139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3575 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3575  globin  100 
 
 		 153 aa  313  6e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.425401 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1541  hypothetical protein  57.69 
 
 		 141 aa  154  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3906  globin  53.44 
 
 		 140 aa  140  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.22456 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3074  globin  49.22 
 
 		 138 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0236905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0068  globin  46.97 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0304952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1326  globin  44.26 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1800  globin family protein  48.42 
 
 		 128 aa  96.7  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0935  hypothetical protein  47.57 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0774  putative oxygen-binding protein (globin)  41.96 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3147  conserved hypothetical globin-like protein  46.88 
 
 		 129 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0120923  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1256  globin  37.27 
 
 		 137 aa  90.5  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.331075 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1917  globin  47.47 
 
 		 134 aa  90.5  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0899  globin  48.42 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1867  hypothetical protein  46.32 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1401  hypothetical protein  46.32 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1030  hypothetical protein  46.32 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2317  globin  46.32 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1095  hypothetical protein  46.32 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0772  hypothetical protein  46.32 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1253  hypothetical protein  46.32 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1261  hypothetical protein  46.32 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100755  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0378  hypothetical protein  46.32 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746099  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0999  globin  46.32 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0834187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2302  globin  46.32 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2195  globin  46.32 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2241  globin  47.47 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.694262 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2697  putative globin  40.32 
 
 		 136 aa  88.2  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1667  globin  46.32 
 
 		 136 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2279  globin  46.32 
 
 		 136 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1997  hypothetical protein  45.26 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.174841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5606  globin-like protein  45.26 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.62023  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3955  globin  46.23 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405628  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0031  globin  37.96 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0030771  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18050  globin-like protein  41.94 
 
 		 131 aa  85.5  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0868344  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1548  heme-binding protein, putative  38.4 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5057  globin  44.34 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1263  globin  38.4 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.932923 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0031  globin  37.62 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058274  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0051  globin  40.43 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.294967  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3728  globin  39.6 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  hitchhiker  0.00731261 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1355  globin  44.09 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0069  globin  46.81 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2049  globin  43.16 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.366529  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2090  putative oxygen-binding protein (globin)  44.44 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0039  globin  35.29 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1878  hypothetical protein  46.24 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0036  globin  36.13 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0572064  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4060  globin family  43.01 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2614  globin  47.19 
 
 		 133 aa  80.1  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.307504  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1464  putative globin  37.82 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3244  putative oxygen-binding protein, globin-like  43.16 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0034  globin  36.13 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0103941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0042  globin  38.61 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0182573  hitchhiker  0.000000860997 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1316  globin  42.11 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.129637 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0031  globin  40.43 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0800503  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0034  globin  37.5 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.674256  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0039  globin  37.62 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0038  globin  38.6 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0612769  unclonable  0.00000927103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3010  globin  37.1 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0038  globin  39.6 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000122438 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0046  globin  39.6 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0363016  normal  0.25879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0039  globin  39.6 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.372259  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5890  putative hemoglobin protein (truncated hemoglobin)  36.92 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3650  globin  36.94 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.260647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2330  globin  36.29 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3254  globin  34.62 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2346  globin  38.71 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0697  globin  38.68 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462727 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1767  globin  41.57 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3454  globin  40.43 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273084  normal  0.734777 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2781  globin  40.43 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3261  globin  35.48 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.4456 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0410  globin  32.56 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236118 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3444  hypothetical protein  33.06 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.237349  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0132  globin  34.27 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1200  globin  40.74 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2018  globin  39.36 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  36.36 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  31.67 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4036  globin  35.29 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0847  globin  38.95 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  30.83 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  30.83 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  30.83 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  30.83 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  30 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  30.83 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  30.83 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  30.83 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  30.83 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  30.83 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00030  putative hemoglobin-like oxygen-binding protein  33.67 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0488861  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  36.56 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0945  globin  37.11 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1573  globin  33.02 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.732575 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  35.48 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11540  truncated hemoglobin  33.64 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1001  globin  31.62 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.621706  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1020  globin  31.62 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0280188  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0582  hypothetical protein  28.7 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.709558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>