119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3582 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3582  NnrS family protein  100 
 
 		 391 aa  732    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.936992  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2849  NnrS family protein  55.35 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2840  NnrS family protein  55.87 
 
 		 393 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2940  NnrS family protein  55 
 
 		 393 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29660  hypothetical protein  61.71 
 
 		 397 aa  342  7e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2168  NnrS  54.12 
 
 		 384 aa  331  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2537  hypothetical protein  62.37 
 
 		 388 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2805  hypothetical protein  45.34 
 
 		 390 aa  250  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1680  NnrS family protein  41.86 
 
 		 390 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2876  NnrS family protein  40.21 
 
 		 406 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  hitchhiker  0.00000000207371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1665  NnrS family protein  41.34 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2677  NnrS family protein  41.09 
 
 		 390 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0244063 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2587  NnrS family protein  42.12 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16699  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1702  NnrS family protein  41.09 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.591488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2322  NnrS family protein  42.46 
 
 		 390 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000140024  normal  0.965133 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03874  Heme/copper membrane protein  38.71 
 
 		 400 aa  219  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0720  putative heme-Cu membrane protein (NnrS)  35.12 
 
 		 393 aa  210  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2425  NnrS family protein  43.56 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.194019  normal  0.204544 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2495  NnrS family protein  43.56 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3037  NnrS family protein  37.2 
 
 		 403 aa  206  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3473  NnrS  40.49 
 
 		 422 aa  206  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0687  NnrS family protein  36.5 
 
 		 403 aa  206  8e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2560  NnrS family protein  40.26 
 
 		 397 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12013  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0686  NnrS family protein  39.53 
 
 		 431 aa  203  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4283  hypothetical protein  38.2 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1288  hypothetical protein  42.93 
 
 		 389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0467877  normal  0.017488 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3603  NnrS family protein  38.05 
 
 		 403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.147714  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1409  hypothetical protein  41.82 
 
 		 424 aa  197  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.922088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0504  NnrS family protein  36.86 
 
 		 403 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03317  hypothetical protein  35.91 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2362  NnrS family protein  37.05 
 
 		 403 aa  194  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000703097  decreased coverage  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1227  NnrS family protein  36.83 
 
 		 403 aa  193  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25611  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1910  hypothetical protein  37.16 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002671  NnrS protein  36.54 
 
 		 394 aa  186  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2837  NnrS  35.05 
 
 		 403 aa  182  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0722604  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0849  putative ATP synthase F0, A subunit  35.31 
 
 		 428 aa  180  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2847  NnrS family protein  38.24 
 
 		 401 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2336  NnrS family protein  38.24 
 
 		 401 aa  179  7e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00114269  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2181  NnrS  37.82 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0614  hypothetical protein  39.6 
 
 		 406 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2398  hypothetical protein  39.6 
 
 		 398 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2891  hypothetical protein  39.6 
 
 		 398 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00927369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1711  hypothetical protein  39.6 
 
 		 398 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129457  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1798  hypothetical protein  39.49 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.425687  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4999  NnrS  41.24 
 
 		 405 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.441301  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0765  NnrS family protein  33.68 
 
 		 409 aa  172  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.960663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1410  NnrS-like protein  37.73 
 
 		 399 aa  170  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3970  NnrS family protein  38.81 
 
 		 398 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2759  hypothetical protein  40.51 
 
 		 398 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2821  Heme/copper membrane protein  40.25 
 
 		 398 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0283  hypothetical protein  37.34 
 
 		 413 aa  166  8e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0630  Heme/copper membrane protein of NnrS family protein  33.6 
 
 		 394 aa  166  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  38.31 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0102  hypothetical protein  35.44 
 
 		 418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.139814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2701  heme/copper membrane protein  40.25 
 
 		 398 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0227  NnrS family protein  39.75 
 
 		 390 aa  164  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2607  NnrS family protein  37.13 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0259  hypothetical protein  36.81 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2901  NnrS family protein  35.84 
 
 		 414 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6279  NnrS family protein  39.69 
 
 		 403 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  0.20499 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1884  NnrS  38.65 
 
 		 401 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0526931  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4727  NnrS  38.24 
 
 		 398 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0648  NnrS  40.54 
 
 		 393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86713  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1348  hypothetical protein  34.47 
 
 		 417 aa  153  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1006  NnrS family protein  40.55 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0307  NnrS family protein  35.93 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.799454  normal  0.0277833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5307  putative heme/copper membrane protein  34.87 
 
 		 401 aa  146  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0853882  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1475  NnrS family protein  38.7 
 
 		 399 aa  142  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1673  NnrS family protein  36.1 
 
 		 408 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496066  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6821  putative membrane protein, NnrS-like protein  33.87 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2105  NnrS family protein  34.45 
 
 		 392 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0196977  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3145  NnrS family protein  34.16 
 
 		 394 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0163982  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0967  NnrS family protein  35.89 
 
 		 397 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2874  NnrS  30.9 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1235  NnrS  34.22 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00575591  unclonable  0.0000000301222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3791  NnrS  34.85 
 
 		 409 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.527545  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1810  hypothetical protein  35.84 
 
 		 407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4230  NnrS family protein  37.43 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3182  NnrS family protein  32.94 
 
 		 396 aa  119  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3399  hypothetical protein  37.53 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3859  NnrS family protein  35.92 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4275  NnrS  32.82 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2159  NnrS family protein  36.99 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0400909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2303  hypothetical protein  33.51 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5672  NnrS family protein  34.92 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3288  NnrS family protein  38.44 
 
 		 404 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3610  NnrS family protein  36.88 
 
 		 404 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.84805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2741  hypothetical protein  35.17 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.300362  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0630  hypothetical protein  35.17 
 
 		 407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446034  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2382  hypothetical protein  35.17 
 
 		 407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.863987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2905  hypothetical protein  35.17 
 
 		 407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2683  hypothetical protein  35.17 
 
 		 407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2807  Heme/copper membrane protein  35.17 
 
 		 407 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.817552  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1119  NnrS  38.72 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2574  NnrS family protein  37.58 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00111099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1973  NnrS family protein  33.7 
 
 		 397 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1524  NnrS family protein  35.43 
 
 		 394 aa  106  8e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4037  NnrS  34.46 
 
 		 408 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0328  hypothetical protein  34.19 
 
 		 397 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1515  NnrS family protein  35.13 
 
 		 409 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329363  normal  0.0719715 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>