190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3574 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3574  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.458769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0459  TrkA-N domain protein  76.13 
 
 		 231 aa  356  1.9999999999999998e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.821137  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0214  TrkA-N  57.01 
 
 		 224 aa  266  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1513  TrkA-N domain-containing protein  56.36 
 
 		 224 aa  261  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  56.54 
 
 		 224 aa  258  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3145  TrkA-N domain protein  50 
 
 		 228 aa  230  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.436065 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3347  TrkA domain-containing protein  49.76 
 
 		 228 aa  228  6e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24350  K+ transport system, NAD-binding component  51.4 
 
 		 221 aa  224  6e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0398  TrkA-N  47.66 
 
 		 224 aa  222  4.9999999999999996e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  50.47 
 
 		 222 aa  220  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  47.69 
 
 		 224 aa  218  7e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  47.89 
 
 		 220 aa  215  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0443  TrkA domain-containing protein  49.29 
 
 		 222 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103493 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0505  TrkA-N domain protein  48.33 
 
 		 254 aa  209  4e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0590826 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06980  K+ transport system, NAD-binding component  46.98 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2303  putative cation transporter  46.92 
 
 		 222 aa  206  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18040  K+ transport system, NAD-binding component  48.57 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2747  TrkA-N domain protein  45.33 
 
 		 235 aa  205  6e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0359063  hitchhiker  0.0000719315 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0372  TrkA domain-containing protein  48.11 
 
 		 222 aa  204  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.849541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0428  TrkA-N domain protein  46.01 
 
 		 225 aa  204  9e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3270  TrkA-N domain protein  45.21 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.588488  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  44.98 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6144  TrkA-N  44.6 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674267  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  47.17 
 
 		 213 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4247  TrkA-N domain protein  44 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.61262 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24440  K+ transport system, NAD-binding component  41.51 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.800738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  40.58 
 
 		 221 aa  167  9e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  40.1 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  40.1 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  40.1 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  40.1 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  40.1 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  40.1 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  40.1 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  40.1 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  40.1 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  39.61 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  39.9 
 
 		 219 aa  165  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  38.21 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  38.21 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  40.1 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  40 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0796  Trk-type K+ transport systems membrane component  37.09 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  42.58 
 
 		 221 aa  158  6e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  41.63 
 
 		 217 aa  158  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  37.8 
 
 		 215 aa  156  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14840  K+ transport system, NAD-binding component  39.73 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.289305  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  37.14 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  37.14 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  35.27 
 
 		 217 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  36.71 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  36.23 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  35.71 
 
 		 220 aa  149  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  35.98 
 
 		 233 aa  148  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  33.17 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  35.85 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  35.32 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  34.11 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  33.81 
 
 		 217 aa  128  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000130553  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  35.71 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  34.91 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  35.71 
 
 		 222 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  35.58 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  31.58 
 
 		 233 aa  119  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  34.29 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0458  potassium uptake protein KtrA  31.19 
 
 		 220 aa  118  9e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  30.05 
 
 		 218 aa  118  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2828  TrkA-N domain protein  33.01 
 
 		 250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1557  TrkA domain-containing protein  28.96 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.176981  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0630  TrkA-N domain protein  34.83 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.208337  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  30.62 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0750  TrkA domain-containing protein  32.86 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.803573  normal  0.253071 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001288  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  31.66 
 
 		 217 aa  112  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.91889  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0012  TrkA-N domain protein  30.33 
 
 		 216 aa  112  6e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004055  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  30 
 
 		 220 aa  111  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248543  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4281  potassium uptake protein KtrA, putative  29.81 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  38.41 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1273  TrkA-N  32.38 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1463  TrkA-N domain protein  29.72 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00504118  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4480  TrkA domain-containing protein  30.62 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000127966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4804  TrkA-N  29.44 
 
 		 231 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0055  TrkA domain-containing protein  34.02 
 
 		 232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000827601 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0050  TrkA domain-containing protein  39.04 
 
 		 232 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0952  TrkA-N domain protein  32.83 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1476  potassium uptake protein TrkA, putative  29.67 
 
 		 216 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  28.78 
 
 		 218 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1301  potassium uptake protein TrkA, putative  29.67 
 
 		 216 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0439  putative potassium uptake protein TrkA  29.67 
 
 		 216 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01407  hypothetical protein  29.5 
 
 		 220 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4052  TrkA-N domain protein  28.71 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4091  TrkA-N domain protein  28.71 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0232188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  28.02 
 
 		 223 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0058  potassium uptake protein, putative  38.36 
 
 		 232 aa  106  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  30.19 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0047  TrkA domain-containing protein  37.67 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0050  TrkA domain-containing protein  37.67 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0058  TrkA domain-containing protein  37.67 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000170567 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2522  TrkA domain-containing protein  32.35 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000136868  normal  0.0316786 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0529  hypothetical protein  29.86 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0052  TrkA domain-containing protein  37.67 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000156349 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>