245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3631 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  71.31 
 
 		 467 aa  648    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 		 467 aa  909    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  69.16 
 
 		 478 aa  630  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4514  sodium-dependent transporter, putative  69.16 
 
 		 467 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  53.38 
 
 		 470 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  52.4 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  52.94 
 
 		 452 aa  462  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  49.78 
 
 		 457 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  54.09 
 
 		 452 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  51.2 
 
 		 452 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  46.6 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  49.13 
 
 		 464 aa  423  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  46.58 
 
 		 450 aa  419  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  45.73 
 
 		 450 aa  413  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  48.69 
 
 		 446 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  47.91 
 
 		 486 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  47.1 
 
 		 466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  50.43 
 
 		 453 aa  403  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  47.53 
 
 		 452 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  46.06 
 
 		 461 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  47.48 
 
 		 486 aa  398  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  45.75 
 
 		 450 aa  388  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  50.11 
 
 		 455 aa  388  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  45.53 
 
 		 449 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  45.82 
 
 		 451 aa  373  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  46.82 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  46.27 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  43.26 
 
 		 454 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  45.5 
 
 		 446 aa  323  4e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  40.26 
 
 		 452 aa  319  7e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  43.5 
 
 		 459 aa  318  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  42.92 
 
 		 468 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0271  sodium/proline symporter  41.89 
 
 		 463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639807  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  41.94 
 
 		 453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  39.05 
 
 		 463 aa  302  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  38.44 
 
 		 453 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  39.29 
 
 		 453 aa  294  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  37.22 
 
 		 455 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  36.65 
 
 		 476 aa  281  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3971  sodium:neurotransmitter symporter  38.76 
 
 		 452 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.385097 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  42.05 
 
 		 475 aa  280  3e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  37.22 
 
 		 455 aa  279  6e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  38.58 
 
 		 456 aa  276  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  35.36 
 
 		 446 aa  276  5e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  35.6 
 
 		 446 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  35.38 
 
 		 446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  35.16 
 
 		 446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  35.38 
 
 		 446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  35.16 
 
 		 446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  34.95 
 
 		 446 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  37.36 
 
 		 450 aa  273  5.000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  35.38 
 
 		 446 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  35.16 
 
 		 446 aa  272  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  37.11 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  35.16 
 
 		 446 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  38.13 
 
 		 443 aa  268  2e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  34.51 
 
 		 446 aa  268  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  38.24 
 
 		 454 aa  266  4e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  37.89 
 
 		 465 aa  266  7e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  36.25 
 
 		 453 aa  266  8e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4776  sodium:neurotransmitter symporter  37.72 
 
 		 459 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0479599 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  38.91 
 
 		 449 aa  263  6e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  39.22 
 
 		 445 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  39.22 
 
 		 445 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  38.56 
 
 		 445 aa  259  6e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  38.56 
 
 		 445 aa  259  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  38.56 
 
 		 445 aa  259  6e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  38.56 
 
 		 445 aa  259  9e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  39.22 
 
 		 445 aa  259  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  38.34 
 
 		 445 aa  257  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  38.96 
 
 		 447 aa  256  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  37.94 
 
 		 444 aa  256  4e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  39.38 
 
 		 460 aa  256  9e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  33.26 
 
 		 446 aa  254  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  33.26 
 
 		 446 aa  254  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  38.16 
 
 		 445 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  39.05 
 
 		 447 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0092  sodium-dependent transporter, putative  33.98 
 
 		 442 aa  248  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  37.44 
 
 		 461 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  29.74 
 
 		 454 aa  249  1e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  40.66 
 
 		 448 aa  246  6.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3369  sodium:neurotransmitter symporter  35.18 
 
 		 528 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0936236  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  34.32 
 
 		 470 aa  245  9.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0958  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  37.58 
 
 		 448 aa  244  3e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  35.43 
 
 		 450 aa  243  5e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  36.84 
 
 		 452 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1151  sodium:neurotransmitter symporter  37.77 
 
 		 451 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0261986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  36.84 
 
 		 451 aa  242  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  36.48 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  36.7 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  36.48 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  35.07 
 
 		 484 aa  241  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  36.48 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  36.48 
 
 		 452 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  35.22 
 
 		 483 aa  237  3e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  37.17 
 
 		 455 aa  237  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  37.47 
 
 		 486 aa  237  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1484  putative sodium-dependent transporter  36.7 
 
 		 452 aa  237  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00118732  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  33.49 
 
 		 461 aa  237  3e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  35.78 
 
 		 469 aa  237  4e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>