acetate kinase  50.38 
 
 		 411 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0856  acetate kinase  51.37 
 
 		 409 aa  372  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00408014  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0616  acetate kinase  50.51 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.781931  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  53.51 
 
 		 401 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02238  acetate/propionate kinase  49.09 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1379  acetate kinase  55.41 
 
 		 408 aa  368  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0346  acetate kinase  50.13 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00657885  hitchhiker  0.00000356853 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3316  acetate kinase  50.13 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00011444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  47.36 
 
 		 404 aa  368  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0923  acetate kinase  46.73 
 
 		 421 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4098  propionate/acetate kinase  50.13 
 
 		 403 aa  364  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1385  acetate kinase  48.87 
 
 		 400 aa  363  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00164511  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2840  acetate kinase  47.85 
 
 		 400 aa  363  3e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1825  acetate kinase  48.61 
 
 		 400 aa  363  3e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1551  acetate kinase  48.61 
 
 		 400 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.099889  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1443  acetate kinase  48.61 
 
 		 400 aa  362  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001527  acetate kinase  47.24 
 
 		 397 aa  360  3e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02982  propionate kinase/acetate kinase C, anaerobic  49.74 
 
 		 406 aa  359  5e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0583  propionate/acetate kinase  49.74 
 
 		 402 aa  359  5e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02933  hypothetical protein  49.74 
 
 		 406 aa  359  5e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0588  acetate kinase  49.74 
 
 		 402 aa  359  6e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3303  propionate/acetate kinase  49.74 
 
 		 402 aa  359  6e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.307488  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3589  propionate/acetate kinase  49.74 
 
 		 402 aa  358  8e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02221  acetate kinase  47.59 
 
 		 400 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.177023  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1360  acetate kinase  47.59 
 
 		 400 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2590  acetate kinase  47.59 
 
 		 400 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0300293  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3436  acetate kinase  47.59 
 
 		 400 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.1925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02181  hypothetical protein  47.59 
 
 		 400 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154164  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2446  acetate kinase  47.59 
 
 		 400 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0138092  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2672  acetate kinase  47.59 
 
 		 400 aa  357  9.999999999999999e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.733134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1356  acetate kinase  47.59 
 
 		 400 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.446941  normal  0.180313 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0803  acetate kinase  47.36 
 
 		 398 aa  357  9.999999999999999e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102321  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2452  acetate kinase  47.59 
 
 		 400 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.691119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3242  propionate/acetate kinase  49.49 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2686  acetate kinase  47.85 
 
 		 400 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.888015 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2578  acetate kinase  47.85 
 
 		 400 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2566  acetate kinase  47.85 
 
 		 400 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2478  acetate kinase  47.85 
 
 		 400 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679526  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2523  acetate kinase  47.85 
 
 		 400 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.340235 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3411  propionate/acetate kinase  49.49 
 
 		 402 aa  356  5e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4428  propionate/acetate kinase  49.49 
 
 		 402 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0208256 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2559  acetate kinase  48.62 
 
 		 400 aa  355  6.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.139439  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0642  acetate kinase  51.41 
 
 		 449 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2112  acetate kinase  47.7 
 
 		 398 aa  353  2e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0121493  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2998  acetate kinase  51.55 
 
 		 405 aa  353  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2590  acetate kinase  45.38 
 
 		 398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.871913  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02942  acetate kinase  48.2 
 
 		 398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4009  acetate kinase  48.46 
 
 		 411 aa  352  5e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002968  acetate kinase  47.19 
 
 		 398 aa  350  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3537  propionate/acetate kinase  49.23 
 
 		 402 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.831906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3433  propionate/acetate kinase  49.23 
 
 		 402 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3430  propionate/acetate kinase  49.23 
 
 		 402 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3562  propionate/acetate kinase  47.09 
 
 		 402 aa  350  4e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3600  propionate/acetate kinase  48.97 
 
 		 402 aa  348  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  45.23 
 
 		 406 aa  348  1e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4051  acetate kinase  48.21 
 
 		 411 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3504  propionate/acetate kinase  48.46 
 
 		 402 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  43.32 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  45.48 
 
 		 403 aa  347  3e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  45.59 
 
 		 403 aa  345  5e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  45.98 
 
 		 399 aa  344  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  46.65 
 
 		 411 aa  343  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2760  acetate kinase  47.88 
 
 		 402 aa  343  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.819841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  45.57 
 
 		 397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1078  acetate kinase  51.03 
 
 		 414 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.458845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0833  acetate kinase  51.03 
 
 		 414 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528826  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2006  acetate kinase  51.03 
 
 		 414 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  44.06 
 
 		 402 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  43.58 
 
 		 401 aa  342  5.999999999999999e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>