49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3367 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1104  hypothetical protein  84.47 
 
 		 425 aa  750    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1503  hypothetical protein  84.47 
 
 		 425 aa  750    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1313  hypothetical protein  84 
 
 		 425 aa  750    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1063  hypothetical protein  85.18 
 
 		 425 aa  759    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39360  hypothetical protein  81.21 
 
 		 431 aa  721    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189469  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4118  hypothetical protein  85.88 
 
 		 425 aa  760    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895185  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1499  hypothetical protein  84.47 
 
 		 442 aa  748    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.711606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1441  hypothetical protein  86.31 
 
 		 431 aa  765    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4223  hypothetical protein  83.88 
 
 		 442 aa  748    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.884963  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16580  hypothetical protein  86.08 
 
 		 431 aa  763    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3367  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  881    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00118926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0876  hypothetical protein  53.88 
 
 		 428 aa  461  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2261  hypothetical protein  46.89 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2232  hypothetical protein  46.65 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0650  hypothetical protein  43.78 
 
 		 451 aa  362  6e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0542  hypothetical protein  42.49 
 
 		 451 aa  353  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0984a  hypothetical membrane spanning protein  52.98 
 
 		 343 aa  353  5e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0539  hypothetical protein  42.49 
 
 		 451 aa  352  5e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3536  hypothetical protein  42.11 
 
 		 450 aa  351  2e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0499  hypothetical protein  42.02 
 
 		 451 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3332  hypothetical protein  41.78 
 
 		 451 aa  348  2e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3490  hypothetical protein  42.25 
 
 		 451 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0540  hypothetical protein  42.25 
 
 		 451 aa  348  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3951  hypothetical protein  42.02 
 
 		 451 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3769  protein of unknown function DUF1704  42.02 
 
 		 451 aa  345  6e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3825  hypothetical protein  41.78 
 
 		 451 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3165  hypothetical protein  41.16 
 
 		 451 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0751  hypothetical protein  37.65 
 
 		 437 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0149749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5980  protein of unknown function DUF1704  35.44 
 
 		 417 aa  226  7e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0709  hypothetical protein  34.38 
 
 		 438 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0702743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0746  protein of unknown function DUF1704  34.86 
 
 		 438 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.092281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0745  protein of unknown function DUF1704  34.62 
 
 		 438 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.135997  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3364  protein of unknown function DUF1704  32.13 
 
 		 417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3735  protein of unknown function DUF1704  31.07 
 
 		 428 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3787  protein of unknown function DUF1704  31.07 
 
 		 428 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02418  hypothetical protein  30.17 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004426  hypothetical protein  35.44 
 
 		 380 aa  104  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05130  hypothetical protein  27.56 
 
 		 396 aa  93.2  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0915  hypothetical protein  28.43 
 
 		 664 aa  92.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.699671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0176  hypothetical protein  27.36 
 
 		 656 aa  90.9  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3220  hypothetical protein  28.46 
 
 		 664 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2900  hypothetical protein  33.33 
 
 		 663 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0409869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0218  hypothetical protein  31.44 
 
 		 663 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3084  hypothetical protein  33.05 
 
 		 632 aa  81.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0605  protein of unknown function DUF1704  28.61 
 
 		 638 aa  80.5  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0130563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10998  hypothetical protein  27.82 
 
 		 386 aa  79.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0884877  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3670  hypothetical protein  30.29 
 
 		 672 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.732506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4906  hypothetical protein  27.65 
 
 		 627 aa  64.3  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.699143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0665  hypothetical protein  33.54 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>