More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3598 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  683    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  78.4 
 
 		 338 aa  546  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  77.22 
 
 		 338 aa  542  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  77.81 
 
 		 338 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  51.93 
 
 		 335 aa  344  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  51.75 
 
 		 363 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  53.78 
 
 		 353 aa  342  7e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  52.52 
 
 		 335 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  52.35 
 
 		 350 aa  339  5e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  53.1 
 
 		 335 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3595  hypothetical protein  50.89 
 
 		 335 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.222828  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  52.21 
 
 		 335 aa  335  7e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  52.21 
 
 		 335 aa  335  9e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  52.21 
 
 		 335 aa  335  9e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  51.48 
 
 		 380 aa  333  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  52.8 
 
 		 335 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  51.92 
 
 		 335 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  54.37 
 
 		 338 aa  322  5e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1912  hypothetical protein  53.33 
 
 		 321 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  32.81 
 
 		 305 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  33.02 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  34.71 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  35.71 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  30.98 
 
 		 302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  35.09 
 
 		 313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  34.97 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  31.98 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  31.18 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  33.53 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  34.26 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  32.42 
 
 		 305 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  34.98 
 
 		 303 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  31.75 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  32.12 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  32.12 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  38.98 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  33.75 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  30.77 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  31.82 
 
 		 305 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  33.23 
 
 		 303 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  30 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3313  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  30.57 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  30.65 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0619  hypothetical protein  29.56 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1661  hypothetical protein  32.47 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519453  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  31.23 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  31.23 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  27.76 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.28 
 
 		 807 aa  107  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  33.11 
 
 		 412 aa  106  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6906  Methyltransferase type 11  29.26 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  31.74 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  30.68 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3357  hypothetical protein  31.52 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416158  normal  0.98402 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  29.74 
 
 		 400 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  30.68 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2094  hypothetical protein  31.9 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  31.25 
 
 		 408 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  31.27 
 
 		 321 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  30.68 
 
 		 318 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11313  hypothetical protein  28.06 
 
 		 411 aa  102  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493787  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0772  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.5 
 
 		 776 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.829763 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  30.36 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0766  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.09 
 
 		 768 aa  100  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1454 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  31.4 
 
 		 402 aa  99.8  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4030  protein of unknown function Met10  28.53 
 
 		 552 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  28.97 
 
 		 393 aa  98.2  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2571  oxidoreductase  28.7 
 
 		 413 aa  97.4  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.207896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  30.77 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03498  oxidoreductase  27.42 
 
 		 364 aa  97.1  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.906105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  30 
 
 		 400 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1828  hypothetical protein  26.73 
 
 		 389 aa  96.7  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.929329  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2468  hypothetical protein  29.25 
 
 		 310 aa  96.7  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  27.33 
 
 		 396 aa  96.3  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  26.67 
 
 		 393 aa  96.3  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  25.88 
 
 		 309 aa  95.9  8e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  30 
 
 		 400 aa  95.9  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  27.89 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1761  oxidoreductase  26.73 
 
 		 389 aa  95.5  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  30.31 
 
 		 400 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  23.55 
 
 		 399 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  28.7 
 
 		 397 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  30.63 
 
 		 392 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0667  hypothetical protein  25.91 
 
 		 390 aa  94  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  23.24 
 
 		 399 aa  94  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1977  hypothetical protein  31.69 
 
 		 297 aa  94.4  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.257048  hitchhiker  0.000740302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  29.47 
 
 		 402 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  27.41 
 
 		 394 aa  93.6  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  25.8 
 
 		 393 aa  94  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  25.81 
 
 		 396 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  25.81 
 
 		 396 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  26.6 
 
 		 367 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  25.81 
 
 		 391 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  26.6 
 
 		 367 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  23.1 
 
 		 399 aa  92.4  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  27.97 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  32.11 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  23.24 
 
 		 399 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  23.24 
 
 		 399 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  23.24 
 
 		 399 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>